Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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86
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1.93
Indices
Period
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Number
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Indels
Score
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Period
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27
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9611538--9611579
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3.3
17
75
11
55
38
5
0
55
1.22
9625958--9625984
13
2.1
13
100
0
54
77
0
7
14
0.97
9626225--9626258
11
3.3
11
84
16
54
50
0
0
50
1.00
9626420--9626454
18
1.9
18
88
0
52
77
2
5
14
1.07
9630270--9632004
3
579.7
3
88
0
2499
60
0
5
33
1.21
9633090--9633131
22
1.9
22
85
9
59
80
2
16
0
0.81
9633090--9633131
11
3.8
11
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9
50
80
2
16
0
0.81
9634815--9634867
17
3.4
17
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20
51
18
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32
7
1.79
9634819--9634888
30
2.3
30
100
0
140
20
37
32
10
1.85
9635660--9635711
18
2.8
18
86
11
70
50
0
25
25
1.50
9635660--9635707
19
2.5
19
90
6
71
52
0
25
22
1.48
9642841--9642935
46
2.0
47
93
2
165
32
23
5
38
1.77
9643718--9643787
34
2.1
34
97
0
131
44
8
4
42
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9645234--9645275
19
2.2
19
86
0
57
52
2
19
26
1.58
9646436--9646498
22
2.8
22
87
4
90
46
23
1
28
1.62
9654665--9654844
49
3.7
48
80
8
177
25
20
29
24
1.99
9654615--9654799
50
3.9
49
81
10
186
28
20
27
24
1.99
9654620--9654844
49
4.7
47
75
13
167
25
20
29
24
1.99
9671593--9671955
46
7.7
47
72
11
201
27
18
30
23
1.98
9674397--9674479
42
2.0
41
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32
24
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1.94
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1.98
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48
4.5
48
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249
25
20
26
27
1.99
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2.4
17
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58
0
2
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1.12
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40
2.0
40
100
0
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19
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2.6
13
100
0
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0
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1.26
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22
2.1
22
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60
40
6
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36
1.75
9705836--9705879
19
2.4
18
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7
70
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9
2
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8
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42
7
2
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9711133--9711432
164
1.8
162
93
2
521
32
19
20
28
1.97
9717911--9718033
54
2.3
54
78
2
140
26
19
28
26
1.99
9719278--9719336
19
3.1
19
82
9
75
45
0
1
52
1.10
9719282--9719340
21
3.0
20
82
9
77
45
0
1
52
1.10
9724483--9724519
18
2.1
19
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10
51
16
43
29
10
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9726065--9726094
7
4.3
7
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0
51
30
40
13
16
1.87
9728542--9728717
46
3.8
45
77
11
187
22
20
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9728538--9728709
93
1.8
93
91
2
283
22
20
29
27
1.99
9734484--9734528
23
2.0
23
81
0
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48
0
2
48
1.13
9736655--9736774
51
2.4
51
91
0
186
26
23
13
36
1.92
9737997--9738061
27
2.3
29
80
15
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1
1
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100
0
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0
7
0
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0.38
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0
13
4
0.82
9753294--9753338
13
3.5
13
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0
13
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4.0
13
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12
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1
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0
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0
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23
2.0
24
84
4
62
6
6
8
79
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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