Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  63  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18877978--18878004
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0
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2.0
196
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0
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1.17
18887743--18887894
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2.8
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23
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174
29
18
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1.97
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2.1
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28
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1.97
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17
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54
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9
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1.45
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2.3
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4.7
16
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2
22
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
6
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1.69
18926682--18926760
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2.0
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2.0
90
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2.0
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12
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2.0
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100
0
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18929621--18929800
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2.0
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20
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48
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190
24
27
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1.98
18947567--18947787
94
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2.0
21
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0
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12
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25
20
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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29
19
27
1.98
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19
26
1.98
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17.9
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16
20
29
1.94
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20
29
1.96
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20
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1.94
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12.7
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486
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20
30
1.94
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19
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22
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1.96
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1.97
19033961--19034169
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1.8
114
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18
26
33
1.96
19040542--19040848
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182
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20
29
22
1.99
19043135--19043174
16
2.5
16
91
0
62
37
12
17
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19043487--19043536
18
2.6
19
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59
56
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34
1.43
19051109--19051170
6
10.3
6
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6
72
75
3
4
16
1.10
19051101--19051159
18
3.3
18
81
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68
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1
8
15
1.13
19054040--19054101
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2.0
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15
23
1.92
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2.4
62
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4
154
27
8
30
33
1.86
19094023--19094077
27
2.0
27
85
0
74
21
25
3
49
1.66
19094065--19094149
43
2.0
42
88
6
127
22
24
0
52
1.47
19095278--19095315
16
2.2
18
86
9
53
0
21
0
78
0.74
19102132--19102323
102
1.9
103
86
3
280
32
9
6
51
1.60
19109447--19109647
88
2.3
90
93
4
356
36
15
15
31
1.90
19110959--19111163
100
2.0
101
99
0
403
32
16
6
43
1.74
19111522--19111552
16
1.9
16
93
0
53
64
0
0
35
0.94
19112467--19112537
22
3.0
23
81
8
72
53
1
2
42
1.24
19112757--19112789
13
2.4
14
85
5
50
42
0
0
57
0.98
19113384--19113412
11
2.7
11
94
5
51
27
6
0
65
1.18
19114638--19114699
30
2.1
30
100
0
124
37
6
9
46
1.62
19115804--19115839
16
2.2
16
100
0
72
25
0
36
38
1.56
19116056--19116097
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
19116065--19116106
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
19116282--19116334
24
2.2
24
83
6
63
58
1
0
39
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19116059--19116528
117
4.0
118
90
5
647
51
5
1
42
1.33
19116412--19116466
28
2.0
28
82
7
67
60
1
0
38
1.08
19120491--19120546
20
2.8
20
84
10
71
35
0
10
53
1.36
19121555--19121618
31
2.1
31
96
0
119
37
9
14
39
1.78
19122162--19122211
26
2.0
25
84
4
64
24
0
16
60
1.36
19124389--19124433
14
2.9
16
77
16
58
44
2
6
46
1.42
19124477--19124601
63
2.0
63
87
4
180
51
3
8
36
1.49
19130926--19131108
93
2.0
92
90
1
285
32
12
21
34
1.90
19137823--19137862
21
2.0
21
90
5
64
20
27
40
12
1.88
19147167--19147221
21
2.6
21
82
0
74
29
27
23
20
1.99
19147526--19147592
33
2.0
33
97
0
125
40
22
8
28
1.84
19150835--19151063
48
4.8
48
92
0
377
25
18
26
29
1.98
19153705--19153855
40
3.8
40
86
1
205
23
22
27
25
2.00
19153705--19153855
80
1.9
80
90
2
241
23
22
27
25
2.00
19161642--19161792
40
3.8
40
86
1
205
23
23
27
25
2.00
19161642--19161792
80
1.9
80
88
2
232
23
23
27
25
2.00
19165452--19165540
20
4.5
20
72
8
67
34
14
10
40
1.80
19165442--19165539
20
4.9
20
72
5
65
35
15
10
38
1.81
19165442--19165559
40
3.0
40
78
12
118
35
16
9
38
1.80
19165525--19165570
20
2.3
20
96
0
83
36
19
4
39
1.72
19165728--19165892
23
7.0
23
75
6
107
35
16
20
27
1.94
19165831--19165915
26
3.4
26
73
15
79
31
16
20
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19165811--19165938
49
2.6
49
91
0
193
34
15
20
29
1.94
19172170--19172230
6
10.2
6
76
13
63
62
0
1
36
1.05
19172190--19172248
30
2.0
30
83
6
75
54
1
3
40
1.27
19173154--19173189
11
3.2
11
96
4
63
25
0
47
27
1.52
19190370--19190688
47
6.7
47
91
1
494
28
29
8
32
1.87
19190615--19190689
25
3.1
25
67
18
68
32
28
6
33
1.83
19192652--19192676
13
1.9
13
100
0
50
36
16
16
32
1.90
19197018--19197097
29
2.8
28
77
9
90
27
15
31
26
1.95
19197476--19197500
11
2.3
11
100
0
50
36
28
8
28
1.85
19198960--19199077
42
2.8
42
83
3
139
30
22
17
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332