Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  117  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37839229--37839362
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50
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2.0
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37858087--37858281
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227
24
17
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204
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16
18
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1.92
37861427--37861603
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21
41
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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27
2.2
27
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1.92
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37875030--37875127
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135
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1.94
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37878730--37878790
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1.8
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265
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22
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3
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65
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4
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37921466--37921551
29
2.9
29
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20
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17
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43
73
11
190
27
22
17
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1.96
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180
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17
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1.96
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2.6
139
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3
555
19
22
19
38
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
1
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2.2
22
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14
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29
2.4
29
90
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108
1
12
1
84
0.76
37925127--37925189
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3.5
17
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81
0
11
1
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24
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29
29
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1144
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1154
32
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29
29
1.87
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2.1
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25
18
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25
1.98
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1.96
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904
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29
28
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37965695--37966236
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236
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28
1.87
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2.1
37
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115
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18
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25
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22
27
27
1.99
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24
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0
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13
38
1.91
37981756--37981896
31
4.5
31
85
0
183
26
25
17
30
1.97
37981889--37982001
33
3.5
32
83
9
131
27
22
12
38
1.90
37981902--37982001
33
3.1
33
88
4
132
28
22
13
37
1.91
37985987--37986092
56
1.9
56
94
0
185
24
15
31
29
1.95
37985987--37986092
28
3.8
28
91
0
167
24
15
31
29
1.95
37988541--37988713
46
3.7
46
80
13
219
21
21
28
28
1.98
37988538--37988708
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
38001768--38001794
11
2.5
11
100
0
54
25
11
29
33
1.91
38003444--38003496
27
2.0
27
92
0
88
41
3
13
41
1.62
38026927--38027173
45
5.6
45
87
4
306
23
21
29
25
1.99
38033776--38033916
38
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38
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0
219
21
22
24
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1.98
38035225--38035328
48
2.2
48
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6
122
29
22
30
17
1.96
38038578--38038794
108
2.0
108
100
0
434
40
8
21
29
1.82
38040552--38040724
46
3.7
46
77
13
201
22
21
27
28
1.99
38040549--38040719
93
1.8
93
94
0
306
22
21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38048119--38048290
46
3.8
45
80
11
215
21
21
27
29
1.99
38048116--38048285
92
1.8
92
96
0
313
21
21
28
28
1.99
38049849--38050121
38
7.1
38
89
2
384
22
21
24
30
1.99
38049849--38050103
116
2.2
116
90
2
408
22
22
25
29
1.99
38055888--38055965
39
2.0
39
100
0
156
56
5
2
35
1.35
38059437--38059510
37
2.0
37
100
0
148
32
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13
27
1.94
38063444--38063565
46
2.5
48
84
5
149
28
22
13
35
1.92
38069599--38069720
46
2.6
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138
26
22
14
36
1.93
38072399--38072477
28
2.8
28
82
0
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29
26
11
32
1.91
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2.8
10
100
0
56
60
0
7
32
1.24
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6
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6
76
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77
0
5
17
0.95
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17
3.7
17
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13
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69
1
10
18
1.25
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10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
38085695--38085756
27
2.3
26
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70
51
11
0
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1.38
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22
1.9
22
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57
0
2
40
1.12
38105362--38105750
50
7.8
50
80
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396
27
20
29
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1.98
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16
2.1
16
100
0
68
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5
23
29
1.78
38113435--38113558
45
2.7
46
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7
162
21
32
17
28
1.96
38113431--38113603
45
3.7
46
79
13
144
22
28
19
29
1.98
38118955--38119125
27
6.3
27
86
4
238
27
25
8
39
1.84
38118955--38119125
54
3.2
54
91
1
272
27
25
8
39
1.84
38119157--38119280
27
4.6
27
79
6
126
41
21
8
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38119115--38119256
54
2.7
53
76
10
137
36
21
12
29
1.90
38119157--38119337
54
3.3
53
79
5
157
41
19
8
30
1.81
38119292--38119343
27
1.9
27
88
7
79
40
13
11
34
1.81
38119157--38119363
110
1.9
108
81
2
252
40
20
9
30
1.83
38119384--38119457
27
2.7
27
76
12
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37
20
20
21
1.94
38120249--38120318
25
2.8
25
88
0
95
28
24
21
25
1.99
38120538--38120651
31
3.7
31
94
2
187
28
15
27
28
1.96
38122021--38122053
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2.1
16
100
0
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12
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12
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1.78
38127642--38127705
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2.0
32
85
11
87
37
18
7
35
1.80
38133595--38133826
126
1.8
129
84
9
323
38
11
31
18
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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