Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  304  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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1.92
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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9
35
1.84
100567181--100567205
13
1.9
13
100
0
50
32
0
4
64
1.12
100567326--100567377
26
2.0
25
85
3
68
48
1
0
50
1.12
100579843--100579902
25
2.3
26
80
11
70
36
3
5
55
1.38
100581401--100581511
14
7.6
14
72
17
68
26
7
1
64
1.29
100581401--100581508
29
3.8
28
69
18
78
25
7
1
64
1.30
100581476--100581521
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15
100581591--100581638
23
2.0
23
84
4
60
25
8
0
66
1.19
100585473--100585505
16
1.9
18
88
11
52
45
12
6
36
1.66
100586460--100586499
21
2.0
20
85
14
55
32
0
0
67
0.91
100586900--100586943
20
2.2
20
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0
79
13
6
34
45
1.70
100590210--100590257
23
2.1
23
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11
64
68
0
0
31
0.90
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126
2.0
126
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0
465
44
9
14
31
1.77
100593088--100593148
18
3.3
18
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20
54
36
6
9
47
1.63
100593083--100593156
37
2.0
37
100
0
148
35
5
13
45
1.66
100594649--100594681
16
2.1
16
88
11
50
57
6
9
27
1.53
100596109--100596861
84
9.0
84
86
2
953
19
20
21
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100596110--100596862
254
3.0
250
85
3
953
19
20
21
38
1.93
100596119--100596862
338
2.2
334
85
3
987
19
20
21
38
1.94
100596721--100596849
40
3.1
39
71
16
107
19
20
22
37
1.94
100602834--100603108
93
3.0
92
92
1
442
23
24
14
38
1.92
100602834--100603108
139
2.0
138
91
0
442
23
24
14
38
1.92
100602834--100603108
46
6.0
46
93
0
442
23
24
14
38
1.92
100605190--100605220
11
2.8
11
90
0
53
74
3
0
22
0.96
100605479--100605546
29
2.3
30
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5
93
29
16
5
48
1.69
100620518--100620551
6
5.5
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52
14
0
32
1.42
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4.9
32
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3
194
38
20
21
20
1.94
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104
2.0
104
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0
355
26
17
16
40
1.90
100632982--100633044
30
2.1
30
91
5
101
58
11
4
25
1.51
100633841--100633875
16
2.3
15
90
5
52
65
0
0
34
0.93
100635096--100635120
6
4.2
6
100
0
50
36
0
0
64
0.94
100635179--100635237
30
1.9
31
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3
75
42
16
1
38
1.59
100642855--100643012
43
3.7
43
90
0
219
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7
3
56
1.43
100642965--100643024
19
3.2
19
71
17
54
31
1
5
61
1.27
100643130--100643189
25
2.4
25
78
10
70
26
5
5
63
1.36
100643417--100643461
17
2.5
19
76
20
51
20
8
4
66
1.36
100643452--100643499
25
2.0
24
88
12
71
33
4
4
58
1.36
100645317--100645381
20
3.4
18
75
10
58
61
1
7
29
1.33
100645612--100645701
9
9.9
9
71
15
51
31
2
1
65
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100645836--100646012
94
1.9
94
81
4
214
36
8
16
38
1.79
100647161--100647226
33
2.0
33
100
0
132
18
33
30
18
1.94
100648620--100648674
24
2.2
26
83
9
69
78
5
14
1
1.02
100648686--100648719
15
2.1
15
89
10
50
64
0
35
0
0.94
100648685--100648723
17
2.3
18
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13
55
66
0
33
0
0.92
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16
2.5
17
80
11
59
65
0
4
29
1.13
100650403--100650462
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129
55
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5
34
1.43
100651048--100651162
30
3.8
30
88
0
176
23
3
47
25
1.67
100651048--100651162
60
1.9
60
92
0
194
23
3
47
25
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332