Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  55  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16144277--16144314
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1.9
20
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10
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26
18
26
1.98
16145939--16146084
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107
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18
26
1.98
16145928--16146087
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1.9
85
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0
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1.98
16151825--16152012
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4.4
42
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114
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19
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1.98
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2.0
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0
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21
28
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1.96
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20
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2.0
20
100
0
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20
20
30
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100
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1.94
16188264--16188488
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4.8
48
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11
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28
19
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45
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9
134
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21
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1.99
16197305--16197330
12
2.2
12
100
0
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7
23
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7
124
32
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16
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1.96
16205875--16205959
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16211131--16211182
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18
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5
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1
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3
0.82
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2.0
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9
114
24
15
31
28
1.96
16212203--16212349
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3.3
47
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19
123
30
14
23
31
1.95
16212177--16212741
87
6.4
87
74
10
405
29
14
25
30
1.95
16212351--16212829
44
10.9
43
72
12
289
30
14
26
29
1.95
16212273--16212809
176
3.1
175
90
1
815
29
14
25
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16212976--16213160
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4.2
44
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10
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30
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24
27
1.97
16212882--16213237
134
2.6
134
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1
480
32
17
23
26
1.97
16213243--16213372
44
2.9
45
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2
181
33
13
26
26
1.94
16213730--16213827
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5.2
19
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7
137
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16
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0
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0
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0
0
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120
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1
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5.2
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16
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2
42
1.33
16257319--16257360
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2.3
18
91
0
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21
28
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1.79
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2.0
21
90
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1.62
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2.2
54
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24
28
24
22
1.99
16261628--16261847
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4.7
47
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175
22
30
20
26
1.98
16261534--16261847
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3.3
94
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8
264
21
30
20
27
1.98
16266171--16266346
46
3.8
46
75
15
182
21
18
28
31
1.97
16266168--16266337
93
1.8
93
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0
277
21
18
28
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1.97
16271497--16271544
21
2.3
21
96
0
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14
37
25
22
1.92
16272389--16272751
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7.7
47
70
16
164
23
30
20
25
1.99
16272429--16272738
94
3.3
92
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304
24
30
20
24
1.99
16274574--16274612
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2.8
14
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0
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30
12
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126
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510
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16
38
1.91
16274937--16275025
34
2.8
32
78
9
101
46
14
2
37
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16275815--16275848
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11
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41
0
0
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0.98
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2.8
18
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0
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50
16
14
20
1.78
16278303--16278347
17
2.6
18
82
6
58
37
17
13
31
1.89
16279877--16280142
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6.7
40
91
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385
27
27
21
23
1.99
16282373--16282584
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5.3
40
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1
345
29
27
18
23
1.98
16282373--16282638
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3.3
81
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4
335
28
27
19
24
1.99
16282373--16282638
120
2.2
121
85
4
369
28
27
19
24
1.99
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9.0
6
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18
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0
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83
0
9
7
0.82
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10
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2
20
17
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1.51
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1.65
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26
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25
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16308636--16308859
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25
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16316617--16316841
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27
21
25
1.99
16316617--16316841
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2.8
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267
24
27
21
25
1.99
16316617--16316838
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120
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24
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21
26
1.99
16335430--16335555
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1.98
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25
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16346920--16347147
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0
332
19
20
27
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16351208--16351267
30
2.0
30
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38
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28
1.84
16351690--16351818
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47
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18
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1.97
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1.98
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30
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36
8
26
28
1.85
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21
19
29
29
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28
1.98
16365391--16365421
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2.2
14
94
0
53
51
12
16
19
1.76
16368046--16368313
40
6.7
40
89
0
376
19
18
28
33
1.96
16388822--16388846
2
12.5
2
100
0
50
0
0
48
52
1.00
16391266--16391291
8
3.2
8
100
0
52
34
11
26
26
1.91
16391820--16392490
68
9.9
68
89
0
898
26
22
22
27
1.99
16398131--16398173
19
2.2
20
87
4
61
27
18
6
46
1.75
16406302--16406970
68
9.8
68
90
2
952
26
23
23
27
2.00
16411142--16411191
24
2.2
23
82
7
57
34
4
34
28
1.76
16412610--16412742
47
2.8
47
85
7
173
24
28
17
29
1.97
16412616--16412857
126
1.9
126
82
6
303
22
28
17
31
1.97
16414404--16414441
19
1.9
20
84
10
51
28
15
2
52
1.56
16419592--16419616
13
1.9
13
100
0
50
20
32
40
8
1.81
16422272--16422432
55
2.9
55
85
1
198
24
35
21
19
1.96
16427931--16427956
4
6.5
4
100
0
52
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23
0
26
1.50
16433269--16433303
9
3.8
9
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7
52
0
31
0
68
0.90
16433370--16433437
34
2.0
34
83
11
86
36
5
1
55
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16433367--16433440
39
1.9
39
88
2
114
35
5
1
58
1.30
16435593--16435853
129
2.0
129
92
0
432
37
10
22
30
1.87
16442424--16442591
47
3.6
46
74
8
133
21
28
20
29
1.98
16442912--16442969
30
1.9
30
89
0
89
29
24
10
36
1.88
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47
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46
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12
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22
28
20
27
1.99
16449708--16450017
141
2.2
140
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7
369
22
29
20
27
1.99
16449708--16450018
94
3.3
93
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314
22
28
20
27
1.99
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0
400
33
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28
1.88
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2.1
37
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18
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25
1.98
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3.4
43
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1
274
22
14
35
27
1.93
16459508--16459581
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
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40
5.9
40
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5
228
25
22
27
24
2.00
16459971--16460126
79
2.0
80
88
1
233
26
22
26
24
2.00
16463465--16463718
47
5.4
47
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0
400
32
9
29
27
1.88
16463837--16463915
37
2.1
37
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4
115
25
18
30
25
1.98
16473830--16474013
92
2.0
92
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2
280
43
9
19
27
1.82
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14
2.4
14
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5
50
3
9
3
84
0.82
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3
14.0
3
84
0
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59
0
4
35
1.19
16480301--16480372
20
3.7
19
83
7
83
58
5
1
34
1.30
16480515--16480545
3
10.3
3
100
0
62
32
0
0
67
0.91
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39
2.5
37
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7
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27
29
22
20
1.98
16481940--16481980
3
14.0
3
84
5
57
63
2
0
34
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16482678--16482711
17
2.1
16
88
5
50
2
14
5
76
1.09
16482700--16482750
14
3.6
14
76
7
50
17
13
0
68
1.21
16482900--16482936
14
2.4
17
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13
53
51
0
0
48
1.00
16487865--16487907
21
2.0
21
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8
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23
20
4
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1.66
16488949--16489041
39
2.5
37
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7
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27
29
22
20
1.98
16489396--16489433
3
13.0
3
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2
0
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16490132--16490165
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2.1
16
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2
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1.09
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0
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1.21
16490353--16490389
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51
0
0
48
1.00
16490899--16490941
23
1.9
23
90
4
70
58
4
11
25
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332