Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.8
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1
451
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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3
68
36
28
3
30
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15809605--15809722
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1.81
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18
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14
216
45
15
3
36
1.64
15815521--15815858
30
11.5
30
65
21
139
45
14
3
36
1.63
15815571--15815726
46
3.3
46
84
6
204
44
16
4
34
1.67
15815499--15815773
9
30.2
9
65
15
57
45
15
3
35
1.64
15815631--15815810
81
2.2
81
95
0
324
46
13
3
36
1.62
15815700--15815926
51
4.6
51
93
5
371
47
13
3
36
1.58
15815788--15815825
9
4.3
9
83
3
51
44
13
2
39
1.57
15815589--15815858
132
2.1
127
92
3
441
45
13
4
36
1.63
15815844--15816018
16
10.9
16
73
10
142
49
16
2
31
1.60
15815722--15816018
100
3.0
98
85
7
193
48
14
3
34
1.60
15815893--15815956
9
7.6
9
79
13
82
50
18
0
31
1.48
15822146--15822208
30
2.1
30
93
0
108
26
1
12
58
1.43
15822943--15822981
18
2.2
17
86
4
51
43
0
5
51
1.24
15823839--15823876
15
2.3
16
86
13
51
5
13
5
76
1.13
15824076--15824115
21
1.9
21
84
0
53
72
2
12
12
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15824270--15824320
15
3.5
15
82
15
70
60
0
0
39
0.97
15827486--15827523
20
1.9
20
84
10
51
42
5
5
47
1.48
15835428--15835461
16
2.2
16
89
5
52
61
2
2
32
1.26
15837260--15837522
40
6.6
40
87
3
316
24
20
28
26
1.99
15837299--15837557
80
3.3
80
84
3
238
25
20
28
25
1.99
15845204--15845466
40
6.6
40
87
3
316
24
20
28
26
1.99
15845243--15845501
80
3.3
80
84
3
238
25
20
28
25
1.99
15852172--15852285
48
2.4
48
83
2
151
29
21
14
34
1.93
15853683--15853751
20
3.5
20
82
7
95
20
21
20
37
1.94
15853737--15853798
21
3.0
21
68
13
56
19
22
22
35
1.96
15855154--15855449
99
3.0
99
94
1
515
32
16
15
35
1.90
15856016--15856047
14
2.4
14
90
10
50
65
0
6
28
1.16
15856029--15856072
6
7.0
6
80
10
52
75
0
0
25
0.81
15856030--15856075
20
2.4
19
89
7
74
73
0
0
26
0.83
15857117--15857178
31
2.0
31
100
0
124
41
25
9
22
1.84
15863035--15863082
18
2.6
19
87
6
64
33
0
6
60
1.22
15863050--15863121
28
2.6
27
81
12
85
37
2
2
56
1.28
15864514--15864552
13
3.0
13
85
11
53
25
2
5
66
1.25
15869430--15869607
46
3.8
46
77
4
196
28
28
20
21
1.98
15869437--15869608
93
1.8
93
91
0
281
27
29
20
22
1.99
15873994--15874019
10
2.6
10
100
0
52
23
7
0
69
1.14
15874326--15874372
17
2.8
17
78
12
60
46
44
0
8
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15877782--15877820
13
3.0
13
85
11
53
25
2
5
66
1.25
15884139--15884166
14
2.0
14
100
0
56
28
14
7
50
1.69
15886639--15886667
10
2.7
11
89
10
51
55
0
0
44
0.99
15886796--15886835
16
2.5
15
84
11
53
25
0
2
72
0.97
15896554--15896580
2
13.5
2
100
0
54
51
48
0
0
1.00
15899649--15899681
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
15899728--15899786
21
2.8
22
80
7
61
22
0
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69
1.15
15899757--15899806
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2.0
24
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73
30
0
6
64
1.18
15900107--15900161
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2.0
27
100
0
110
34
10
14
40
1.81
15904359--15904409
17
3.4
17
65
30
51
43
9
7
39
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332