Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11027430--11027521
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42
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0
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0
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0
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3.4
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141
29
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27
27
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1.99
11050995--11051117
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2.6
49
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162
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11072355--11072410
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32
1.03
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2
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54
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3.4
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26
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2.00
11087780--11087933
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3.7
41
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3
200
33
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21
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.04
11104172--11104218
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2.2
21
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78
10
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8
1.04
11111318--11111542
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4.7
47
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1.88
11111318--11111542
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1.88
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2.1
37
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25
18
30
25
1.98
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0
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5
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1.61
11120419--11120499
39
2.1
39
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112
54
12
6
27
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2.4
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22
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21
2.9
21
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5
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2.0
13
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17
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26
1
1
70
1.04
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2.2
23
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21
13
33
1.92
11155965--11156121
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220
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21
12
34
1.91
11167966--11168029
22
3.0
21
79
4
74
28
31
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
1.70
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42
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15
1.62
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0
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22
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26
1.96
11222187--11222298
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32
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1.97
11222420--11222535
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2.8
41
77
2
117
32
20
17
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11222131--11222605
237
2.0
237
99
0
932
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20
17
31
1.96
11222818--11222893
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2.7
28
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0
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0
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1.48
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12.3
18
74
10
162
47
12
0
38
1.48
11229659--11229906
123
2.0
123
86
3
347
47
12
1
38
1.49
11229699--11229908
114
1.8
114
82
4
271
48
12
0
38
1.48
11229718--11229922
35
5.8
35
77
7
175
47
12
0
38
1.48
11229709--11229958
114
2.2
114
78
7
249
47
13
1
38
1.52
11235931--11236032
43
2.4
43
81
6
109
27
25
19
27
1.99
11246371--11246482
31
3.8
31
72
15
110
29
15
8
46
1.76
11247625--11247689
24
2.7
23
73
15
60
56
0
0
43
0.99
11249581--11249634
20
2.7
19
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16
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3
7
25
1.38
11256249--11256279
12
2.6
12
94
0
53
38
0
6
54
1.26
11256411--11256476
29
2.2
30
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2
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40
12
28
18
1.86
11256462--11256524
30
2.1
30
84
0
81
36
17
19
26
1.94
11256522--11256600
29
2.7
29
80
11
88
45
12
22
18
1.84
11256533--11256600
29
2.3
30
87
2
93
44
13
26
16
1.84
11256381--11256614
119
2.0
119
84
1
308
37
15
24
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11267831--11267925
47
2.0
47
100
0
190
40
17
6
35
1.76
11275364--11275389
6
4.3
6
100
0
52
15
15
34
34
1.89
11277922--11277959
3
12.7
3
100
0
76
65
0
0
34
0.93
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23
2.0
20
86
13
59
32
0
2
65
1.06
11280178--11280230
22
2.3
23
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9
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52
9
1
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1.45
11281424--11281460
18
2.1
18
89
0
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29
16
29
24
1.96
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20
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19
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10
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1.69
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11
3.0
12
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12
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58
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17
8
1.61
11289775--11289819
5
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5
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2
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0
17
2
0.82
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2.3
98
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10
269
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1
16
40
1.59
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15
2.0
15
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0
51
16
0
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1.47
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4.3
126
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2
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18
21
26
1.96
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3.3
116
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0
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47
8
3
39
1.52
11295224--11295523
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5.1
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20
218
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3
41
1.52
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18
2.4
18
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0
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44
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27
16
1.82
11296091--11296155
30
2.2
30
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6
18
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29
1.73
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7
3.9
7
100
0
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59
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0
25
1.36
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14
2.4
14
90
0
50
64
8
0
26
1.22
11297783--11297813
15
2.1
15
93
0
53
70
0
6
22
1.09
11297840--11297892
20
2.5
22
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14
76
39
0
30
30
1.57
11297840--11297887
11
4.5
11
82
10
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39
0
29
31
1.57
11297840--11297903
31
2.1
31
82
5
76
40
0
28
31
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11300996--11301025
15
2.0
15
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0
51
50
0
10
40
1.36
11300992--11301054
27
2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
11302357--11302407
21
2.5
20
90
9
84
0
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19
25
1.44
11302963--11303000
19
2.1
18
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9
51
52
0
7
39
1.31
11307917--11307992
9
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9
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8
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31
0
19
48
1.49
11308961--11309102
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2.7
53
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2
214
29
27
17
25
1.97
11313339--11313489
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2.8
53
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4
214
29
27
16
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1
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1.96
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15
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0
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0
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40
1.27
11320687--11320748
28
2.2
28
86
11
92
33
8
40
17
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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