Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  21  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6037793--6037831
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13
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2.0
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0
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2.0
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2.0
20
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2.1
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2.0
23
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2
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30
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35
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1.06
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68
35
1
0
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1.06
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9
8.5
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21
60
34
3
1
61
1.19
6082364--6082441
14
5.6
14
71
14
54
33
2
1
62
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6082396--6082481
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3.6
25
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5
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1.40
6082378--6082481
45
2.2
45
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113
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4
2
58
1.34
6088667--6088730
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3.2
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13
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12
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6088650--6088730
39
2.1
39
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0
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1.89
6088650--6088749
39
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148
12
25
23
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1.88
6089777--6089812
18
2.1
18
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1.51
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48
2.0
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1.53
6090353--6090434
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2.3
35
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13
1.50
6090826--6090900
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20
50
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4
1
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18
4.4
18
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16
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30
3
2
63
1.25
6090825--6090903
12
6.7
12
75
12
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1.17
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5.0
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6094587--6094746
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2.5
64
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0
293
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10
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60
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59
85
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27
20
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1.9
15
100
0
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58
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0
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2.0
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1
0
47
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50
4
0
45
1.22
6105495--6105538
19
2.2
21
84
15
58
50
4
0
45
1.22
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0
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21
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59
0
4
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1.23
6112272--6112374
20
4.8
22
73
18
83
62
0
2
33
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6112283--6112354
26
2.8
26
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16
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62
1
1
34
1.13
6112283--6112374
29
3.2
29
79
14
84
63
1
2
33
1.14
6112283--6112422
10
14.0
10
67
23
57
61
0
3
34
1.18
6112283--6112409
3
40.3
3
66
25
50
62
0
3
33
1.17
6116124--6116172
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2.2
23
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3
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55
0
4
40
1.19
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14
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14
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2
63
30
28
13
28
1.94
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2.3
20
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16
55
29
25
14
31
1.95
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0
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0
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43
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1.9
18
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5
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35
20
0
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15
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19
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1
10
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0
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0
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11
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30
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2.1
24
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0
91
24
50
4
22
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6163629--6163681
24
2.1
25
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56
7
22
13
1.62
6164310--6164564
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2.0
128
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311
33
11
16
39
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14
2.2
13
94
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51
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1.78
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0
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14
23
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12
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12
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13
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64
4
1
29
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4
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63
0
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194
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0
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10
1.28
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20
95
4
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19
14
0
65
1.26
6189741--6189792
19
2.7
19
82
17
63
59
5
0
34
1.21
6191906--6192131
116
1.9
116
97
1
427
23
17
15
42
1.88
6197792--6197868
28
2.7
27
82
11
84
63
1
7
27
1.29
6198096--6198140
21
2.2
21
84
11
58
46
2
6
44
1.42
6201039--6201246
112
1.9
112
93
2
364
39
8
7
44
1.62
6203591--6203631
11
3.7
11
86
0
64
29
31
0
39
1.57
6203589--6203631
22
2.0
22
95
0
77
27
30
0
41
1.56
6203590--6203642
22
2.4
22
87
3
70
28
30
1
39
1.67
6205435--6205477
18
2.4
18
92
0
68
16
27
11
44
1.82
6205852--6206128
115
2.4
116
90
3
441
42
3
7
47
1.47
6206058--6206095
17
2.3
17
86
4
51
52
5
5
36
1.47
6205927--6206122
55
3.5
53
71
18
162
42
3
6
47
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6209142--6209680
126
4.3
126
91
1
875
27
21
17
33
1.96
6209768--6209970
95
2.1
96
85
2
275
39
18
1
40
1.62
6209958--6210000
15
2.8
15
78
3
50
51
20
0
27
1.48
6211183--6211245
27
2.2
28
81
15
76
61
1
0
36
1.05
6211201--6211274
33
2.3
32
80
8
89
64
0
0
35
0.94
6211183--6211277
33
3.1
30
76
15
88
63
1
0
35
1.02
6215182--6215211
15
2.1
15
93
6
53
40
0
0
60
0.97
6216061--6216116
29
1.9
29
92
0
94
42
10
8
37
1.71
6218499--6218555
22
3.0
18
75
20
53
52
10
0
36
1.36
6218513--6218556
22
2.0
22
100
0
88
54
9
0
36
1.32
6219836--6219870
18
1.9
18
88
11
54
5
0
25
68
1.11
6222070--6222152
2
41.5
2
100
0
166
0
50
0
49
1.00
6223062--6223100
16
2.4
16
87
8
53
38
2
0
58
1.12
6223099--6223132
12
2.8
12
91
8
52
76
2
0
20
0.92
6223099--6223132
17
2.0
17
94
0
59
76
2
0
20
0.92
6224313--6224357
23
2.0
23
100
0
90
44
8
20
26
1.80
6225795--6225969
44
4.0
44
75
1
154
25
21
22
30
1.98
6225774--6225971
88
2.2
88
81
1
227
25
21
20
32
1.98
6225960--6226551
86
6.8
86
71
10
344
26
24
19
28
1.99
6225933--6226556
44
14.4
44
72
6
391
26
23
20
29
1.99
6225933--6226555
130
4.8
130
93
0
1039
26
23
20
29
1.99
6238296--6238342
23
2.0
23
100
0
94
44
8
17
29
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6242138--6242298
66
2.4
66
80
2
180
26
14
26
32
1.95
6246186--6246240
27
2.1
26
83
10
67
43
5
0
50
1.25
6246289--6246330
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
6246293--6246329
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
6246352--6246408
15
3.5
15
69
17
51
49
3
0
47
1.18
6246776--6246847
33
2.2
34
80
9
87
52
13
1
31
1.49
6246865--6246931
14
4.8
14
77
0
71
40
14
4
40
1.67
6246865--6246931
28
2.4
28
92
0
116
40
14
4
40
1.67
6257582--6257611
14
2.1
14
93
0
51
0
16
0
83
0.65
6263646--6263807
87
1.9
87
88
0
243
38
5
8
48
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332