Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  246  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81843175--81843229
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1.9
28
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3
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21
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29
1.99
81844795--81845037
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20
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2.1
133
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20
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1.99
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131
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3
342
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19
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1.95
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19
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1.8
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21
32
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2.3
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19
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0
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0
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81883268--81883329
19
3.2
19
95
4
106
35
17
9
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
1.96
81883866--81884007
43
3.3
43
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205
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30
15
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1.94
81891385--81891423
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2.1
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2.2
22
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81916020--81916188
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23
22
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1.95
81920893--81921061
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1.8
93
91
0
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1.98
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3.7
46
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201
20
20
28
29
1.98
81928450--81928620
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1.8
93
96
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315
20
21
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1.98
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4.1
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81941933--81942268
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3.8
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12
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3.9
21
67
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62
14
37
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20
1.92
81944972--81945066
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2.2
43
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2.7
20
97
0
99
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22
14
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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83
2
50
14
4
2
78
1.01
81959306--81959330
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1.9
13
100
0
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0
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4.5
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84
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185
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18
19
32
1.95
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227
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18
19
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1.96
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12
69
19
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1
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21
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3
62
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1.94
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1.99
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189
27
27
19
25
1.99
82030302--82030432
40
3.3
40
88
2
192
29
27
19
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82030305--82030485
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27
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1.99
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27
21
25
2.00
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219
27
27
20
23
1.99
82038128--82038311
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4.6
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196
28
27
20
23
1.99
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44
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15
24
26
1.95
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17
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27
1.97
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44
7.9
44
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8
253
31
16
25
26
1.97
82041877--82042112
128
1.8
130
81
9
293
31
17
25
26
1.97
82042096--82042274
80
2.3
78
82
3
207
31
18
22
27
1.97
82042096--82042297
79
2.6
78
79
3
217
31
18
23
26
1.97
82043039--82043068
16
1.9
15
93
6
51
3
6
10
80
1.01
82043721--82043787
21
3.4
20
78
8
57
40
4
0
55
1.20
82043779--82043818
13
3.0
14
82
17
50
35
2
0
62
1.09
82043789--82043880
24
4.1
22
72
16
64
31
4
5
58
1.40
82048796--82049087
27
10.9
27
80
3
313
28
22
8
40
1.83
82049097--82049291
27
7.2
27
84
4
250
35
17
19
27
1.94
82048802--82049101
106
2.8
104
83
7
252
28
21
9
40
1.84
82049097--82049290
81
2.4
81
87
0
280
36
17
19
27
1.94
82049495--82049570
27
2.8
27
86
4
100
21
21
19
38
1.94
82049668--82049719
22
2.4
22
80
0
59
21
25
21
32
1.98
82049859--82049925
27
2.6
25
78
19
66
17
20
22
38
1.93
82049876--82049933
27
2.1
28
81
15
77
15
18
27
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82050075--82050225
6
24.8
6
72
17
116
21
17
13
48
1.80
82050075--82050214
61
2.3
61
86
4
185
21
17
13
47
1.81
82053029--82053071
22
2.0
22
86
9
61
74
2
2
20
1.04
82053997--82054070
37
2.0
37
82
15
91
41
24
8
25
1.82
82058520--82058567
21
2.3
21
100
0
96
27
14
4
54
1.59
82074848--82074886
18
2.0
20
90
9
64
20
2
15
61
1.45
82075504--82075690
40
4.8
39
79
7
173
20
29
16
33
1.95
82075536--82075606
37
1.9
36
85
2
97
16
32
21
29
1.95
82075613--82075678
20
3.3
20
70
8
62
22
30
16
30
1.96
82075716--82075766
24
2.3
21
75
18
57
43
3
15
37
1.66
82075727--82075775
24
2.0
24
100
0
98
46
0
16
36
1.47
82076511--82076694
65
2.8
65
85
7
223
26
26
25
21
2.00
82101167--82101220
27
2.0
27
85
0
72
38
14
5
40
1.70
82110356--82110442
43
2.0
42
84
6
113
29
28
16
25
1.96
82117847--82117888
15
2.9
15
80
13
52
16
7
28
47
1.73
82150533--82151116
205
2.8
205
94
0
1008
28
21
18
31
1.97
82159506--82159669
45
3.6
45
77
17
178
20
21
30
27
1.98
82162500--82162577
14
5.4
15
77
10
74
10
15
14
60
1.59
82170620--82170653
18
1.9
17
88
5
50
58
5
2
32
1.37
82171100--82171155
5
11.4
5
74
11
53
60
0
1
37
1.07
82171184--82171253
26
2.8
24
75
10
68
48
0
4
47
1.21
82171192--82171270
24
3.2
24
75
8
70
54
0
3
41
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82173758--82173849
28
3.3
28
80
8
89
2
30
7
59
1.37
82180030--82180113
28
3.0
27
75
6
87
2
26
7
64
1.32
82180393--82180446
28
1.9
28
88
0
81
3
29
1
64
1.21
82181591--82181678
28
3.2
28
79
10
101
5
27
4
62
1.37
82183515--82183737
40
5.6
40
91
0
347
22
28
21
27
1.99
82187803--82187917
29
4.0
28
70
9
79
25
31
14
28
1.95
82194920--82195034
29
4.0
28
71
9
88
26
30
14
28
1.95
82195249--82195291
16
2.7
16
88
0
59
11
20
16
51
1.75
82204379--82204500
43
2.9
41
79
7
145
27
23
18
30
1.97
82206699--82206796
28
3.5
27
85
4
106
5
23
4
67
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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