Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  299  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
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Number
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Score
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20
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30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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1.97
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2.0
283
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1091
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16
8
40
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99286353--99286382
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124
32
5
4
57
1.44
99307251--99307312
24
2.5
24
84
7
70
30
3
8
58
1.43
99307270--99307326
25
2.3
24
84
3
78
31
5
5
57
1.43
99312870--99312921
24
2.2
24
85
0
68
55
5
3
34
1.42
99320266--99320308
13
3.3
13
80
0
50
37
2
4
55
1.33
99322211--99322273
27
2.3
27
91
0
99
52
1
11
34
1.47
99322211--99322287
27
2.9
27
88
1
93
48
2
11
37
1.54
99329714--99329750
12
3.0
13
84
11
51
29
40
18
10
1.85
99333289--99333332
16
2.8
16
82
10
63
25
0
22
52
1.48
99333289--99333332
15
2.8
15
80
19
54
25
0
22
52
1.48
99333327--99333505
96
1.8
99
83
8
240
43
1
13
41
1.54
99333608--99334152
126
4.3
125
89
3
801
33
17
21
27
1.96
99333608--99334152
251
2.2
251
90
2
835
33
17
21
27
1.96
99337179--99337381
100
2.0
101
94
0
354
43
9
4
42
1.58
99337206--99337361
50
3.1
49
66
20
124
44
9
3
42
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99337212--99337417
100
2.1
99
82
4
243
47
9
4
38
1.57
99337880--99337945
30
2.2
30
83
0
78
6
16
45
31
1.72
99339591--99339651
25
2.6
23
80
10
61
42
1
21
34
1.63
99339628--99339665
11
3.7
10
83
16
51
42
0
26
31
1.56
99348955--99349130
46
3.8
46
79
12
207
21
21
28
28
1.98
99348952--99349123
93
1.8
93
94
0
308
21
21
29
27
1.99
99350667--99350714
25
2.0
25
84
12
64
22
18
22
35
1.96
99350873--99350934
31
2.1
30
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17
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45
8
17
29
1.77
99352628--99352674
22
2.1
22
84
7
60
42
17
4
36
1.68
99353459--99353521
32
1.9
34
90
6
103
38
7
17
36
1.79
99353459--99353538
32
2.5
31
84
9
83
36
10
17
36
1.83
99353590--99353650
31
2.1
28
81
9
68
49
13
4
32
1.63
99360707--99360891
101
1.8
101
85
0
262
20
25
34
20
1.96
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7
3.7
7
100
0
52
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0
11
0
0.52
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19
2.1
19
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0
53
35
2
7
55
1.42
99371142--99371179
16
2.3
17
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13
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73
2
0
23
0.95
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23
1.9
24
86
4
65
71
2
0
26
0.98
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14
2.2
14
100
0
62
38
0
12
48
1.42
99380864--99380897
17
1.9
17
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5
50
17
41
29
11
1.85
99385267--99385323
23
2.6
22
73
15
55
42
0
3
54
1.17
99385568--99385655
44
2.0
44
100
0
176
45
11
13
29
1.79
99387085--99387285
62
3.3
62
68
14
182
47
4
4
42
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99387101--99387283
57
3.1
56
65
23
133
46
4
5
42
1.48
99388310--99388343
6
5.7
6
92
0
59
0
50
0
50
1.00
99388309--99388349
18
2.3
18
82
0
55
4
43
0
51
1.23
99389555--99389601
23
2.0
23
88
8
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76
2
6
14
1.08
99390322--99390365
22
1.9
24
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9
74
0
13
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70
1.17
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0
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0
0
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0.62
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4
2
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5
4
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1.43
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4.0
47
75
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6
4
31
1.43
99398910--99399021
12
9.6
12
67
26
55
58
3
3
33
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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