Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  287  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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25
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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138
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Copy
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A
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(0-2)
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0
8
28
1.23
95957421--95957500
18
4.2
18
72
15
56
63
0
10
26
1.25
95957408--95957719
21
14.0
21
67
26
96
62
0
11
25
1.31
95957351--95957742
47
8.7
47
81
9
444
63
0
11
24
1.31
95957729--95957821
5
17.6
5
84
6
114
61
2
18
18
1.45
95957729--95957821
27
3.5
27
91
7
138
61
2
18
18
1.45
95958195--95958244
14
3.2
16
81
18
61
62
0
10
28
1.27
95958238--95958306
11
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11
70
18
58
52
0
15
31
1.44
95958222--95958308
28
3.3
28
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15
85
52
0
14
32
1.42
95958207--95958308
5
18.8
5
69
18
53
54
0
13
31
1.39
95958223--95958308
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3.5
23
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20
75
52
0
15
32
1.43
95958222--95958371
47
3.0
48
83
8
169
53
0
14
32
1.42
95958449--95958486
6
6.7
6
90
3
53
57
0
23
18
1.40
95964078--95964268
104
1.8
107
79
5
228
36
19
15
28
1.92
95964075--95964519
107
4.1
106
75
9
416
35
21
15
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95964049--95964543
218
2.3
218
81
4
597
35
21
16
26
1.94
95964123--95964522
218
1.8
217
88
3
608
35
23
15
26
1.94
95966039--95966515
109
4.4
109
75
11
390
35
20
16
26
1.94
95966083--95966515
219
2.0
216
87
4
620
34
22
16
26
1.95
95966010--95966567
112
5.1
108
74
11
428
34
21
16
27
1.95
95967086--95967131
20
2.2
22
88
7
69
63
8
0
28
1.24
95967661--95967703
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2.4
18
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7
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48
0
0
51
1.00
95975426--95975739
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4.2
75
77
4
294
41
24
9
24
1.85
95975252--95975584
174
1.9
171
79
8
370
41
21
7
29
1.81
95975426--95975739
149
2.1
150
81
4
366
41
24
9
24
1.85
95976447--95976479
16
2.0
17
88
5
50
72
0
12
15
1.12
95977927--95977959
17
1.9
17
88
11
50
27
6
6
60
1.44
95980163--95980210
13
3.2
16
75
19
50
41
2
2
54
1.24
95980182--95980212
12
2.5
13
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5
55
51
0
0
48
1.00
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2.1
32
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0
114
21
7
15
56
1.64
95993912--95994359
126
3.5
126
86
4
555
38
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17
26
1.92
95995828--95995861
18
1.9
18
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5
61
85
2
0
11
0.71
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15
2.1
16
94
5
59
48
0
0
51
1.00
96017980--96018025
23
2.0
23
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12
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45
10
6
36
1.65
96025753--96025798
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
96025760--96025804
23
2.0
23
82
8
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40
13
8
37
1.76
96031358--96031421
22
2.9
22
79
9
76
39
17
26
17
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96040383--96040436
28
2.0
28
82
10
67
37
5
0
57
1.22
96043129--96043202
33
2.2
33
83
4
87
35
14
22
27
1.94
96045334--96045403
30
2.5
28
77
9
70
37
7
5
50
1.54
96045333--96045389
30
1.9
30
85
7
80
36
7
5
50
1.52
96054748--96054865
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2.0
58
100
0
236
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1.64
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20
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37
0
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2.1
18
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0
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0
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17
17
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2.7
21
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22
12
17
47
1.81
96062174--96062323
42
3.6
41
76
6
133
17
20
18
44
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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