Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  285  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
25
86
0
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95051598--95051730
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2.8
47
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2
187
28
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22
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1.99
95051598--95051730
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71
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2.3
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1.20
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5.0
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60
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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19
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24
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45
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20
5
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23
2.1
23
100
0
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8
30
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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1.03
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2.4
21
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0
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12
24
26
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
0
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29
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18
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1.79
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15
2.9
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77
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0
0
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22
2.0
22
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8
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63
0
0
36
0.95
95204626--95204668
7
5.8
8
89
10
65
62
0
0
37
0.95
95212121--95212162
21
1.9
22
90
9
68
30
0
4
64
1.14
95212210--95212301
26
3.5
26
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2
94
45
0
3
51
1.17
95212452--95212505
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16
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0
63
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24
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40
1.72
95213313--95213368
29
1.9
29
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7
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53
5
3
37
1.41
95222535--95222609
34
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34
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34
21
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1.80
95228512--95228559
20
2.4
20
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0
78
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1.99
95230351--95230646
95
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95
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2.1
25
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0
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21
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22
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14
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20
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5
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7
10
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1.48
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13
3.6
13
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12
55
38
0
0
62
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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7
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14
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0
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0
0
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2.1
27
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0
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35
8
26
29
1.87
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22
2.0
22
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13
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0
40
14
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0
1
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22
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0
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128
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23
29
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25
1.99
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13
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0
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28
100
0
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2.0
27
100
0
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10
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2.0
21
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22
2.3
22
80
16
59
18
6
2
74
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95338735--95338820
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2.0
43
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4
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27
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2.2
26
100
0
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26
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1.82
95348645--95348751
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2.1
52
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1
198
31
6
26
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1.82
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7
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0
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58
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0
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25
2.4
25
91
0
95
31
16
27
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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