Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  4  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1126473--1126512
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0
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0
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3.2
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1136376--1136480
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2.0
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0
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0
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10
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18
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0
4
59
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3.8
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2
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2
4
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73
24
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2
2
36
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1176913--1176992
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101
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3
0
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16
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16
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16
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2.0
46
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2.0
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0
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26
2
0
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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6
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71
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0
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29
24
26
1.99
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20
29
24
26
1.99
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23
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1.99
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0
0
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149
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1
509
46
3
2
47
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1233778--1233956
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128
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0
0
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0
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2
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27
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0
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0
11
0.94
1262532--1262564
15
2.2
15
94
0
57
78
9
0
12
0.95
1262934--1262978
14
3.2
14
81
9
56
66
0
20
13
1.24
1264225--1264501
84
3.2
85
91
2
430
29
22
22
25
1.99
1264225--1264547
169
1.9
168
81
3
369
30
21
22
25
1.99
1264619--1265307
44
15.7
43
70
10
306
30
19
22
27
1.98
1264613--1264998
174
2.2
174
95
1
688
29
20
23
27
1.98
1264619--1265319
85
8.0
87
71
12
457
30
19
22
27
1.98
1264792--1265347
269
2.1
269
99
0
1094
31
19
21
27
1.97
1280888--1282006
568
2.0
566
85
3
1514
34
11
15
38
1.83
1286965--1286989
13
1.9
13
100
0
50
68
0
0
32
0.90
1290602--1290656
18
3.1
18
71
23
53
61
3
3
30
1.30
1295265--1295404
71
2.0
71
97
0
262
42
11
9
37
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1295589--1295667
38
2.1
38
81
9
90
51
3
6
37
1.45
1299403--1299427
7
3.6
7
100
0
50
48
0
0
52
1.00
1299918--1299988
31
2.3
31
83
9
83
26
9
15
47
1.76
1310603--1310639
19
1.9
19
88
0
56
59
2
2
35
1.26
1310829--1310890
25
2.7
22
72
15
54
51
0
1
46
1.10
1315360--1315452
47
2.1
45
86
8
127
53
4
2
39
1.32
1316919--1316951
16
2.1
16
100
0
66
30
12
33
24
1.91
1322451--1322536
2
43.5
2
68
11
52
47
11
1
39
1.47
1322448--1322476
15
1.9
15
100
0
58
48
3
0
48
1.18
1322455--1322534
20
4.4
19
79
13
64
47
12
1
38
1.49
1322468--1322526
24
2.5
24
91
0
91
47
15
1
35
1.55
1334849--1334911
26
2.4
25
76
10
63
28
1
3
66
1.16
1335759--1335793
17
2.1
17
88
0
52
77
0
0
22
0.78
1337685--1337732
24
2.0
23
84
4
60
66
0
2
31
1.03
1337681--1337735
23
2.5
22
76
8
58
70
0
1
27
0.97
1356754--1356839
42
2.0
42
100
0
172
48
18
13
18
1.80
1358311--1358381
29
2.5
28
76
19
74
29
9
8
52
1.64
1363201--1363268
28
2.4
28
95
4
120
27
17
5
48
1.70
1368172--1368235
19
3.4
19
75
14
60
45
1
1
51
1.20
1369736--1369799
22
3.0
22
77
9
69
35
0
3
60
1.12
1369705--1369778
20
3.7
20
74
12
62
29
4
4
62
1.32
1369755--1369818
29
2.1
29
86
11
85
39
0
1
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1369706--1369789
20
4.2
20
68
15
57
33
3
3
59
1.32
1369788--1369820
9
3.7
9
88
11
50
42
0
0
57
0.98
1379592--1379644
27
1.9
27
85
11
72
32
1
3
62
1.24
1380273--1380811
212
2.6
205
88
5
798
40
7
11
41
1.68
1383894--1384597
143
5.0
141
87
4
985
43
16
14
25
1.86
1383910--1384597
281
2.4
282
90
3
1075
43
16
14
25
1.85
1386119--1386168
16
3.1
16
77
13
57
36
0
0
64
0.94
1398614--1398670
27
2.1
27
93
0
96
45
7
12
35
1.69
1398655--1398722
34
2.0
34
100
0
136
50
5
2
41
1.42
1398663--1398735
34
2.2
32
85
9
94
53
4
2
39
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332