Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2.1
21
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32
2
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44
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97352669--97352715
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0
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15
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0
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14
52
1.74
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13
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13
100
0
80
15
37
32
15
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97379876--97379915
18
2.2
19
90
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64
72
0
2
25
0.97
97383805--97383852
23
2.1
23
92
7
80
20
12
25
41
1.87
97387360--97387418
15
3.2
19
70
22
54
18
1
6
72
1.15
97388920--97388970
12
4.6
11
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13
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9
1
1
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0.73
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19
2.0
20
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5
13
51
1.63
97403453--97403519
10
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11
55
68
0
4
26
1.08
97403453--97403519
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20
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68
0
4
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1.08
97403889--97403978
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97404304--97404345
10
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2.0
52
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10
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2
0
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1.16
97404566--97404650
44
2.0
43
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127
29
2
0
68
1.02
97404621--97404674
19
2.9
18
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5
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33
3
1
61
1.25
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17
2.4
17
87
0
55
21
0
4
73
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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58
1
4
35
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165
2.0
169
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2
508
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17
16
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1.92
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27
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27
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2
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29
27
17
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1.97
97432831--97432895
32
2.0
32
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0
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24
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5
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1.29
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39
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3
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23
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1.53
97435185--97435253
23
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24
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100
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28
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18
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2.5
22
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0
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1.32
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2.7
16
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31
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63
1.15
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22
2.3
22
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30
6
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97449094--97449160
28
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29
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1.29
97449079--97449150
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1.9
37
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31
4
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2.9
27
82
13
75
37
2
2
56
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97449214--97449307
26
3.7
26
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28
4
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1.37
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197
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10
12.0
10
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0
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1.84
97457713--97457982
136
2.0
134
91
1
441
34
14
15
35
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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