Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98090918--98091031
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98090918--98091031
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29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Indels
Score
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G
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.9
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121
32
26
4
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98232073--98232118
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10
72
20
51
49
1
1
47
1.23
98254067--98254291
10
23.9
9
68
22
76
57
5
1
34
1.33
98254155--98254206
22
2.5
21
87
6
70
55
5
0
38
1.24
98254705--98254789
30
2.8
30
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1
80
32
1
5
60
1.29
98254738--98254803
30
2.2
30
83
5
80
33
0
6
60
1.21
98255308--98255335
8
3.5
8
100
0
56
10
0
0
89
0.49
98268967--98269300
172
1.9
172
90
0
533
50
12
17
19
1.77
98272932--98272994
29
2.1
30
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23
4
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58
1.53
98274219--98274251
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17
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0
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0
0
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0.95
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0
0
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210
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1177
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7
11
38
1.70
98283556--98283605
23
2.1
24
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3
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34
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1.43
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138
2.5
138
89
2
505
42
15
21
20
1.89
98287909--98288215
46
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46
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0
470
41
15
22
20
1.90
98287909--98288263
92
3.8
93
87
6
433
42
15
21
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98294442--98294473
15
2.3
15
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40
18
0
40
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12
2.1
12
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0
50
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16
0
48
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21
3.1
21
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0
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38
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20
20
1.94
98296327--98296362
15
2.3
16
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4
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2
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0
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2
0
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1
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18
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5
0
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0
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67
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25
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66
1
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1.02
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16
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0
0
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0
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14
0
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0
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0
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1.17
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5.0
46
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14
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1.91
98326522--98326748
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89
2
332
22
23
14
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1.91
98330379--98330577
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2.5
80
88
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283
37
23
20
19
1.94
98330377--98330589
80
2.6
81
85
3
286
36
23
21
19
1.95
98330380--98330577
41
4.9
41
83
3
249
36
23
20
19
1.95
98338431--98338468
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1.9
20
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10
51
42
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21
1.88
98340368--98340512
46
3.2
46
96
0
263
35
14
25
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98342843--98342899
23
2.4
24
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59
0
0
40
0.97
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20
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66
0
0
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0.92
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0
0
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140
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138
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387
53
9
10
26
1.67
98348710--98348984
140
2.0
138
87
4
392
53
10
9
25
1.66
98350896--98350933
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2
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3.3
15
82
2
53
75
0
2
22
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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