Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  241  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.63
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36
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0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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21
3.5
21
79
11
94
32
0
19
47
1.50
80366400--80366487
39
2.3
39
93
0
149
32
0
21
45
1.52
80367658--80367959
64
4.7
64
95
0
523
47
3
10
38
1.57
80372130--80372165
17
2.2
17
95
5
65
72
5
0
22
1.05
80372543--80372609
29
2.3
28
75
12
64
38
35
1
23
1.64
80372546--80372627
22
3.8
22
77
6
78
37
35
1
25
1.64
80372429--80372640
80
2.6
79
81
4
253
36
36
1
25
1.67
80372843--80372880
16
2.6
14
91
8
58
47
31
0
21
1.51
80373112--80373165
14
3.8
14
73
11
56
24
3
24
48
1.67
80373110--80373164
28
1.9
29
88
3
85
25
3
23
47
1.68
80373355--80373400
17
2.7
17
100
0
92
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10
4
17
1.37
80373355--80373402
6
8.3
6
79
9
55
66
10
4
18
1.37
80373355--80373402
11
4.2
12
78
7
55
66
10
4
18
1.37
80373806--80374145
153
2.2
154
86
5
474
26
24
21
27
1.99
80386394--80386569
46
3.8
45
76
10
185
21
20
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80386393--80386561
93
1.8
93
89
0
266
21
20
29
28
1.98
80388014--80388218
40
5.2
40
94
1
342
26
27
21
23
1.99
80393897--80393962
26
2.3
29
82
12
75
19
12
1
66
1.31
80398210--80398384
93
1.9
92
80
10
205
27
26
19
26
1.99
80400420--80400541
43
2.9
42
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7
165
28
27
15
28
1.96
80404609--80404675
29
2.4
29
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5
102
31
5
8
53
1.56
80404810--80404858
26
1.9
26
84
12
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44
18
8
28
1.78
80405328--80405368
9
4.8
9
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0
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2
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0.82
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0
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0
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43
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24
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27
1.99
80436162--80436210
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2.6
18
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53
12
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33
2.4
33
80
8
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26
21
15
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1.93
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16
2.2
16
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10
54
28
11
2
57
1.48
80444900--80444954
29
1.9
29
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3
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34
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1.94
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21
2.0
20
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5
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47
27
0
25
1.52
80447090--80447168
37
2.1
37
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0
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24
1.98
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10.7
47
94
1
840
28
29
8
33
1.87
80449918--80450037
56
2.1
56
98
0
231
22
23
9
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1.81
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35
1.9
35
82
5
84
27
22
26
23
1.99
80457429--80457477
24
1.9
27
88
12
77
65
4
2
28
1.22
80477087--80477262
46
3.8
46
77
15
209
21
20
29
28
1.98
80477084--80477253
93
1.8
93
94
0
304
21
20
30
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80480218--80480282
15
4.4
15
84
9
89
10
15
12
61
1.56
80482666--80482839
45
3.8
44
79
9
197
21
20
29
28
1.98
80485878--80485917
21
2.0
20
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5
53
47
27
0
25
1.52
80488906--80488981
34
2.2
34
83
0
89
25
22
23
28
1.99
80489224--80489258
18
2.0
18
88
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54
20
0
11
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1.20
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4.2
6
100
0
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0
0
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0.63
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15
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0
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2
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1.41
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12
100
0
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1.96
80530633--80530696
21
3.0
21
76
2
65
21
28
15
34
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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