Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  268  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89611127--89611266
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89611127--89611266
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23
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1.96
89616934--89617067
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18
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23
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1.96
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2.4
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0
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207
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22
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125
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1.82
89639877--89639965
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137
37
14
11
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.96
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2.2
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25
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2
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12
15
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.45
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22
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10
152
37
47
0
14
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89736517--89736651
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1.45
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3
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33
0
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103
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4
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27
13
27
1.94
89747082--89747183
42
2.4
42
69
9
100
24
29
20
25
1.99
89747538--89747569
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
89750532--89750704
46
3.7
46
78
13
210
21
21
27
28
1.99
89750529--89750699
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
89755586--89755624
20
1.9
21
84
5
53
17
5
10
66
1.39
89757103--89757135
5
6.8
5
93
6
59
18
0
0
81
0.68
89757096--89757136
15
2.7
15
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17
57
19
0
0
80
0.71
89762636--89762683
25
1.9
25
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39
10
10
39
1.74
89762909--89762999
37
2.4
37
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12
105
49
4
3
42
1.39
89767106--89767162
20
2.9
20
78
2
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8
12
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1.55
89767136--89767189
20
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23
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17
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5
7
18
68
1.33
89767389--89767432
17
2.5
19
75
20
51
56
0
0
43
0.99
89783075--89783127
18
2.9
18
80
0
61
39
16
9
33
1.81
89783265--89783373
48
2.3
48
88
0
164
35
24
17
22
1.95
89784325--89784379
21
2.4
23
76
8
60
1
14
7
76
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89784394--89784435
9
3.8
11
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14
52
57
4
0
38
1.20
89784387--89784421
3
11.0
3
88
11
52
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2
0
34
1.10
89787225--89787281
30
1.9
30
85
0
78
17
26
29
26
1.97
89790712--89790736
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
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19
2.5
19
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0
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23
10
14
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1.74
89798667--89798726
29
2.0
29
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53
3
1
41
1.27
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74
2.0
74
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0
289
51
3
10
34
1.54
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2.0
22
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0
2
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1.12
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22
2.0
22
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54
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4
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1.41
89804678--89804731
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2.0
27
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42
3
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48
1.44
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2
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2
100
0
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0
50
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1.00
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2
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0
53
3
0
48
48
1.17
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19
1.9
19
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2
0
19
0.88
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2.1
17
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0
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44
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17
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35
1.79
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68
1.9
68
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0
175
25
24
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1.95
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2.0
42
95
0
146
48
7
2
41
1.44
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1.9
40
91
0
127
36
35
14
14
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89826859--89827142
144
2.0
145
92
0
480
18
36
25
19
1.94
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2.4
40
80
3
104
38
36
10
13
1.80
89834244--89834283
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1.9
21
94
0
71
22
45
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89842278--89842315
18
2.2
18
85
4
51
63
18
0
18
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89842287--89842338
24
2.1
25
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10
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57
19
0
23
1.40
89856141--89856258
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2.8
42
84
7
166
28
25
16
28
1.97
89875137--89875237
25
4.2
24
72
11
82
43
0
1
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1.11
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27
2.0
27
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29
3
0
67
1.08
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23
2.5
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3
7
21
1.30
89904517--89904569
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2.1
26
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56
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1.64
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3
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1.43
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2.2
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30
5
0
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1.17
89905499--89905760
125
2.1
127
84
7
338
34
13
15
36
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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