Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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24
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30
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23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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T
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114
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1
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1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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2
26
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93514096--93514143
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91
17
6
0
75
1.01
93550669--93550759
42
2.2
42
91
0
146
30
31
12
25
1.92
93550669--93550802
42
3.2
43
83
3
121
32
32
11
24
1.90
93551555--93551785
118
2.0
118
92
0
390
22
17
31
28
1.97
93551916--93551957
8
4.9
8
83
16
57
85
0
14
0
0.59
93551915--93551958
9
4.9
9
83
10
63
86
0
13
0
0.57
93554756--93555073
94
3.4
94
81
10
289
21
31
20
26
1.98
93554756--93555118
47
7.8
46
74
9
256
21
30
20
26
1.98
93554756--93555115
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3.9
93
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8
358
21
30
20
27
1.98
93554756--93555118
187
1.9
185
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7
430
21
30
20
26
1.98
93562240--93562470
48
4.8
49
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10
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21
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19
26
1.98
93562240--93562471
94
2.4
95
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4
299
21
31
19
26
1.98
93568301--93568342
17
2.5
17
100
0
84
19
21
26
33
1.97
93569629--93569896
47
5.7
46
75
14
176
20
28
21
28
1.98
93569627--93569895
94
2.9
94
81
7
287
21
28
21
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93578039--93578119
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2.1
38
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4
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12
14
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1.83
93578296--93578428
66
2.0
66
100
0
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18
18
33
1.94
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42
5.6
42
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3
287
45
16
20
18
1.86
93580827--93581061
21
11.3
21
77
2
188
45
16
20
18
1.86
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18
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17
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42
12
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30
1.83
93594772--93594815
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2.4
19
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0
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15
100
0
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0
0
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0
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0
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0
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28
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0
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0
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3
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1.74
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20
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15
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0
0
53
1.00
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2.1
26
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0
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27
3
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1.34
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0
0
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1.00
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2.7
29
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1.71
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0
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0
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0
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0
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1.25
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29
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28
70
24
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1
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30
1.28
93628979--93629067
10
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10
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17
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62
1
3
32
1.19
93628983--93629051
17
4.2
16
78
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68
62
0
4
33
1.15
93628979--93629076
40
2.3
42
81
10
112
64
1
3
31
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93628979--93629067
19
4.4
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19
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62
1
3
32
1.19
93628985--93629078
30
3.2
29
78
15
104
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1
3
31
1.17
93628983--93629080
15
6.5
15
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1
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1.17
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2
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13
4.5
13
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0
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0
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22
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2
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1.54
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21
1.9
22
85
5
57
19
12
21
46
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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