Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  263  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88025300--88025403
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132
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48
80
13
173
28
18
29
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.98
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67
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1.11
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0
0
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17
20
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3.3
96
79
6
307
33
16
19
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.26
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2
0
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77
55
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32
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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0.98
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85
15
8
0
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3.1
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27
2
2
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1.11
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15
0
0
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0.63
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16
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0
76
1.00
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6
14.7
6
80
11
83
17
4
0
78
0.92
88190419--88190490
35
2.1
34
84
7
92
18
5
0
76
0.97
88190406--88190485
30
2.6
30
79
14
101
17
5
0
77
0.94
88191800--88191842
8
5.4
8
81
10
52
83
2
2
11
0.83
88192409--88192470
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
88192633--88194279
828
2.0
828
99
0
3258
26
20
17
36
1.94
88194417--88194670
88
2.9
87
92
2
418
31
20
25
22
1.98
88194421--88194660
44
5.5
44
65
8
148
30
21
25
22
1.98
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21
2.0
22
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9
59
34
2
4
58
1.32
88197264--88197308
23
1.9
23
90
4
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24
0
13
62
1.31
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28
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19
33
1.95
88207152--88207196
16
2.7
17
82
6
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15
4
4
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1.12
88210427--88210499
15
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15
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4
1
61
1.23
88210415--88210466
22
2.5
20
79
11
68
25
0
1
73
0.94
88210497--88210547
16
3.1
16
85
5
66
29
0
1
68
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88210524--88210573
14
3.4
14
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5
55
16
4
2
78
1.00
88212446--88212506
30
2.0
30
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0
86
21
34
27
16
1.95
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46
6.7
49
74
12
216
24
30
18
26
1.98
88214173--88214479
94
3.3
92
75
12
241
24
29
17
27
1.98
88218515--88218562
23
2.1
23
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0
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0
31
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1.53
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38
2.1
38
100
0
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0
20
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2
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1.99
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19
23
21
1.95
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1
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19
22
22
1.96
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130
1.9
130
90
0
395
33
19
23
23
1.97
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174
2.9
174
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465
35
20
22
21
1.96
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2.5
14
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0
61
48
0
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1.26
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30
2.2
30
83
8
80
35
6
7
50
1.56
88248735--88248812
38
2.1
38
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0
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34
12
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37
1.86
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49
2.0
49
91
0
156
30
19
19
30
1.97
88262318--88262399
23
3.5
23
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3
110
19
24
15
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1.91
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73
2.0
73
100
0
298
41
14
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22
1.89
88270344--88270409
28
2.3
30
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5
82
39
16
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40
1.64
88270388--88270470
36
2.3
36
80
0
103
38
18
8
34
1.81
88270388--88270470
18
4.6
18
80
0
85
38
18
8
34
1.81
88270623--88270713
43
2.1
44
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6
132
30
25
21
21
1.99
88272104--88272135
15
2.0
17
88
11
50
34
12
6
46
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88277767--88277822
3
19.0
3
79
17
64
62
3
0
33
1.12
88283466--88283703
50
4.8
50
80
4
230
30
26
17
24
1.97
88283723--88283752
15
2.0
15
100
0
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13
20
13
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1.72
88286468--88286522
20
2.8
20
91
0
92
36
3
30
29
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2.2
18
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1.47
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13
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0
0
52
1.00
88288873--88288937
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1.9
33
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10
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7
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24
1
1
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1.02
88297489--88297555
10
7.0
10
70
20
54
25
1
1
71
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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