Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  203  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67599595--67599688
35
2.7
35
90
3
136
30
12
18
38
1.88
67605541--67605574
18
1.9
17
88
5
50
41
2
0
55
1.15
67605611--67605649
13
2.9
14
88
11
64
53
0
0
46
1.00
67605646--67605695
20
2.3
22
83
16
77
42
10
4
44
1.56
67605653--67605694
20
2.1
20
100
0
84
42
9
4
42
1.58
67610494--67610615
47
2.6
45
82
7
145
29
22
28
19
1.98
67613864--67613896
17
1.9
17
93
0
57
39
0
0
60
0.97
67614142--67614193
16
3.2
16
94
0
86
36
26
0
36
1.57
67620661--67620700
20
2.0
21
85
14
57
45
12
10
32
1.75
67625488--67625597
38
2.9
38
73
4
105
34
26
19
20
1.96
67625521--67625567
19
2.5
19
85
0
58
40
27
14
17
1.89
67625535--67625585
19
2.7
19
81
0
57
37
25
17
19
1.94
67625540--67625682
58
2.5
58
74
1
144
32
24
21
20
1.98
67626854--67626913
30
2.0
30
87
6
86
18
16
13
51
1.76
67627001--67627063
32
1.9
33
84
9
85
63
0
0
36
0.95
67631148--67631189
19
2.3
18
80
12
50
35
2
21
40
1.66
67633535--67633587
25
2.2
24
82
3
61
18
20
18
41
1.91
67636070--67636107
20
2.0
19
85
10
51
60
5
2
31
1.33
67644022--67644197
41
4.3
41
90
0
271
22
28
20
28
1.98
67644028--67644197
82
2.1
82
100
0
340
22
28
20
28
1.98
67644409--67644445
19
1.9
19
94
0
65
45
18
0
35
1.50
67647083--67647189
12
9.6
12
72
24
60
48
0
1
49
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67647327--67647420
44
2.1
46
86
7
131
34
24
6
35
1.81
67647402--67647456
16
3.4
16
92
0
92
29
29
7
34
1.84
67647728--67647803
40
1.9
40
94
0
134
18
34
7
39
1.80
67647707--67647815
40
3.1
34
76
17
116
14
36
6
42
1.72
67653915--67653946
9
3.6
9
100
0
64
12
0
9
78
0.97
67656243--67656279
19
1.9
19
94
0
65
48
2
10
37
1.52
67660625--67660654
15
1.9
16
93
6
53
63
0
3
33
1.11
67660625--67660659
16
2.1
16
89
5
52
62
0
2
34
1.10
67664151--67664184
17
2.0
17
88
11
52
20
0
2
76
0.92
67665485--67665522
20
1.9
19
89
5
58
52
2
0
44
1.14
67669600--67669697
40
2.4
42
77
10
112
33
25
15
25
1.95
67673184--67673323
57
2.4
57
80
5
149
27
18
20
34
1.96
67674696--67674847
52
2.9
51
77
8
153
30
25
16
26
1.97
67680885--67680924
21
2.0
20
85
5
53
22
22
37
17
1.94
67682088--67682351
47
5.7
47
73
15
189
25
30
18
25
1.98
67682220--67682352
46
2.9
48
77
11
143
24
30
18
27
1.98
67683782--67683823
20
2.1
20
95
0
75
35
16
21
26
1.94
67685218--67685281
32
2.0
32
93
0
110
39
25
6
29
1.80
67691281--67691343
24
2.5
24
84
5
72
52
0
9
38
1.34
67691960--67691995
14
2.6
14
86
0
54
75
2
0
22
0.94
67696732--67696836
39
2.7
39
86
2
149
26
26
20
25
1.99
67700710--67700823
49
2.3
49
83
5
133
27
34
18
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67700809--67700836
13
2.2
13
100
0
56
14
32
35
17
1.90
67702238--67702285
24
2.0
25
95
4
89
33
6
14
45
1.70
67709118--67709302
79
2.3
82
84
7
238
25
27
22
24
2.00
67709099--67709302
40
5.1
40
82
8
238
25
27
22
25
2.00
67717058--67717242
79
2.3
82
84
7
238
25
27
22
24
2.00
67717039--67717242
40
5.1
40
82
8
238
25
27
22
25
2.00
67726628--67726673
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
67726635--67726679
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
67737079--67737124
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
67737086--67737130
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
67745183--67745260
36
2.1
37
90
2
122
25
30
19
24
1.98
67745379--67746028
47
13.7
47
96
1
1142
29
29
8
32
1.87
67748205--67748382
85
2.1
84
97
1
338
26
27
8
37
1.85
67750014--67750317
40
7.8
40
89
4
453
25
27
21
25
1.99
67750014--67750317
116
2.6
117
88
6
438
25
27
21
25
1.99
67751511--67751588
36
2.1
37
90
2
122
25
30
19
24
1.98
67751707--67752261
47
11.7
47
95
1
934
29
30
8
32
1.87
67751707--67752261
239
2.3
235
93
2
830
29
30
8
32
1.87
67754440--67754618
85
2.1
85
97
0
340
26
27
8
37
1.85
67757774--67757828
19
3.1
17
81
7
65
34
14
10
40
1.81
67758130--67758222
48
1.9
49
82
6
118
30
15
17
37
1.90
67762276--67762326
19
2.7
19
87
0
84
27
7
13
50
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67762649--67762741
48
1.9
49
88
2
143
30
16
16
37
1.90
67772268--67772379
29
3.9
29
81
6
122
27
29
16
25
1.97
67772572--67772609
16
2.4
16
78
4
51
10
26
21
42
1.85
67772648--67772727
38
2.1
38
95
0
142
25
28
21
25
1.99
67773689--67773720
16
2.0
16
93
0
55
15
6
28
50
1.68
67775069--67775878
270
3.0
270
99
0
1593
34
20
16
29
1.94
67780345--67780420
36
2.1
36
100
0
152
32
15
19
31
1.94
67782013--67782059
18
2.6
18
86
3
58
25
14
19
40
1.90
67784022--67784058
18
2.1
18
100
0
74
27
10
16
45
1.80
67787892--67787952
30
2.1
29
90
3
95
37
24
14
22
1.92
67794809--67794993
40
4.7
40
82
6
216
23
22
28
25
2.00
67801115--67801166
24
2.1
25
82
3
61
38
21
1
38
1.64
67807693--67807717
13
1.9
13
100
0
50
48
0
8
44
1.32
67808148--67808189
21
2.0
21
90
0
66
40
0
2
57
1.12
67808158--67808306
73
2.0
75
89
2
230
36
5
5
52
1.47
67808624--67808655
6
5.5
6
96
3
57
53
0
0
46
1.00
67814640--67814811
93
1.8
93
94
0
308
29
30
20
20
1.97
67814633--67814808
46
3.8
46
79
12
207
30
30
19
19
1.97
67818959--67819181
40
5.6
40
81
5
254
24
22
26
26
2.00
67820489--67820666
45
3.8
49
78
15
207
28
29
20
20
1.98
67820496--67820666
93
1.8
92
96
1
315
28
29
21
21
1.98
67821082--67821138
30
1.9
30
82
13
73
26
22
5
45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67827982--67828153
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
67827975--67828150
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
67837669--67837698
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
67838170--67838203
15
2.3
15
90
5
52
70
2
0
26
1.01
67838267--67838300
14
2.4
14
85
0
50
55
0
0
44
0.99
67838269--67838331
27
2.3
28
72
8
67
50
0
3
46
1.17
67838289--67838336
25
1.9
25
83
8
62
50
0
4
45
1.21
67839139--67839172
18
1.9
17
88
5
50
23
5
0
70
1.09
67841859--67842031
46
3.8
45
76
11
172
20
18
30
30
1.97
67841852--67842024
93
1.9
93
92
2
294
20
19
30
28
1.97
67844942--67844991
15
3.4
15
86
2
66
10
18
12
60
1.59
67846641--67846816
46
3.8
45
76
10
185
20
19
30
29
1.97
67846637--67846809
93
1.9
93
92
0
292
20
20
30
28
1.98
67849954--67850065
43
2.6
42
87
2
170
28
17
25
28
1.98
67853252--67853324
36
2.0
36
100
0
146
39
24
13
21
1.90
67858483--67858594
27
4.2
26
78
7
116
39
22
22
16
1.92
67866339--67866445
27
4.1
27
80
14
91
37
23
23
15
1.93
67866372--67866420
22
2.2
23
85
10
75
34
24
26
14
1.94
67866351--67866445
49
1.9
50
86
2
138
35
23
24
16
1.95
67869419--67869529
40
2.8
39
83
5
125
26
21
27
24
1.99
67880059--67880161
37
2.8
38
85
8
133
26
16
28
29
1.97
67880123--67880368
48
5.1
48
81
3
307
27
16
25
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67880123--67880399
96
2.9
96
90
1
421
27
16
25
30
1.97
67880135--67880399
48
5.5
48
76
7
252
27
16
25
30
1.97
67887768--67887865
27
3.5
28
87
2
126
27
13
28
30
1.94
67887796--67887878
27
3.0
27
84
5
78
31
12
25
31
1.92
67891291--67891361
28
2.5
28
93
0
115
35
22
9
32
1.87
67896552--67896603
25
2.0
27
85
11
72
73
3
5
17
1.19
67908097--67908224
67
1.9
67
95
0
229
28
9
12
49
1.72
67912130--67912241
55
2.0
55
94
0
197
30
19
27
22
1.98
67916724--67916765
3
13.7
3
80
14
50
66
7
0
26
1.17
67924911--67924955
22
2.1
21
92
8
74
17
24
31
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332