Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  13  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3752776--3752818
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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15
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3851523--3851715
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18
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2.1
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5
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2
2
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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10
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114
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1.99
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13
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0
168
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11
19
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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9
19
36
1.84
3976069--3976106
17
2.1
18
85
9
51
21
5
7
65
1.38
3980736--3980769
17
2.0
17
88
0
50
47
0
8
44
1.34
3996343--3996391
26
1.9
26
91
4
82
53
0
4
42
1.20
3996351--3996403
26
2.0
26
81
3
61
56
0
3
39
1.17
4003033--4003096
30
2.1
30
97
0
119
42
17
10
29
1.83
4004177--4004264
42
2.1
42
97
0
167
25
17
12
45
1.83
4004966--4005018
26
2.0
26
100
0
106
35
15
15
33
1.88
4007672--4007742
34
2.0
35
83
5
90
69
4
9
16
1.33
4007695--4007745
17
3.1
16
83
8
66
74
1
5
17
1.11
4008268--4008398
8
17.9
7
69
22
58
64
2
3
29
1.24
4008324--4008369
23
2.0
23
87
8
67
63
0
4
32
1.14
4010869--4011040
93
1.8
93
89
0
272
27
29
20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4010861--4011035
46
3.8
45
76
10
174
28
28
20
22
1.99
4013786--4013814
13
2.2
13
100
0
58
41
6
20
31
1.79
4014952--4015240
144
2.0
144
91
0
470
24
14
15
46
1.83
4016379--4016474
29
3.3
29
98
0
183
41
4
3
51
1.37
4019823--4019875
27
2.0
27
85
7
72
37
0
5
56
1.23
4019834--4019888
28
2.0
28
85
7
76
41
0
1
56
1.10
4021957--4021992
17
2.1
17
94
0
63
27
13
13
44
1.82
4022049--4022092
20
2.1
21
83
4
54
54
4
0
40
1.21
4022250--4022295
23
2.0
23
87
4
67
47
0
0
52
1.00
4030641--4030677
17
2.2
18
90
9
60
32
2
0
64
1.07
4046168--4046208
21
2.0
21
90
0
64
12
4
53
29
1.58
4046222--4046262
3
13.7
3
89
0
64
4
0
60
34
1.18
4048262--4048308
20
2.5
18
83
10
67
74
6
0
19
1.03
4048262--4048309
19
2.5
20
81
18
66
72
8
0
18
1.08
4049598--4049658
31
2.0
31
100
0
122
39
14
16
29
1.88
4060130--4060154
6
4.2
6
100
0
50
0
84
0
16
0.63
4060785--4060809
13
1.9
13
100
0
50
32
24
12
32
1.91
4068731--4068768
19
2.0
19
90
10
60
23
0
28
47
1.52
4070348--4070449
30
3.4
29
82
6
123
21
5
47
25
1.73
4072169--4072211
22
2.0
22
86
9
61
41
11
2
44
1.53
4074423--4074473
16
3.1
16
72
25
52
45
1
0
52
1.12
4075939--4075992
28
2.0
28
85
3
74
64
3
3
27
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4076056--4076103
20
2.4
21
82
10
64
68
6
2
22
1.23
4076094--4076131
18
2.2
18
85
4
51
71
2
0
26
1.00
4077559--4077591
17
1.9
17
93
0
57
33
24
9
33
1.87
4078829--4078879
22
2.3
23
89
3
77
25
0
1
72
0.95
4078828--4078874
8
6.0
8
82
5
60
29
0
2
68
1.02
4078829--4078879
23
2.3
23
89
3
77
25
0
1
72
0.95
4079479--4079542
7
9.0
7
75
3
56
46
26
3
23
1.67
4079476--4079526
15
3.5
15
78
5
59
47
29
1
21
1.62
4079470--4079543
36
2.1
35
85
7
96
45
28
4
21
1.70
4079767--4079852
40
2.1
41
86
2
120
20
19
19
39
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332