Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  206  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68511076--68511245
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1.8
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2.0
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1.8
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93
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22
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1.99
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0
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23
23
2.00
68524259--68524320
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2.2
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2.4
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1.18
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23
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24
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2.0
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100
0
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2.2
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0
0
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0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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2.0
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2.0
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20
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92
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21
1.98
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4.0
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20
107
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2.0
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0
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5
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30
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2.0
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20
29
29
1.98
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1.8
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2.2
15
100
0
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15
51
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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15
17
1.79
68661503--68661586
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2.3
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15
17
1.79
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110
51
16
15
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1.77
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54
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8
18
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1.80
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1.64
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0
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23
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
68675415--68675440
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0
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38
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10
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1.9
70
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171
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3
12
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1.60
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2.1
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100
0
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2.4
18
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7
52
55
6
0
37
1.27
68692428--68692469
18
2.4
17
84
7
57
73
0
9
16
1.08
68692696--68692728
15
2.1
16
88
5
50
72
3
0
24
0.98
68694378--68694500
45
2.8
44
76
4
95
28
20
19
31
1.97
68694508--68695149
45
14.0
44
69
15
288
28
20
17
34
1.95
68694515--68694827
89
3.5
88
72
10
233
29
19
16
34
1.94
68694503--68694823
134
2.4
134
87
1
473
29
18
16
35
1.93
68695013--68695149
47
3.1
42
74
10
121
28
18
16
35
1.93
68700159--68700254
44
2.2
41
81
15
106
35
27
14
22
1.93
68702943--68703014
21
3.7
20
74
12
51
36
22
25
16
1.94
68721623--68721664
21
2.0
21
86
4
59
66
4
7
21
1.35
68721703--68721755
17
3.4
15
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14
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69
1
5
22
1.19
68721703--68721756
14
3.5
14
80
14
54
70
1
5
22
1.18
68721836--68721865
14
2.1
14
93
0
51
73
3
0
23
0.98
68723338--68723397
28
2.1
28
84
3
75
10
10
20
60
1.57
68724566--68724625
31
1.9
31
89
0
93
28
3
8
60
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68724793--68724833
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2.2
18
91
4
64
14
0
9
75
1.04
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23
2.5
24
83
11
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39
0
14
46
1.44
68739910--68739965
23
2.4
24
81
3
69
25
21
19
33
1.97
68740146--68740236
20
4.6
20
79
2
85
35
10
17
36
1.85
68740140--68740246
40
2.7
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9
115
35
10
15
38
1.82
68742244--68742285
21
2.0
22
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4
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47
0
0
52
1.00
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3.0
12
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20
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53
0
0
46
1.00
68742298--68742331
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2.3
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0
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0
0
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0.98
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2.1
31
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0
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60
33
20
7
38
1.81
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2
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2
91
0
113
50
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1
1
1.19
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10
3.1
10
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9
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20
40
6
33
1.78
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2.0
36
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0
137
19
36
20
23
1.95
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36
4.6
36
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2
208
40
31
11
16
1.84
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17
2.4
18
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8
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46
14
0
39
1.45
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19
2.7
19
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0
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15
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1.92
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2.5
37
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7
103
29
16
13
40
1.86
68764091--68764141
13
3.7
14
79
12
61
58
3
9
27
1.47
68764122--68764190
34
2.0
34
97
0
129
53
7
11
27
1.63
68764130--68764193
18
3.7
18
70
17
64
54
6
10
28
1.59
68766126--68766163
19
2.0
19
89
0
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78
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5
7
1.07
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35
2.0
35
100
0
140
40
17
14
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68776422--68776582
43
3.7
43
90
0
259
23
19
28
27
1.99
68776980--68777025
15
2.8
16
87
12
58
0
52
17
30
1.45
68776959--68777016
18
3.2
18
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11
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1
48
20
29
1.60
68778993--68779235
114
2.1
115
86
7
336
37
22
12
26
1.90
68780114--68780146
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2.0
17
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59
12
0
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1.41
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3.4
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20
21
20
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2.2
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21
21
21
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2.2
82
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2
200
20
20
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125
21
19
18
40
1.92
68781422--68781463
19
2.2
19
91
0
66
40
2
7
50
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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