Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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28
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79779837--79780106
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Indices
Period
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Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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79787108--79787177
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79915655--79915700
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1.99
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2.4
15
100
0
72
13
22
19
44
1.86
79960128--79960202
29
2.6
27
79
10
78
36
12
10
41
1.77
79966578--79966613
10
3.6
10
88
0
54
30
25
16
27
1.97
79966770--79966844
29
2.6
28
79
6
80
37
9
9
44
1.69
79970363--79970794
95
4.5
96
91
5
689
32
9
29
28
1.88
79970363--79970794
47
9.1
47
93
2
672
32
9
29
28
1.88
79970913--79970991
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
79974685--79974942
40
6.5
40
86
3
290
23
22
27
26
1.99
79974687--79974908
120
1.8
120
86
4
322
22
22
27
27
1.99
79976606--79976699
33
2.8
33
80
0
107
15
20
17
46
1.84
79976673--79976760
33
2.7
32
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10
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19
15
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51
1.77
79982793--79982818
13
2.0
13
100
0
52
69
7
0
23
1.14
79982812--79983207
138
2.9
138
93
0
666
43
5
9
41
1.59
79983201--79983340
75
1.9
74
89
5
219
31
12
10
45
1.75
79989635--79989679
21
2.2
20
81
11
56
48
22
4
24
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79993042--79993125
29
2.9
28
92
5
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17
21
29
30
1.96
80002146--80002243
27
3.5
28
90
2
135
26
13
28
31
1.94
80002174--80002256
27
3.0
27
87
5
96
30
12
25
32
1.92
80002146--80002257
28
4.0
27
83
6
98
28
12
25
33
1.92
80010888--80010922
16
2.2
17
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20
2
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1.61
80016636--80016824
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2.0
95
95
0
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30
11
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39
1.86
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2.2
169
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2
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28
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40
1.87
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14
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0
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0
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20
1.11
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2.3
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1.31
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2.5
19
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3
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39
6
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1.40
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2.2
24
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29
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2.8
50
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0
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19
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27
1.99
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21
2.5
21
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1
1
26
1.09
80033015--80033044
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2.1
14
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0
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0
0
30
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3.7
20
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2
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1.17
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9
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0
0
32
0.91
80033466--80033521
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2.9
19
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2
76
67
0
0
32
0.91
80033480--80033536
17
3.2
17
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60
64
0
1
33
1.04
80033453--80033527
19
3.8
19
78
5
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62
1
0
36
1.04
80033563--80033599
17
2.2
16
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4
56
64
2
0
32
1.07
80033589--80033647
28
2.1
29
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75
59
0
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32
1.28
80035156--80035917
206
3.7
206
92
1
1197
28
22
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80047429--80047503
21
3.7
20
77
13
55
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2
1
32
1.16
80047474--80047513
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2.1
19
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0
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70
0
0
30
0.88
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5.0
11
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0
0
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2.0
15
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24
6
0
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232
2.0
232
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0
878
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16
6
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1.75
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10
4.1
10
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2.0
20
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1.51
80062048--80062115
18
3.8
18
69
21
54
61
0
26
11
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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