Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  297  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98641646--98641690
14
3.1
15
87
9
58
20
0
40
40
1.52
98641671--98641739
36
1.9
36
82
5
86
18
1
39
40
1.60
98641734--98641781
14
3.4
14
79
2
51
25
0
31
43
1.55
98641881--98641919
14
2.8
14
88
0
60
25
0
25
48
1.51
98641943--98641990
15
3.3
15
77
16
55
20
0
33
45
1.52
98641938--98641987
22
2.3
21
77
16
57
24
0
30
46
1.53
98641979--98642019
14
2.9
15
85
7
59
19
2
43
34
1.64
98641972--98642011
21
1.9
21
84
0
53
15
2
42
40
1.60
98642530--98642579
14
3.8
13
79
12
57
60
2
0
38
1.09
98643599--98643630
3
10.7
3
93
0
55
28
0
0
71
0.86
98644159--98644189
4
7.8
4
100
0
62
22
0
0
77
0.77
98644934--98644987
25
2.2
25
86
6
74
66
9
14
9
1.43
98646007--98646324
3
106.0
3
72
6
196
29
6
3
60
1.37
98646428--98646470
11
3.6
11
87
12
59
23
9
0
67
1.19
98653628--98653706
39
2.0
39
100
0
158
27
12
12
46
1.78
98657108--98657186
39
2.0
39
92
0
131
24
26
5
44
1.74
98658606--98659692
44
24.9
44
88
1
1551
22
31
16
29
1.96
98659911--98660029
61
1.9
65
89
6
192
38
11
15
33
1.84
98672419--98672751
44
7.5
44
79
1
360
31
19
23
26
1.98
98672415--98672765
89
3.9
89
85
1
418
32
18
23
25
1.97
98672419--98672765
133
2.6
134
82
0
410
32
18
23
25
1.97
98673353--98673404
24
2.2
24
89
6
79
71
7
11
9
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98674167--98674226
3
19.3
3
79
6
50
41
1
0
56
1.09
98674192--98674226
14
2.4
14
90
4
52
37
2
0
60
1.12
98674378--98674440
3
21.0
3
100
0
126
33
0
0
66
0.92
98674540--98674592
11
4.5
12
80
15
58
20
7
0
71
1.10
98679405--98679466
22
2.8
22
75
0
61
11
20
20
46
1.81
98683647--98683695
24
2.1
23
85
11
64
32
0
2
65
1.04
98683659--98683741
42
2.0
40
84
6
105
48
0
1
50
1.08
98693937--98693977
19
2.1
19
86
9
55
7
17
0
75
1.02
98694361--98694407
13
3.6
13
88
0
67
74
17
2
6
1.12
98694361--98694394
6
5.3
6
86
13
50
79
17
0
2
0.86
98698022--98698072
3
16.7
3
82
11
50
68
3
3
23
1.23
98698181--98698259
3
25.3
3
78
7
77
58
3
6
31
1.41
98699321--98699350
14
2.1
14
100
0
60
13
30
13
43
1.82
98699597--98699624
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
98710410--98710450
17
2.4
18
80
12
50
36
7
4
51
1.51
98711003--98711037
15
2.3
15
100
0
70
57
14
14
14
1.66
98714027--98714076
21
2.4
21
78
15
59
34
4
8
54
1.49
98716210--98716251
21
2.0
21
90
0
66
52
0
2
45
1.13
98720007--98720058
27
1.9
27
92
0
86
53
3
3
38
1.37
98724870--98725044
49
3.6
47
77
8
158
27
28
17
27
1.97
98724916--98725044
46
2.7
47
81
9
145
23
29
19
27
1.98
98732325--98732397
35
2.1
36
84
2
94
27
0
9
63
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98735568--98735617
25
2.1
23
81
7
55
38
22
12
28
1.89
98741791--98741832
20
2.2
19
86
4
57
30
7
2
59
1.37
98741826--98741887
21
3.0
20
83
6
70
35
6
0
58
1.24
98741845--98741887
22
2.0
22
91
8
72
34
4
0
60
1.17
98741991--98742048
23
2.5
22
86
13
73
25
6
3
63
1.35
98742037--98742081
14
3.1
14
80
20
56
33
0
4
62
1.15
98745972--98746001
14
2.1
14
93
0
51
43
6
3
46
1.46
98749090--98749178
44
2.0
44
100
0
178
35
15
30
17
1.92
98754112--98755528
210
6.7
210
96
0
2546
28
18
22
29
1.98
98757304--98757376
15
4.7
17
73
17
61
32
6
1
58
1.33
98757337--98757384
14
3.5
13
78
13
51
35
4
0
60
1.16
98757352--98757394
21
2.0
20
86
8
59
34
2
0
62
1.08
98757494--98757547
23
2.3
22
84
15
65
25
7
3
62
1.38
98759198--98759235
20
1.9
19
89
5
58
76
0
21
2
0.91
98769299--98769472
47
3.6
48
82
6
192
24
17
28
29
1.97
98769303--98769510
99
2.1
97
79
10
221
25
16
29
28
1.97
98772279--98772397
43
2.8
43
82
7
127
25
17
18
38
1.92
98772335--98772451
43
2.7
43
89
0
162
29
17
16
36
1.92
98773144--98773186
23
1.9
23
85
4
61
37
2
20
39
1.66
98782800--98782859
10
6.0
10
78
7
50
26
6
3
63
1.35
98782806--98782859
20
2.7
19
77
8
63
25
7
3
62
1.38
98784043--98784133
45
2.0
45
100
0
182
39
17
20
21
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98786490--98786602
4
28.8
4
70
25
66
23
2
0
74
0.94
98786491--98786597
7
14.9
7
80
19
98
23
2
0
73
0.96
98786491--98786596
10
11.2
10
74
20
70
23
2
0
73
0.96
98786560--98786603
5
8.8
5
80
9
54
20
2
0
77
0.88
98786518--98786611
14
6.5
15
80
17
67
25
1
1
72
0.98
98788239--98788273
13
2.6
13
90
4
52
42
2
11
42
1.55
98788290--98788341
10
5.1
10
80
2
59
23
3
3
69
1.22
98796192--98796300
9
11.7
9
68
20
57
62
3
1
32
1.23
98796195--98796243
26
1.9
26
91
4
82
67
2
0
30
1.02
98796192--98796279
18
4.8
18
75
18
67
64
4
1
29
1.20
98796227--98796301
29
2.6
29
79
10
73
61
4
2
32
1.28
98796858--98796923
32
2.1
32
100
0
132
24
39
9
27
1.85
98798005--98798042
18
2.2
18
86
9
53
50
2
0
47
1.15
98800965--98801032
19
3.6
19
72
20
63
63
1
4
30
1.23
98801049--98801101
21
2.5
22
78
3
63
54
9
5
30
1.55
98805782--98805819
11
3.5
11
85
3
51
71
0
28
0
0.87
98805781--98805823
14
3.1
14
77
12
52
72
0
27
0
0.85
98806289--98806322
17
2.0
17
88
0
50
32
26
20
20
1.97
98807583--98807607
7
3.6
7
100
0
50
76
24
0
0
0.80
98809806--98809998
97
2.0
98
86
1
271
31
15
10
43
1.80
98814509--98814541
2
16.5
2
100
0
66
0
48
0
51
1.00
98818981--98819038
29
2.0
29
100
0
116
37
17
3
41
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98820112--98820178
30
2.2
30
97
0
125
37
7
10
44
1.67
98835218--98835252
16
2.2
16
94
0
61
25
22
22
28
1.99
98835439--98835468
14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
98843301--98843473
54
3.2
52
78
12
199
35
8
16
39
1.78
98843301--98843493
54
3.7
51
79
12
194
38
8
16
37
1.78
98846744--98846798
7
8.6
7
79
16
50
76
0
12
10
1.02
98846737--98846772
12
3.0
12
100
0
72
75
0
16
8
1.04
98846727--98846802
12
6.8
12
77
16
56
75
1
10
13
1.12
98848316--98848358
19
2.3
19
84
4
61
67
0
32
0
0.91
98848313--98848366
19
2.7
21
72
13
60
64
0
35
0
0.94
98848316--98848368
21
2.7
19
82
8
63
64
0
35
0
0.94
98851742--98851802
28
2.1
30
84
6
81
72
4
4
18
1.21
98857712--98857789
13
5.9
13
80
5
68
16
0
30
52
1.44
98857707--98857793
20
4.3
20
80
2
86
19
0
29
50
1.48
98857707--98857793
7
13.0
7
72
9
74
19
0
29
50
1.48
98857707--98857826
20
5.8
20
74
18
61
19
0
30
50
1.54
98857962--98858030
14
5.2
13
76
11
68
24
0
27
47
1.52
98857976--98858030
20
2.8
19
72
8
56
23
0
27
49
1.51
98858053--98858109
21
2.7
22
84
10
66
19
3
24
52
1.61
98858230--98858266
7
5.3
7
96
0
65
13
0
29
56
1.37
98858196--98858308
21
5.4
21
73
9
70
19
2
24
53
1.58
98858227--98858315
42
2.1
41
84
10
117
21
3
26
48
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98858333--98858411
14
5.8
13
75
17
63
18
0
24
56
1.41
98858291--98858411
21
5.9
21
71
9
70
20
2
25
51
1.60
98858768--98858856
35
2.6
34
78
8
92
24
3
23
48
1.66
98858749--98858822
28
2.6
27
79
8
67
27
2
22
47
1.65
98858804--98858862
20
2.9
20
71
11
57
20
1
23
54
1.54
98859452--98859490
21
1.9
21
85
15
55
46
23
5
25
1.73
98864058--98864106
25
2.0
24
84
15
64
46
16
4
32
1.65
98867347--98867427
10
7.9
10
76
15
85
66
1
11
20
1.29
98867347--98867404
30
1.9
30
93
6
100
68
1
8
20
1.25
98867442--98867477
13
2.9
13
92
8
58
47
13
0
38
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332