Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  103  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33362253--33362360
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6
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10
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1
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0
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2
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2.2
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428
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2.3
22
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23
1
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11
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4
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3
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26
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2.3
20
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1.01
33445995--33446041
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12
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6
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28
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19
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59
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100
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1.00
33456745--33456801
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1.00
33456745--33456812
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2
17
2
76
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33457712--33457752
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55
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70
1.28
33460934--33461030
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3.2
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53
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41
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33467474--33467528
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68
18
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74
1.04
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5
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15
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1.30
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19.2
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1.23
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2.4
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10
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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34
1.76
33520481--33520526
23
2.0
23
95
0
83
30
15
13
41
1.85
33524475--33524544
21
3.2
21
65
31
56
40
25
10
24
1.86
33529956--33530114
56
2.9
54
81
7
178
20
18
33
28
1.96
33536796--33536943
55
2.7
53
82
8
145
19
18
33
27
1.96
33538259--33538323
31
2.0
31
82
14
78
33
16
24
24
1.96
33540841--33540884
22
2.0
22
95
0
79
25
36
4
34
1.76
33543310--33543375
19
3.4
18
83
8
69
74
4
15
6
1.18
33547645--33547688
22
2.0
22
95
0
79
25
36
4
34
1.76
33548268--33548309
22
2.0
21
85
4
57
33
2
4
59
1.31
33552650--33552680
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
33552728--33552796
5
13.0
5
78
17
61
1
17
2
78
0.95
33552741--33552796
6
9.2
6
83
14
62
0
17
3
78
0.89
33552728--33552796
22
3.2
20
78
17
68
1
17
2
78
0.95
33552728--33552792
26
2.4
26
85
12
87
1
16
3
78
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33552728--33552796
21
3.2
22
82
10
81
1
17
2
78
0.95
33552728--33552807
27
3.0
25
78
14
72
1
17
3
77
0.98
33570683--33570729
20
2.3
20
81
0
58
29
34
12
23
1.92
33572437--33572476
19
2.1
19
85
0
53
25
32
17
25
1.97
33572573--33572606
12
2.8
12
83
16
52
50
2
5
41
1.42
33573730--33573773
14
3.1
14
83
0
52
15
40
2
40
1.60
33574582--33574628
20
2.3
20
81
0
58
29
34
12
23
1.92
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8
3.9
9
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14
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0
8
2
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48
2.2
47
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1
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1.45
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20
2.3
20
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0
67
29
36
12
21
1.91
33582611--33582704
12
7.6
12
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27
63
69
0
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11
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20
2.2
20
88
7
65
73
0
20
6
1.05
33582640--33582705
28
2.4
28
85
14
93
71
0
18
10
1.14
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17
5.0
17
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54
70
0
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10
1.14
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18
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0
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1.20
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1
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10
1.23
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1.9
33
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12
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55
6
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12
1.60
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30
3.2
30
77
2
106
28
26
15
28
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33593595--33593642
14
3.4
14
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0
60
18
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43
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2.5
13
100
0
66
81
6
0
12
0.85
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20
1.9
20
84
5
51
82
2
7
7
0.94
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20
2.2
20
84
3
56
65
0
26
8
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33602027--33602062
12
3.0
12
87
0
54
33
0
25
41
1.55
33609021--33609073
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
33612077--33612118
17
2.5
17
88
7
59
19
33
19
28
1.96
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20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
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21
2.0
22
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4
63
34
29
6
29
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2.6
11
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5
51
70
10
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13
1.34
33617151--33617183
12
2.7
13
86
13
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9
9
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1.36
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19
100
0
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0
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11
51
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8
5
13
1.24
33621601--33621676
25
3.2
25
78
10
72
80
2
13
3
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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