Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A13 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  24  of  332  ( 39766 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6904945--6905015
37
1.9
37
100
0
142
43
14
8
33
1.75
6906427--6906472
22
2.2
22
85
11
62
50
6
0
43
1.28
6907554--6907631
40
2.0
40
82
10
97
38
8
3
48
1.53
6908004--6908038
12
3.0
12
87
8
54
82
0
17
0
0.66
6911190--6911234
21
2.2
20
85
11
65
15
13
15
55
1.69
6911195--6911236
21
2.0
21
100
0
84
14
14
19
52
1.75
6916058--6916126
31
2.2
32
80
10
81
49
21
8
20
1.76
6916672--6916722
6
8.5
6
88
0
75
19
1
11
66
1.33
6916750--6916784
18
1.9
18
88
0
52
22
8
11
57
1.61
6916742--6916826
30
2.8
29
79
10
82
24
8
14
52
1.68
6916936--6917139
64
3.2
64
92
0
318
24
12
16
46
1.82
6919144--6919247
40
2.6
40
93
0
172
22
8
21
48
1.77
6919919--6919965
21
2.2
21
88
0
67
36
36
17
10
1.84
6920451--6920487
18
2.1
18
89
0
56
35
2
29
32
1.72
6921258--6921310
3
18.0
3
84
3
63
0
39
0
60
0.97
6927245--6927287
21
2.0
21
90
0
68
30
18
27
23
1.98
6932279--6932359
25
3.3
24
73
14
67
61
8
0
29
1.25
6933027--6933082
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
6939996--6940090
31
3.0
32
75
3
84
49
8
6
35
1.59
6940619--6940649
9
3.6
9
91
8
55
9
9
0
80
0.90
6940620--6940649
8
3.6
8
95
4
51
10
10
0
80
0.92
6940620--6940677
17
3.4
16
79
13
62
8
10
3
77
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6940682--6940728
18
2.6
19
76
10
62
29
2
0
68
1.02
6940683--6940735
13
4.0
12
77
20
52
32
1
0
66
1.03
6940718--6940805
23
3.9
23
76
10
83
40
0
2
56
1.11
6940827--6940897
37
2.0
35
88
5
106
46
1
4
47
1.30
6940940--6940986
17
2.7
17
81
15
60
17
4
0
78
0.90
6941442--6941585
77
1.9
76
80
13
170
53
2
2
42
1.24
6941562--6941675
19
5.9
19
64
23
51
54
0
0
43
1.12
6941563--6941634
10
7.2
10
82
14
55
56
1
0
41
1.07
6941562--6941634
29
2.4
30
84
6
94
56
1
0
42
1.08
6941603--6941635
10
3.4
10
95
4
59
51
0
0
48
1.00
6945183--6945275
30
3.1
30
84
0
123
31
24
18
25
1.98
6946462--6946607
53
3.0
46
73
14
141
25
15
28
31
1.95
6946441--6946626
46
3.9
47
74
15
141
25
14
29
31
1.95
6950300--6950342
21
2.1
20
83
12
52
60
2
2
34
1.22
6950468--6950530
26
2.3
27
78
13
67
46
1
3
49
1.27
6950520--6950546
13
2.1
13
100
0
54
37
0
7
55
1.28
6950708--6950754
16
2.8
18
75
15
55
40
0
0
59
0.97
6951020--6951069
21
2.3
22
86
3
66
60
2
0
38
1.09
6951095--6951168
37
2.0
37
85
12
100
68
4
5
21
1.26
6951090--6951141
18
2.9
18
74
5
52
67
1
3
26
1.18
6951149--6951190
17
2.5
17
76
3
50
73
4
11
9
1.22
6951184--6951233
9
5.8
9
86
13
61
82
0
6
12
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6951185--6951214
8
3.8
8
100
0
60
80
0
10
10
0.92
6953940--6953979
21
1.9
21
84
0
53
45
32
7
15
1.74
6954015--6954065
14
3.6
14
89
0
66
47
25
0
27
1.53
6954021--6954065
7
6.4
7
81
0
54
48
24
0
26
1.51
6954101--6954204
55
1.9
55
82
4
129
46
25
3
24
1.70
6956118--6956168
11
4.8
10
80
7
57
39
21
7
31
1.82
6956118--6956171
21
2.5
22
82
14
76
38
20
9
31
1.84
6957762--6957815
28
1.9
28
84
0
72
51
25
1
20
1.57
6957772--6957816
13
3.3
13
79
11
54
51
28
2
17
1.58
6957727--6957887
76
2.1
76
79
10
168
50
24
2
21
1.61
6957936--6958010
7
10.7
7
72
13
57
53
28
0
18
1.45
6957973--6958028
21
2.7
22
86
8
73
55
23
0
21
1.44
6958396--6958449
7
7.9
7
73
19
51
42
31
0
25
1.55
6958391--6958449
21
2.8
21
85
10
77
44
32
0
23
1.54
6960118--6960166
24
2.0
24
100
0
98
51
0
16
32
1.45
6962195--6962263
16
3.9
16
72
20
50
33
0
26
40
1.56
6962418--6962524
28
4.0
28
84
9
143
18
3
31
45
1.67
6962422--6962524
51
1.9
56
86
11
153
18
3
33
44
1.68
6962422--6962538
23
4.6
23
83
14
126
16
4
34
45
1.67
6962750--6962801
21
2.5
21
70
0
59
13
26
28
30
1.94
6968443--6968494
10
4.9
10
76
19
52
21
0
1
76
0.87
6968443--6968499
11
5.3
11
81
10
55
19
0
3
77
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6971130--6971155
13
2.0
13
100
0
52
7
38
38
15
1.76
6975682--6975726
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76
6980350--6980403
28
1.9
28
88
0
81
38
18
3
38
1.69
6980564--6980623
18
3.3
18
83
0
75
33
11
13
41
1.80
6981773--6981931
27
5.9
27
82
11
184
33
22
24
19
1.97
6981791--6981934
54
2.7
54
94
2
245
34
23
24
18
1.96
6983531--6983638
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
6989962--6990015
28
1.9
28
88
0
81
38
18
3
38
1.69
6990192--6990241
18
2.8
18
87
0
73
32
12
14
42
1.82
6990359--6990463
51
2.1
49
82
8
124
38
21
20
19
1.94
6991597--6991635
15
2.6
14
84
11
51
28
2
0
69
1.02
6994424--6994482
27
2.1
28
81
3
66
23
5
3
67
1.26
7007360--7007408
6
8.0
6
79
4
53
34
14
14
36
1.86
7020288--7020324
6
6.2
6
87
0
56
32
16
16
35
1.91
7020875--7020943
30
2.3
30
97
0
129
21
44
18
14
1.85
7022855--7022880
12
2.2
12
100
0
52
73
0
7
19
1.07
7024611--7024696
21
4.4
20
67
12
54
19
3
51
25
1.63
7024611--7024696
39
2.2
39
87
0
118
19
3
51
25
1.63
7031023--7031056
15
2.2
15
89
5
50
79
2
11
5
1.02
7032499--7032551
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
7034039--7034122
26
3.2
26
96
0
150
35
23
5
34
1.80
7038641--7038729
30
3.0
29
83
5
79
39
2
6
51
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7038652--7038716
14
4.8
13
75
14
53
40
0
6
53
1.26
7038666--7038735
30
2.4
29
88
4
97
37
1
5
55
1.32
7038910--7038976
31
2.3
27
78
14
71
47
7
4
40
1.52
7039118--7039147
11
2.7
11
89
0
51
36
3
0
60
1.14
7041004--7041051
24
2.0
24
84
15
64
27
14
8
50
1.71
7045469--7045544
28
2.6
30
77
6
84
31
27
11
28
1.92
7047718--7047755
18
2.1
19
90
5
60
34
15
0
50
1.45
7047924--7048078
43
3.7
42
78
10
181
28
28
18
24
1.98
7053233--7053304
19
3.7
19
77
15
76
63
0
5
30
1.17
7053226--7053302
27
2.9
27
74
16
72
63
0
5
31
1.16
7073724--7073767
20
2.3
20
84
7
56
20
2
2
75
1.03
7073696--7073772
6
12.5
6
72
10
57
23
3
1
71
1.10
7073975--7074023
20
2.5
18
78
18
53
61
2
2
34
1.19
7074031--7074132
43
2.5
40
87
6
134
23
15
31
29
1.95
7086310--7086348
19
2.1
19
90
0
60
53
0
0
46
1.00
7086353--7086408
22
2.6
22
83
5
62
51
0
0
48
1.00
7088358--7088397
11
3.6
11
79
0
53
20
15
7
57
1.61
7088435--7088498
30
2.1
31
85
8
87
29
4
9
56
1.51
7088621--7088653
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
7089135--7089193
29
2.0
30
93
6
102
32
15
16
35
1.90
7089145--7089201
29
2.0
29
92
0
96
35
14
17
33
1.90
7102470--7102518
24
2.0
24
100
0
98
46
0
12
40
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7104574--7104627
22
2.5
21
84
3
63
12
29
37
20
1.90
7104889--7104924
13
2.8
13
91
4
56
41
0
19
38
1.52
7106616--7106644
14
2.0
15
93
6
51
37
0
20
41
1.53
7107220--7107265
23
2.0
23
100
0
92
52
13
4
30
1.59
7109951--7110004
19
2.8
19
83
8
56
62
1
0
35
1.06
7109999--7110038
10
4.2
10
79
20
50
80
0
2
17
0.83
7109996--7110058
26
2.3
27
81
5
74
74
1
1
22
0.99
7109997--7110057
18
3.4
18
81
0
68
75
1
1
21
0.98
7109999--7110057
9
6.4
9
76
18
59
76
1
1
20
0.96
7110023--7110103
19
4.3
18
75
7
72
64
3
6
25
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332