Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  205  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68208186--68208219
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0
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0
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1.17
68208182--68208219
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63
0
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1.17
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1.98
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2.9
144
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2
556
28
19
29
22
1.98
68215377--68215797
48
8.8
48
72
9
279
28
19
29
22
1.98
68217786--68217849
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2.0
32
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22
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0
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1.09
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2.2
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19
21
28
1.97
68254965--68255265
44
6.9
42
71
14
180
30
19
21
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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135
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316
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27
1.98
68255374--68255479
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2.4
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1
124
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16
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1.97
68255815--68255849
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1.9
18
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12
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3.9
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68263433--68263469
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68263399--68263463
21
3.0
21
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2
67
32
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68265335--68265369
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18
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20
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2.6
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1.22
68267186--68267258
29
2.6
28
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1
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1.22
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136
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18
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29
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2.5
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4.5
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9
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30
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2.5
174
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597
46
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12
31
1.74
68284985--68285259
87
3.2
87
73
13
276
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9
12
31
1.74
68285926--68285976
20
2.7
19
85
8
68
60
7
1
29
1.36
68289299--68289343
20
2.1
22
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2.1
18
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56
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0
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33
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
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41
0
25
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1.55
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3.1
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0
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133
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520
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18
24
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18
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1.94
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19
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1.94
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2.0
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1.96
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1.96
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142
2.3
141
80
3
360
21
15
25
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68326044--68326753
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1.9
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23
34
1.95
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2.4
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5
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20
1.48
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63
5
10
21
1.46
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18
2.4
18
84
7
52
67
2
4
25
1.22
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2.1
21
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0
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64
0
24
11
1.26
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20
81
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65
0
21
13
1.26
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13
1.9
13
100
0
50
16
4
16
64
1.44
68331046--68331300
140
1.8
140
84
7
347
29
17
29
23
1.97
68331042--68331401
47
7.6
47
74
13
239
26
17
30
25
1.97
68334342--68334368
5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
68336088--68336234
49
2.9
51
80
4
181
25
18
23
31
1.97
68342294--68342434
75
1.9
75
85
2
194
29
13
12
45
1.79
68348011--68348085
40
1.9
40
83
8
100
32
8
16
44
1.76
68348026--68348085
20
3.0
20
80
0
75
31
8
16
43
1.78
68348144--68348200
28
2.0
28
96
0
105
38
15
0
45
1.47
68349734--68349800
33
2.0
33
94
0
116
37
0
31
31
1.58
68353333--68353387
20
2.8
20
85
0
65
32
10
10
45
1.74
68367162--68367230
30
2.3
30
97
0
129
21
36
23
18
1.95
68368453--68368712
47
5.5
45
72
14
154
27
20
29
22
1.98
68368362--68368712
94
3.7
94
75
8
302
27
20
28
23
1.99
68368497--68368712
49
4.6
46
75
11
154
27
20
28
23
1.99
68369464--68369594
55
2.4
55
82
5
149
23
25
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68372652--68372703
27
1.9
27
96
0
95
44
21
9
25
1.82
68379455--68379762
153
2.0
153
98
0
589
39
11
17
31
1.85
68381408--68381579
93
1.8
93
90
2
274
27
30
20
20
1.98
68381400--68381574
46
3.8
45
77
10
183
28
30
20
20
1.98
68382959--68383043
20
4.2
20
80
4
100
30
4
14
50
1.63
68382959--68383064
40
2.6
41
80
5
126
32
4
12
50
1.60
68387316--68387357
16
2.7
15
85
7
57
71
14
7
7
1.29
68388589--68388630
13
3.1
14
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10
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73
4
0
21
1.01
68390771--68391111
185
1.8
185
89
2
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43
16
12
27
1.84
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123
2.0
123
84
6
328
38
6
5
49
1.52
68414302--68414350
25
2.0
25
87
0
71
36
22
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26
1.92
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21
3.7
20
80
1
73
33
14
15
36
1.88
68414390--68414464
11
7.1
11
76
7
66
34
14
14
36
1.87
68414395--68414450
10
5.4
10
77
8
58
33
12
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35
1.88
68414497--68414565
25
2.8
25
86
0
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24
21
23
30
1.99
68414522--68414594
25
3.0
25
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71
27
19
21
31
1.97
68415612--68415664
26
2.0
26
88
0
79
28
11
7
52
1.64
68424085--68424199
44
2.6
44
92
0
194
26
15
23
33
1.95
68424157--68424283
56
2.3
56
88
2
193
22
13
28
36
1.92
68438038--68438240
45
4.6
45
83
7
217
28
22
22
27
1.99
68439770--68439795
13
2.0
13
100
0
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15
0
0
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0.62
68448531--68448565
16
2.2
16
89
0
52
51
0
2
45
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68457169--68457274
39
2.8
40
83
8
123
22
16
21
38
1.93
68466723--68466775
22
2.4
22
87
0
61
52
5
1
39
1.36
68472170--68472208
19
2.1
18
85
4
51
79
2
5
12
1.00
68473696--68473821
28
4.6
27
85
5
148
27
15
28
28
1.96
68473697--68473821
54
2.3
57
83
9
161
28
15
28
28
1.96
68476314--68476362
19
2.5
20
83
6
57
46
10
20
22
1.80
68482787--68482965
40
4.5
41
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206
29
26
21
22
1.99
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2.0
20
85
0
53
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10
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39
4.1
39
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3
246
27
24
21
26
1.99
68511079--68511253
46
3.8
45
78
13
205
21
20
28
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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