Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  303  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100158450--100158504
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24
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0
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1
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1
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28
2.5
28
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1
16
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
203
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2
26
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40
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1.60
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3.0
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39
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18
1.68
100213662--100213780
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15
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24
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11
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19
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2.7
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130
31
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16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
10
18
1.27
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2.1
19
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0
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4
8
1.52
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1.81
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17
20
1.82
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21
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22
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1.93
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24
17
1.95
100317937--100317994
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2.1
27
84
6
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36
27
20
15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.94
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19
17
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2.4
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86
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264
27
20
17
35
1.94
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18.2
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84
53
3
20
22
1.60
100327807--100327969
87
1.9
86
87
1
236
26
14
22
35
1.93
100330247--100330319
28
2.6
28
82
4
94
23
10
8
57
1.59
100330538--100330577
13
2.7
16
85
14
59
35
0
0
65
0.93
100331803--100331867
29
2.3
29
86
7
89
46
15
27
10
1.79
100336403--100336446
20
2.2
20
87
0
61
54
9
2
34
1.44
100338897--100339064
89
1.9
89
92
2
284
24
21
22
32
1.98
100339036--100339152
43
2.7
44
81
4
139
17
20
26
35
1.94
100347330--100347371
19
2.2
20
83
12
52
47
7
19
26
1.74
100351356--100351383
12
2.3
12
100
0
56
46
0
14
39
1.44
100351659--100351735
18
4.1
18
73
14
66
66
0
10
23
1.22
100351667--100351709
15
2.9
15
80
10
52
72
0
4
23
1.04
100351669--100351720
21
2.5
21
87
6
70
67
0
7
25
1.17
100351723--100351859
14
9.7
14
66
12
57
57
3
4
34
1.36
100353419--100353618
3
65.3
3
67
14
54
31
6
2
60
1.34
100353554--100353601
21
2.3
21
85
0
60
27
10
0
62
1.27
100353549--100353625
18
4.1
18
75
9
64
23
10
0
66
1.22
100353570--100353615
21
2.2
21
88
7
67
26
6
0
67
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100353868--100353981
3
38.0
3
68
13
65
33
8
0
57
1.36
100353902--100353945
22
2.0
22
82
8
54
36
11
0
52
1.38
100359179--100359226
19
2.6
19
83
3
62
37
2
12
47
1.53
100359243--100359331
42
2.1
42
91
0
142
28
6
14
50
1.68
100359695--100359725
15
2.1
15
93
0
53
48
22
0
29
1.51
100363089--100363136
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
100363153--100363241
42
2.1
42
91
0
142
28
6
14
50
1.68
100369552--100369583
3
11.0
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68
0
31
0
0.90
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202
2.0
201
96
0
749
26
13
20
40
1.89
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117
2.1
117
89
4
371
41
2
3
52
1.31
100378015--100378222
58
3.5
59
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13
257
41
1
3
53
1.26
100379080--100379114
18
1.9
18
94
0
61
34
8
17
40
1.80
100380968--100380995
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
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17
3.0
18
88
8
63
21
1
0
76
0.88
100381092--100381129
4
9.0
4
97
2
58
23
0
0
76
0.79
100392936--100393027
44
2.1
44
95
0
166
32
20
19
27
1.97
100392789--100393017
94
2.4
92
76
11
246
31
19
21
27
1.97
100392947--100393044
44
2.2
43
83
7
117
31
19
22
26
1.98
100392842--100393166
137
2.4
138
88
1
474
31
18
20
30
1.96
100393387--100393501
44
2.6
44
77
0
104
32
15
20
32
1.94
100396462--100396490
14
2.1
14
100
0
58
41
20
13
24
1.89
100400584--100400622
20
2.0
20
94
0
69
43
0
5
51
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100411622--100411744
48
2.6
48
83
2
151
35
15
21
27
1.93
100415585--100415698
48
2.4
48
80
2
124
30
21
14
34
1.92
100422571--100422697
39
3.5
39
73
16
135
40
22
22
14
1.90
100422620--100422683
31
2.1
31
90
0
101
42
20
21
15
1.89
100426200--100426231
15
2.1
15
94
0
55
31
18
9
40
1.83
100427029--100427057
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9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
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20
2.8
20
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55
31
3
0
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1.09
100427439--100427486
21
2.2
21
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3
60
27
4
0
68
1.07
100427664--100427701
20
1.9
20
84
10
51
42
0
7
50
1.31
100430473--100430566
44
2.1
45
88
2
136
17
24
34
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332