Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  298  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98871865--98872012
3
48.3
3
70
7
75
27
4
2
65
1.26
98871866--98871939
32
2.3
32
83
0
85
32
2
2
62
1.23
98872036--98872093
14
3.5
16
81
18
66
25
1
1
70
1.06
98872049--98872090
7
5.9
7
91
2
66
26
0
0
73
0.83
98872194--98872235
16
2.7
15
88
3
57
26
4
4
64
1.33
98872159--98872235
3
25.3
3
69
12
50
28
6
2
62
1.33
98872463--98872500
15
2.5
15
86
0
58
34
5
0
60
1.19
98873636--98873763
23
5.5
24
72
10
70
35
5
3
55
1.41
98873780--98873821
22
1.9
22
90
0
66
28
2
7
61
1.35
98873786--98873872
24
3.5
24
74
12
61
29
5
6
57
1.48
98874002--98874049
16
3.1
15
87
6
60
31
4
2
62
1.26
98874002--98874053
8
6.5
8
78
8
52
30
3
1
63
1.23
98883078--98883118
6
6.8
6
82
17
50
82
0
17
0
0.66
98883081--98883116
18
1.9
19
94
5
65
83
0
16
0
0.65
98884063--98884229
73
2.3
73
89
1
244
27
17
21
32
1.96
98884210--98884245
14
2.7
13
87
8
54
16
11
5
66
1.40
98884209--98884253
13
3.4
13
84
6
63
15
8
6
68
1.36
98884140--98884519
100
3.9
101
82
7
421
27
16
18
37
1.92
98884309--98884335
14
1.9
14
100
0
54
14
7
7
70
1.32
98884443--98885197
75
10.0
74
75
11
678
30
16
20
32
1.95
98884663--98885169
146
3.4
147
94
1
827
30
16
20
32
1.95
98884356--98885289
384
2.4
384
80
10
1100
29
16
19
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98885104--98885686
87
6.5
90
75
10
403
28
16
16
37
1.91
98885104--98885686
184
3.2
178
75
11
442
28
16
16
37
1.91
98885193--98885640
92
4.9
93
76
10
277
29
16
16
37
1.91
98886434--98886489
17
3.4
17
80
11
71
16
0
17
66
1.26
98886434--98886491
16
3.4
17
85
7
82
15
0
18
65
1.27
98886847--98886890
23
1.9
23
86
9
63
34
4
0
61
1.16
98886850--98886922
20
3.5
21
75
12
60
35
6
2
54
1.41
98886910--98886965
23
2.3
25
78
6
62
37
8
1
51
1.44
98886910--98887058
25
6.0
25
70
13
76
32
7
4
56
1.46
98886988--98887053
22
2.9
23
82
6
80
30
6
6
57
1.47
98886993--98887056
24
2.8
23
83
6
85
32
4
6
56
1.45
98887036--98887094
23
2.8
20
72
16
57
32
6
5
55
1.48
98887207--98887254
16
3.1
15
87
6
60
31
4
2
62
1.26
98887207--98887258
8
6.5
8
78
8
52
30
3
1
63
1.23
98891959--98891999
21
1.9
22
90
5
66
58
12
12
17
1.63
98894394--98894447
24
2.2
24
96
0
99
11
22
38
27
1.88
98894409--98894447
12
3.2
12
77
0
51
10
25
38
25
1.87
98895193--98895226
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
98899822--98899855
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
98908805--98908873
30
2.3
30
92
0
120
26
50
5
17
1.68
98909421--98909484
25
2.6
25
79
16
71
32
6
3
57
1.39
98909506--98909568
25
2.5
24
84
7
72
30
4
6
58
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98909511--98909582
25
2.8
25
77
10
67
30
5
4
59
1.39
98909427--98909604
80
2.2
81
78
9
182
30
6
5
58
1.44
98909629--98909684
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
98914822--98914852
15
2.1
15
100
0
62
32
35
19
12
1.90
98921726--98921770
13
3.4
13
87
6
72
13
11
6
68
1.37
98921638--98921923
100
2.9
101
89
2
416
23
18
19
38
1.93
98921873--98922538
75
9.0
75
86
4
845
29
16
20
33
1.95
98921873--98922538
147
4.5
148
87
4
855
29
16
20
33
1.95
98921873--98922538
220
3.0
221
91
4
979
29
16
20
33
1.95
98922609--98922641
14
2.4
14
94
0
57
18
12
6
63
1.48
98922507--98922999
91
5.3
90
75
10
372
26
16
17
39
1.91
98922466--98922799
184
1.8
177
84
6
447
28
17
18
35
1.94
98922711--98922901
102
1.8
103
87
5
287
28
15
17
39
1.90
98922839--98923066
87
2.6
87
81
4
246
30
15
19
34
1.93
98923684--98923779
30
3.3
29
91
4
149
26
48
6
18
1.71
98924261--98924390
23
5.5
24
71
14
56
35
5
3
56
1.38
98924261--98924312
24
2.2
23
83
10
61
36
3
0
59
1.16
98924338--98924507
25
6.8
25
71
12
89
33
6
4
55
1.44
98924380--98924469
22
3.9
23
77
9
85
31
6
5
56
1.48
98924329--98924469
23
5.9
22
73
12
84
32
7
4
55
1.49
98928614--98928649
6
6.0
6
93
0
63
52
0
0
47
1.00
98928612--98928654
18
2.3
19
88
8
70
53
4
0
41
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98928652--98928691
21
1.9
21
85
10
55
47
5
7
40
1.54
98929654--98929710
24
2.4
24
96
0
105
8
12
19
59
1.58
98930896--98930929
14
2.4
14
90
0
50
58
0
14
26
1.36
98930849--98931179
85
3.9
86
76
14
286
38
19
15
26
1.91
98930852--98931165
166
1.9
164
82
13
390
38
20
15
26
1.92
98931163--98931198
17
2.1
18
89
5
56
61
5
11
22
1.50
98934395--98934538
22
6.3
23
69
18
72
56
4
5
33
1.41
98934713--98934753
21
2.0
20
85
4
55
56
7
2
34
1.40
98934762--98934871
54
2.0
53
81
8
123
61
3
4
30
1.33
98935078--98935115
19
2.0
20
89
5
60
63
0
7
28
1.23
98934982--98935172
15
13.3
15
66
23
51
58
2
7
31
1.38
98940902--98940954
26
2.0
26
82
7
63
24
15
20
39
1.91
98952489--98952530
15
2.9
15
85
3
50
64
2
0
33
1.07
98952476--98952562
7
12.1
7
68
13
52
65
3
2
28
1.21
98952593--98952630
3
13.3
3
88
5
53
68
0
2
28
1.03
98953306--98953339
10
3.5
10
92
4
52
20
0
0
79
0.73
98962146--98962209
3
21.0
3
90
9
103
64
1
1
32
1.13
98962427--98962472
3
15.3
3
86
0
56
71
0
2
26
0.97
98963112--98963152
10
4.2
10
84
6
57
24
0
0
75
0.80
98963112--98963158
11
4.4
12
84
15
52
27
0
0
72
0.85
98963112--98963158
10
4.5
11
89
5
53
27
0
0
72
0.85
98963596--98963633
15
2.4
16
86
4
51
7
2
42
47
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98964629--98964679
27
1.9
26
84
4
66
58
1
3
35
1.28
98964803--98964853
17
2.9
17
72
13
50
60
1
7
29
1.36
98967154--98967203
19
2.6
20
87
6
68
46
4
20
30
1.69
98971362--98971475
27
4.3
26
73
11
88
54
2
8
34
1.45
98971382--98971484
52
2.0
53
84
5
138
52
2
8
35
1.47
98973726--98973750
1
25.0
1
100
0
50
0
0
0
100
0.00
98986169--98986208
19
2.1
19
100
0
80
30
17
27
25
1.97
98987702--98987855
17
8.6
17
83
9
191
38
9
14
37
1.79
98987697--98987855
36
4.4
36
87
8
234
38
9
14
37
1.79
98987702--98987855
54
2.9
54
96
0
274
38
9
14
37
1.79
98987697--98987855
19
8.8
19
85
10
235
38
9
14
37
1.79
98987834--98987878
23
2.0
22
82
4
54
40
4
17
37
1.70
98990562--98990595
17
2.0
17
100
0
68
35
41
0
23
1.55
99001315--99001356
20
2.0
22
90
9
70
28
4
14
52
1.62
99002144--99002173
5
6.0
5
100
0
60
80
0
0
20
0.72
99016222--99016322
50
2.0
50
98
0
193
27
34
15
21
1.94
99022421--99022455
15
2.5
13
83
16
52
77
0
14
8
0.99
99022430--99022483
15
3.3
18
85
14
66
74
0
14
11
1.08
99027900--99027931
14
2.3
14
94
0
55
31
43
15
9
1.78
99033021--99033052
14
2.3
14
100
0
64
31
46
15
6
1.71
99033954--99033978
12
2.1
12
100
0
50
24
36
24
16
1.94
99034139--99034219
9
8.6
9
91
5
117
37
30
9
22
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99034226--99034286
17
3.4
17
68
12
50
52
13
1
32
1.50
99034243--99034306
20
3.3
20
68
12
62
45
15
4
34
1.67
99034220--99034332
37
3.1
37
94
1
192
47
15
4
32
1.65
99034373--99034431
24
2.5
24
88
0
91
30
25
0
44
1.55
99037489--99037522
16
2.1
16
94
0
59
50
8
0
41
1.34
99038418--99038458
17
2.5
17
92
4
66
24
4
34
36
1.77
99050209--99050264
27
2.0
29
83
10
73
26
1
21
50
1.59
99054916--99054953
3
12.7
3
100
0
76
65
0
0
34
0.93
99054991--99055064
30
2.4
30
76
8
78
48
4
6
40
1.48
99055293--99055393
53
1.9
51
92
7
168
52
6
2
37
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332