Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  261  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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2.0
26
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17
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22
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21
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.9
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1.85
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5.6
10
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12
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1
1
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0
0
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26
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1.36
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2.1
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100
0
124
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30
16
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87466373--87466434
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2.7
23
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1
4
16
1.02
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12
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17
71
76
0
4
18
0.95
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0
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18
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0
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131
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1.76
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3
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0
50
32
0
0
68
0.90
87502407--87502520
59
1.9
59
98
0
219
39
18
6
35
1.76
87506901--87506927
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
87511116--87511151
10
3.6
10
92
0
63
33
16
8
41
1.78
87511114--87511151
20
1.9
20
100
0
76
34
15
10
39
1.82
87517665--87517737
30
2.4
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1.48
87520497--87520540
12
3.8
12
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3
54
75
0
0
25
0.81
87535800--87536112
94
3.3
94
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10
277
22
28
20
28
1.99
87538625--87538707
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2.0
42
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4
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1.95
87546061--87546085
13
1.9
13
100
0
50
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87557515--87557560
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1.76
87563137--87563226
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2.0
44
93
0
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26
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17
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1.96
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20
2.0
20
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0
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30
45
1.72
87567777--87567852
40
1.9
40
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5
100
18
14
32
34
1.91
87568578--87568636
31
2.0
29
86
6
82
52
8
10
28
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87569953--87570030
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38
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0
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1
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1.40
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24
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24
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0
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12
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1.73
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29
2.0
29
100
0
114
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14
10
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1.80
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22
2.1
22
92
0
76
29
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48
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0
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15
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1.79
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1.96
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28
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1.96
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27
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27
1.98
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2.5
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188
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14
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1.93
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1.9
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100
0
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13
2.7
13
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0
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25
8
25
40
1.84
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6
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6
100
0
52
34
0
0
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0.93
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20
2.5
19
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2
4
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1.28
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9
12.0
9
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13
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30
0
7
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1.29
87616971--87617035
10
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0
10
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1.31
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0
51
53
3
0
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1.17
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2.7
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26
26
25
2.00
87634327--87634465
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3.5
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132
24
27
22
25
2.00
87646088--87646124
18
2.1
18
89
0
56
35
2
21
40
1.68
87659587--87659640
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2.0
27
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40
0
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87666155--87666204
20
2.5
20
76
0
55
62
0
6
32
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87666554--87666588
10
3.4
10
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4
52
11
11
0
77
1.00
87666927--87666964
18
2.1
19
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5
60
39
2
0
57
1.12
87668594--87668628
13
2.8
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2
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0
62
1.10
87669603--87669743
34
4.1
34
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140
30
11
12
45
1.78
87669583--87669743
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2.4
68
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162
29
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12
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1.80
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2.0
142
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0
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1.92
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0
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30
2.0
30
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9
70
59
6
34
0
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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