Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  2  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
453292--453323
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13
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0
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31
0
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4.7
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297
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1.99
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1.9
30
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0
89
41
3
24
31
1.71
460882--460913
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
461008--461249
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
461008--461257
100
2.4
103
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364
26
24
29
20
1.99
473297--473330
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2.1
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2.0
30
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3
82
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8
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2.0
16
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58
0
41
0
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12
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5
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36
0
0
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0.95
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6
4.5
6
100
0
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0
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1.43
517030--517083
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17
83
2
54
35
0
7
57
1.27
522873--522911
19
2.2
18
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9
53
58
7
0
33
1.26
522984--523021
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2.7
14
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12
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34
2
0
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1.09
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2.4
47
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543306--543332
6
4.5
6
100
0
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14
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2.1
88
98
1
353
45
7
18
28
1.76
545555--545587
17
2.0
17
88
5
50
69
9
3
18
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
545824--545909
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9
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20
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38
1
1
59
1.13
545826--545904
28
2.8
26
79
11
86
39
1
1
58
1.14
545821--545910
28
3.3
27
70
13
76
41
1
1
56
1.14
546014--546197
93
2.0
91
81
9
216
37
8
19
34
1.83
549598--549632
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2.1
17
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10
54
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0
0
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2.0
16
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0
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0
12
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2.5
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27
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100
0
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2.5
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98
0
354
28
6
24
40
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559109--559148
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2.0
21
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1.9
17
100
0
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42
0
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1.15
559151--559188
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2.2
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0
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2
2
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1.30
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17
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15
53
52
0
3
42
1.26
559238--559390
71
2.2
72
82
5
186
53
2
2
41
1.28
559331--559367
17
2.1
18
90
10
58
54
0
0
45
1.00
559279--559422
71
2.0
71
94
0
252
49
2
2
45
1.28
559391--559460
21
3.4
20
65
11
52
40
1
0
58
1.07
572199--572258
18
3.3
18
80
0
75
21
21
20
36
1.95
575388--575421
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2.2
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90
10
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23
23
26
2.00
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32
2.0
32
100
0
130
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119
4.2
119
92
0
821
32
16
19
32
1.94
587459--587667
83
2.5
83
89
1
321
34
16
19
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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32
4
2
60
1.30
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3.0
46
75
12
112
32
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2
61
1.27
589561--589705
19
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19
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21
61
32
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2
60
1.29
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2.0
21
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0
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0
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26
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30
24
22
1.99
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2.0
28
100
0
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17
32
25
25
1.97
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70
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8
270
22
30
24
23
1.99
598457--598663
106
2.0
106
96
0
378
22
30
25
21
1.99
601596--601643
23
2.1
22
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11
53
37
0
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54
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23
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22
76
14
64
60
4
2
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20
2.0
20
100
0
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36
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2.1
30
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6
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35
22
0
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1.54
612049--612142
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10
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21
52
3
15
8
72
1.22
612074--612163
22
4.3
21
71
16
71
5
15
10
68
1.35
612036--612182
61
2.4
61
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1
258
4
16
9
70
1.30
612203--612240
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12.7
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0
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0
0
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0
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0
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0
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15
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14
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11
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19
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20
11
0
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1.19
628667--628735
34
2.0
34
100
0
138
37
8
11
42
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
630987--631099
42
2.7
42
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0
172
28
25
15
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1.95
631028--631189
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3.6
47
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156
29
24
14
30
1.95
631211--631421
31
6.8
31
94
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26
21
27
2.00
631397--631573
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23
18
33
1.97
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1.9
93
93
0
301
28
29
20
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1.98
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3.7
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13
186
30
29
20
20
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18
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20
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10
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0
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46
16
6
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1.71
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2.2
43
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3
134
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15
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2.2
18
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1.63
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2.0
36
100
0
144
41
8
22
27
1.82
644634--644667
12
2.8
12
86
0
50
5
50
32
11
1.63
644813--644885
18
4.1
18
80
0
65
58
5
4
31
1.39
665650--665687
20
1.9
20
84
10
51
52
10
5
31
1.58
677272--677309
18
2.1
18
100
0
76
36
0
0
63
0.95
677435--677504
34
2.1
34
100
0
140
27
17
15
40
1.90
685642--685682
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
694614--694679
32
2.1
30
83
5
78
42
1
13
42
1.53
696623--696664
3
14.0
3
100
0
84
33
0
33
33
1.58
697188--697251
29
2.2
31
83
8
80
31
7
12
48
1.69
702742--702799
30
2.0
30
86
3
82
20
24
13
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
704208--704241
17
2.0
17
88
11
52
32
0
8
58
1.29
707919--707965
7
6.7
7
97
0
85
25
29
27
17
1.97
715431--715469
20
2.0
20
85
10
53
64
2
20
12
1.40
720899--720927
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
731696--731941
130
1.9
130
87
1
359
31
19
21
28
1.97
736651--736700
24
2.1
23
85
3
64
54
18
2
26
1.54
736651--736700
23
2.1
24
85
10
68
54
18
2
26
1.54
737659--737699
21
2.0
21
85
9
57
34
0
4
60
1.18
739339--739414
33
2.3
33
97
0
143
28
11
17
42
1.84
744916--744940
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
0.63
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40
2.1
40
100
0
166
20
12
20
46
1.82
751758--751810
26
2.0
26
100
0
106
28
3
18
49
1.65
752629--752654
12
2.2
12
100
0
52
34
0
0
65
0.93
765084--765177
23
4.1
23
85
0
134
22
25
4
47
1.69
769587--769680
23
4.1
23
85
0
134
22
25
4
47
1.69
772414--772453
20
2.0
20
90
0
62
37
25
0
37
1.56
772616--772865
55
4.7
53
80
8
251
21
25
18
34
1.96
772663--772860
108
1.8
110
89
4
312
22
25
17
33
1.96
775501--775536
4
9.0
4
93
0
63
22
0
27
50
1.50
779890--779941
24
2.2
24
86
6
70
32
1
3
61
1.25
782075--782361
38
6.9
38
84
14
331
35
16
25
22
1.95
782113--782405
46
6.7
45
88
7
355
37
16
24
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
782064--782361
84
3.5
84
86
10
405
36
16
24
22
1.94
782074--782361
122
2.3
123
92
5
470
35
16
25
22
1.95
782494--782523
13
2.3
13
94
0
51
36
0
26
36
1.57
782666--782712
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
783717--783795
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
783707--783794
36
2.4
36
80
17
119
38
10
15
35
1.82
786996--787052
21
2.6
22
73
15
64
28
0
5
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1.13
787640--787680
23
1.9
21
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0
21
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788010--788059
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3.3
15
82
0
73
36
2
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50
1.51
788449--788498
21
2.3
21
86
6
64
14
24
26
36
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332