Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  48  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14357477--14357575
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13
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28
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2.6
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86
3
197
30
4
41
24
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
5
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2.0
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81
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25
17
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29
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14404024--14404336
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1.9
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18
18
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0
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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20
31
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14479865--14479890
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2.0
13
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38
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20
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18
20
26
1.96
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18
20
25
1.95
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20
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1.95
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2.8
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18
24
20
36
1.95
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6
25.8
6
74
19
139
19
17
14
48
1.81
14489559--14489686
55
2.3
55
91
2
204
20
17
14
47
1.82
14489559--14489736
30
6.1
30
80
13
183
19
17
14
48
1.81
14492971--14493014
18
2.5
17
85
10
54
22
2
0
75
0.92
14492988--14493025
17
2.2
17
90
0
58
15
2
2
78
0.97
14497635--14497664
15
2.0
15
93
0
51
3
13
33
50
1.58
14508510--14508602
30
3.1
29
85
11
125
32
25
20
21
1.98
14508520--14508604
15
5.7
15
67
10
57
31
22
21
24
1.98
14509614--14509711
26
3.8
26
90
4
146
30
18
21
29
1.97
14509614--14509711
50
1.9
52
87
4
146
30
18
21
29
1.97
14518673--14518697
12
2.1
12
100
0
50
76
0
8
16
1.02
14529532--14529597
25
2.6
25
80
0
78
36
19
27
16
1.93
14531173--14531197
7
3.6
7
100
0
50
0
28
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56
1.41
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11
3.1
11
91
0
50
0
23
0
76
0.79
14533183--14533236
29
1.9
28
85
7
74
44
1
1
51
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14534990--14535175
40
4.6
40
78
9
162
25
13
25
34
1.93
14537690--14537852
42
3.9
42
75
4
141
27
25
17
30
1.97
14540787--14540811
7
3.6
7
100
0
50
44
12
0
44
1.41
14540934--14541677
393
1.9
392
92
1
1267
44
8
9
38
1.66
14541697--14541735
20
2.0
21
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10
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2
0
35
1.10
14542752--14542776
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
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1.00
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2.0
20
90
4
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48
0
0
51
1.00
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39
2.1
38
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11
1
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15
2.1
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18
1.00
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17
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59
2
0
38
1.10
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12
3.2
12
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35
0
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2.6
52
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12
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16
26
1.96
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2.0
41
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0
157
30
27
10
31
1.91
14577541--14577700
52
3.1
51
80
11
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26
16
27
1.97
14592952--14593111
26
6.2
26
88
0
230
32
6
24
36
1.80
14592952--14593111
52
3.1
52
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0
257
32
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24
36
1.80
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137
2.1
137
96
0
529
24
18
24
32
1.97
14596583--14596635
26
2.0
26
82
7
63
24
15
20
39
1.91
14598120--14598220
26
3.9
26
92
0
157
35
23
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33
1.82
14603351--14603400
20
2.5
20
80
9
57
28
6
6
60
1.44
14604156--14604203
21
2.3
22
80
20
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25
0
10
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26
2.1
27
82
10
76
44
3
1
50
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14617896--14618019
60
2.0
61
81
4
144
41
15
3
40
1.63
14624899--14624963
32
2.0
33
84
3
87
53
1
27
16
1.52
14625736--14625770
11
3.2
11
87
0
52
48
5
11
34
1.63
14625879--14625996
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2.6
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4
139
32
7
19
40
1.80
14625917--14626072
76
2.1
76
93
0
267
30
8
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1.83
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21
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1
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14
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22
1.91
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12
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1
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1.60
14636755--14636804
16
3.1
16
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46
0
16
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1.47
14637302--14637979
84
8.1
84
85
6
916
30
22
22
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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