Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  39  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11940199--11940253
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16
14
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1.59
11940209--11940265
15
3.2
20
63
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2.0
17
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45
0
0
54
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2.0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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203
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0
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60
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
89
0
54
58
2
8
30
1.42
12086118--12086190
34
2.1
35
87
7
105
34
1
19
45
1.59
12086233--12086327
34
2.7
35
85
7
115
44
0
13
42
1.44
12086418--12086793
127
3.0
128
88
2
571
38
18
16
27
1.92
12089074--12089653
289
2.0
289
83
1
723
31
17
24
26
1.97
12090415--12090460
24
1.9
24
82
8
58
23
21
26
28
1.99
12090610--12090647
18
2.1
18
90
0
58
39
10
28
21
1.86
12091235--12091277
21
2.0
21
90
4
68
55
9
4
30
1.52
12091235--12091266
7
4.6
7
92
0
55
59
9
0
31
1.29
12092212--12092278
19
3.5
20
74
15
77
65
2
2
28
1.22
12092209--12092291
38
2.2
38
97
0
157
65
3
2
28
1.22
12092229--12092282
10
5.6
10
74
12
51
62
1
1
33
1.16
12092226--12092293
18
3.6
19
74
16
70
66
2
1
29
1.15
12092454--12092503
21
2.4
21
82
0
55
38
2
26
34
1.68
12093986--12094010
4
6.2
4
100
0
50
24
0
0
76
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12099764--12099875
39
2.8
40
84
2
154
27
21
23
27
1.99
12100008--12100075
14
4.9
14
78
5
66
20
1
32
45
1.60
12099999--12100086
21
4.2
22
76
12
71
20
1
31
46
1.58
12100920--12100977
20
2.8
20
73
2
53
25
1
25
46
1.62
12101183--12101216
18
1.9
18
88
5
52
50
2
2
44
1.32
12104079--12104144
34
1.9
34
84
9
89
37
3
4
54
1.36
12104079--12104147
35
2.0
35
83
11
88
37
2
4
55
1.35
12104302--12104454
42
3.6
42
83
2
191
24
13
31
30
1.94
12104287--12104510
43
5.3
43
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3
229
24
15
27
32
1.95
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10
3.4
10
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0
59
0
35
0
64
0.94
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62
2.1
62
88
4
188
23
7
10
57
1.58
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27
2.2
27
100
0
118
16
18
6
57
1.61
12108735--12108837
23
4.5
23
95
0
170
34
3
20
40
1.71
12109322--12109473
42
3.6
42
71
12
96
26
13
26
32
1.94
12124254--12124471
43
4.9
42
70
12
125
28
21
20
29
1.98
12124397--12124484
43
2.0
43
82
0
104
27
21
20
30
1.98
12124581--12124674
47
2.0
47
93
0
161
50
23
5
21
1.69
12125283--12125311
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
12130441--12130543
9
11.6
9
77
6
102
34
0
15
48
1.52
12130450--12130559
26
4.1
27
80
6
125
36
0
13
49
1.49
12130441--12130555
44
3.0
36
74
18
122
36
0
14
47
1.51
12130995--12131034
22
1.9
20
85
10
53
62
2
0
35
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12131708--12131759
25
2.1
25
82
7
61
28
19
38
13
1.89
12132225--12132431
94
2.2
92
84
7
269
44
24
7
23
1.79
12134393--12134444
20
2.5
21
87
3
70
38
23
25
13
1.91
12146525--12146650
42
3.0
42
76
4
119
30
22
17
30
1.96
12155295--12155466
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
12155319--12155498
67
2.8
64
77
9
195
28
16
30
23
1.96
12159647--12159697
20
2.7
18
82
14
59
37
21
0
41
1.54
12161179--12161267
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2.0
44
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0
142
37
14
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1.66
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43
2.8
42
81
3
148
25
17
24
32
1.97
12169938--12169968
11
2.8
11
95
0
53
58
0
12
29
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332