Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  8  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
100
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2.7
25
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4
7
35
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
160
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20
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13
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0
3
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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20
24
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214
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1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2356606--2356658
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39
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0
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13
53
81
0
6
12
0.86
2357719--2357760
18
2.3
19
95
4
77
83
0
4
11
0.79
2359448--2359475
13
2.2
13
100
0
56
42
7
7
42
1.59
2369604--2369639
17
2.1
17
89
0
54
16
11
16
55
1.68
2373132--2373170
15
2.6
15
83
0
51
51
2
5
41
1.38
2375457--2375511
24
2.3
25
75
9
60
36
0
5
58
1.21
2375595--2375625
14
2.2
14
94
0
53
41
0
0
58
0.98
2387352--2387376
11
2.3
11
100
0
50
48
8
20
24
1.76
2388198--2388249
20
2.5
20
81
3
59
26
11
9
51
1.68
2397924--2397977
21
2.6
21
72
16
58
51
3
27
16
1.61
2399178--2399223
23
2.0
24
86
4
67
8
8
19
63
1.49
2401693--2401727
16
2.2
16
100
0
70
42
17
11
28
1.83
2405747--2405787
20
2.0
20
100
0
82
41
4
0
53
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2405967--2406716
374
2.0
376
99
0
1486
31
13
17
37
1.89
2408701--2409635
305
3.0
304
93
3
1547
24
11
19
43
1.85
2417390--2417431
10
4.2
10
79
11
50
9
0
4
85
0.72
2417395--2417423
13
2.1
14
93
6
51
6
0
3
89
0.57
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11
4.8
11
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10
56
64
1
0
33
1.04
2420142--2420182
21
2.0
21
85
0
55
56
4
0
39
1.21
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29
2.3
30
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7
75
31
17
1
49
1.56
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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56
2.0
56
100
0
226
21
17
23
38
1.94
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27
2.5
28
78
7
84
71
2
1
23
1.08
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19
2.0
20
84
5
51
21
5
10
63
1.46
2431789--2431837
20
2.4
21
76
13
57
16
4
14
65
1.42
2435283--2435322
18
2.3
18
91
4
64
27
15
5
52
1.63
2435840--2436497
328
2.0
328
100
0
1316
36
17
12
33
1.87
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19
3.7
19
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26
5
8
60
1.47
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20
3.6
20
73
15
78
26
5
6
61
1.43
2444087--2444168
40
2.0
40
100
0
164
25
4
9
59
1.49
2459818--2459862
22
2.0
23
91
4
74
44
0
0
55
0.99
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21
2.8
20
71
10
51
31
1
3
63
1.22
2463430--2463512
24
3.2
25
77
14
80
27
3
6
62
1.35
2465117--2465178
17
3.7
17
69
4
54
50
0
3
46
1.17
2465113--2465175
33
1.9
33
96
0
117
52
0
3
44
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2466900--2466941
14
2.9
14
80
20
50
45
0
2
52
1.13
2468153--2468188
3
12.0
3
87
0
54
30
2
2
63
1.22
2539236--2539268
13
2.4
14
90
10
59
0
6
6
87
0.65
2543659--2543713
12
4.6
12
78
13
60
65
0
5
29
1.15
2543659--2543713
3
18.3
3
75
20
53
65
0
5
29
1.15
2543659--2543721
21
3.0
21
86
11
85
65
0
4
30
1.13
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26
2.5
26
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1
1
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2.9
16
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0
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2
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0
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2
0
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12
9.0
12
68
19
61
34
3
0
60
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332