Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  247  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82207303--82207355
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20
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2.6
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27
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2.8
80
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193
26
27
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1.99
82252360--82252540
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80
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210
27
27
21
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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0
0
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0
0
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25
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28
28
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46
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20
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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49
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2.0
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22
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23
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23
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2.0
878
94
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3001
32
13
22
31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82424726--82424752
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3.9
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0
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0
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29
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2.0
117
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20
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20
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1.82
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3
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40
20
8
30
1.82
82440892--82440967
27
2.9
27
82
4
82
38
21
14
26
1.91
82445951--82445991
21
2.0
21
85
4
57
48
17
0
34
1.47
82450346--82450446
27
3.7
27
80
10
116
37
19
23
18
1.94
82458453--82458531
36
2.2
37
95
2
142
37
7
34
20
1.81
82460610--82460827
45
4.9
45
87
3
284
23
22
27
26
2.00
82460610--82460827
90
2.5
90
88
3
318
23
22
27
26
2.00
82467319--82467522
40
5.1
40
92
1
322
26
27
21
24
1.99
82471800--82471848
22
2.2
22
86
13
66
55
6
6
32
1.49
82472000--82472121
23
5.2
22
69
12
73
62
0
4
32
1.17
82472174--82472241
5
13.4
5
71
20
52
63
1
1
33
1.13
82472100--82472218
25
4.9
24
74
18
104
58
0
6
34
1.24
82472209--82472243
16
2.1
18
89
10
56
62
5
0
31
1.18
82472178--82472241
21
3.0
20
81
9
65
64
1
1
32
1.13
82473957--82474508
206
2.7
206
91
1
865
29
21
17
30
1.97
82486376--82486419
22
2.0
22
83
12
56
56
6
6
29
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82486576--82486702
50
2.8
45
73
20
111
60
0
6
32
1.27
82486744--82486811
5
13.4
5
71
20
52
63
1
1
33
1.13
82486748--82486807
26
2.3
25
83
11
68
65
1
1
31
1.13
82486779--82486813
16
2.1
18
89
10
56
62
5
0
31
1.18
82486748--82486811
21
3.0
20
81
9
65
64
1
1
32
1.13
82486669--82486791
25
4.9
26
73
20
84
60
0
6
33
1.23
82489246--82489307
31
2.0
31
90
0
97
16
45
1
37
1.57
82492217--82492282
34
1.9
35
84
9
91
56
3
1
39
1.24
82492759--82492844
43
2.0
43
88
0
127
44
11
10
33
1.75
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27
3.2
27
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8
102
37
21
20
21
1.94
82498105--82498322
27
8.1
27
84
1
276
27
20
19
33
1.96
82503896--82503965
35
2.0
35
100
0
140
37
17
14
31
1.89
82513637--82513774
40
3.5
39
89
6
190
23
23
28
23
1.99
82523054--82523137
40
2.1
40
100
0
168
9
22
16
51
1.73
82526256--82526281
13
2.0
13
100
0
52
15
38
30
15
1.88
82536222--82536441
48
4.6
48
85
3
282
25
16
27
30
1.97
82536222--82536445
95
2.3
96
84
2
299
25
16
27
29
1.97
82536413--82536525
43
2.6
42
79
9
129
26
18
28
26
1.98
82551357--82551385
12
2.3
13
94
5
51
58
13
6
20
1.58
82552196--82552352
42
3.7
42
80
4
165
30
15
25
28
1.96
82561522--82561554
12
2.8
12
90
0
57
9
24
42
24
1.83
82575406--82575459
28
1.9
28
88
0
81
20
25
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82584523--82584653
23
5.7
23
75
1
111
34
20
20
24
1.97
82584522--82584653
45
2.9
46
82
1
149
34
20
20
24
1.96
82593205--82593266
31
2.0
31
93
0
106
37
24
11
27
1.89
82600866--82601129
56
4.7
56
84
3
334
32
22
15
29
1.95
82600866--82601129
112
2.4
112
88
0
402
32
22
15
29
1.95
82607792--82607967
46
3.8
46
81
11
191
20
19
29
30
1.97
82607788--82607959
93
1.8
92
90
4
274
20
20
29
29
1.98
82611796--82611846
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2.5
20
83
0
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37
13
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1.91
82611897--82611981
26
3.3
26
93
6
140
29
18
23
28
1.98
82611897--82611993
26
3.8
25
87
8
126
27
20
23
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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