Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12172527--12172680
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0
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12184116--12184174
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1.94
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12191047--12191158
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4.1
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6
115
36
22
23
17
1.95
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50
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2.0
25
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2.5
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2.4
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2.2
16
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0
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25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.1
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19
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18
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16
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16
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19
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1
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12294035--12294172
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2
2
42
1.25
12294072--12294176
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2.5
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6
122
53
1
1
42
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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2.2
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44
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23
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44
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23
15
1.86
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2.5
26
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40
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20
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2.2
16
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24
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19
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0.75
12361521--12361570
24
2.2
22
85
7
64
14
0
2
84
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12368080--12368141
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4.1
15
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16
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64
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0
25
1.24
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2.1
46
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0
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40
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18
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1.77
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17
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2
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70
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2
0
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0
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0
0
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18
2.1
18
85
9
51
68
0
10
21
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12391532--12391583
19
2.7
20
85
11
72
28
3
0
67
1.08
12391532--12391583
20
2.7
20
82
11
63
28
3
0
67
1.08
12391532--12391591
20
3.0
20
73
17
54
31
3
0
65
1.09
12391924--12391948
11
2.3
11
100
0
50
56
0
0
44
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2
26
9
1.39
12407693--12407737
22
2.0
22
100
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90
31
24
8
35
1.86
12408081--12408261
97
1.9
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4
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35
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1.84
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49
2.0
49
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0
187
43
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24
1.85
12409996--12410075
25
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25
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1.88
12416289--12416315
7
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7
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0
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32
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12419149--12419200
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2.5
21
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30
32
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26
1.89
12420895--12420953
30
2.0
30
86
0
82
22
10
6
61
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12421183--12421226
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2.4
19
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34
0
0
65
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20
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34
2
0
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1.08
12421193--12421264
14
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12
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16
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33
2
0
63
1.08
12421196--12421268
27
2.4
30
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19
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2
0
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1.10
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2.5
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3
0
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1.13
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0
0
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0
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1.22
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0
0
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0
0
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0
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117
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28
1.97
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28
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1.65
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1.9
20
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2.6
25
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2
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1.29
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12.1
7
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14
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1.21
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2.4
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2
1
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14
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23
5
2
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34
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1.84
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3.0
28
82
7
96
20
23
21
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12452571--12452685
55
2.1
56
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8
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21
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1.94
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1
0
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1.09
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10
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1
0
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0
0
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12453683--12453740
16
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1
0
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15
2.5
16
87
12
53
21
24
10
43
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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