Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  18  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5216150--5216460
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1
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2.00
5220603--5220779
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2.2
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22
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1.23
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2.1
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0
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27
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177
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24
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2.4
16
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4
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23
0
2
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0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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52
0
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28
2.0
28
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0
1
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29
18
12
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29
19
11
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1.88
5286981--5287176
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108
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258
29
20
11
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3.2
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148
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20
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1.79
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0
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19
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2.3
22
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3
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2
0
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22
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9
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47
7
16
28
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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0
0
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2.4
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2.5
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1
59
1.23
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2.1
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0
3
56
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0
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61
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2.0
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0
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2.3
22
82
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58
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16
20
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5366165--5366282
9
13.1
9
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21
52
31
4
2
61
1.28
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27
1
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59
23
5
1
69
1.20
5396156--5396242
39
2.2
39
87
0
129
22
20
26
29
1.99
5396156--5396255
39
2.6
39
83
3
112
23
20
27
30
1.98
5399242--5399319
5
15.4
5
77
15
63
17
2
1
78
0.94
5399254--5399335
4
20.8
4
73
20
50
20
2
1
75
0.98
5399243--5399326
29
2.8
29
83
5
105
19
2
1
77
0.95
5399249--5399335
25
3.7
23
79
13
90
20
2
1
75
0.97
5400345--5400526
96
1.9
97
90
1
294
26
15
26
30
1.96
5401167--5401209
10
4.3
10
82
11
61
20
6
2
69
1.23
5413393--5413439
19
2.4
20
82
13
62
76
4
12
6
1.12
5413451--5413493
20
2.2
19
83
4
50
69
4
25
0
1.07
5414360--5414466
41
2.8
38
83
8
119
26
14
22
36
1.93
5414397--5414495
41
2.4
41
81
1
110
26
14
24
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5414687--5414738
16
3.2
16
76
10
61
34
1
25
38
1.67
5423965--5424023
29
2.1
28
81
9
66
69
3
1
25
1.13
5424822--5424875
28
1.9
28
85
7
74
24
7
3
64
1.35
5424822--5424875
29
1.9
27
82
14
65
24
7
3
64
1.35
5428729--5428785
25
2.3
24
79
11
62
38
24
21
15
1.92
5428769--5428833
24
2.7
24
76
9
69
35
21
24
18
1.96
5431457--5431495
7
5.6
7
96
0
69
48
25
12
12
1.77
5432799--5432859
20
3.2
19
72
15
54
40
1
4
52
1.33
5436066--5436097
3
10.7
3
93
0
55
0
31
34
34
1.58
5444801--5444911
47
2.4
47
83
6
145
25
17
22
35
1.95
5446555--5446607
16
3.0
18
76
15
56
58
0
3
37
1.16
5447378--5447429
24
2.2
24
92
0
86
48
15
9
26
1.76
5447384--5447431
24
2.0
24
100
0
96
41
16
12
29
1.85
5447465--5447507
20
2.2
19
87
4
59
69
2
2
25
1.12
5451802--5451826
11
2.3
11
100
0
50
88
0
12
0
0.53
5452494--5452543
26
2.0
24
84
7
64
62
6
0
32
1.20
5458805--5458852
25
1.9
25
82
0
60
29
8
10
52
1.65
5458984--5459064
31
2.6
32
83
9
89
41
11
8
38
1.71
5467155--5467190
17
2.1
17
100
0
72
66
11
5
16
1.40
5469317--5469424
30
3.4
30
67
20
76
27
15
26
29
1.96
5469300--5469453
66
2.3
66
85
2
202
29
16
24
28
1.97
5476209--5476255
5
9.4
5
77
9
51
40
19
0
40
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5477461--5477499
14
2.8
14
92
0
60
35
10
20
33
1.86
5494271--5494507
104
2.3
103
88
5
361
19
20
29
31
1.97
5496840--5496875
15
2.3
17
86
13
51
52
2
0
44
1.15
5509409--5509527
45
2.6
45
83
0
139
20
9
58
11
1.60
5509412--5509515
15
6.9
15
75
0
82
19
9
58
12
1.61
5509430--5509523
30
3.1
30
83
7
102
20
9
59
10
1.58
5509562--5509631
36
2.0
36
83
8
92
28
4
52
14
1.60
5513763--5513803
21
1.9
21
90
5
64
39
0
0
60
0.96
5514063--5514150
26
3.5
25
77
20
78
35
7
4
52
1.51
5514221--5514347
25
4.8
24
74
13
83
35
5
4
54
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332