Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  46  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13870406--13870485
39
2.2
37
88
8
119
22
6
12
58
1.56
13870562--13870880
66
5.2
65
65
26
203
42
3
5
48
1.42
13870597--13870904
61
5.1
61
69
17
257
42
2
5
49
1.39
13870707--13870900
69
3.1
69
62
25
172
42
2
5
48
1.40
13870769--13870820
15
3.6
15
80
12
56
46
0
0
53
1.00
13870885--13870935
18
3.0
18
78
18
56
47
0
0
52
1.00
13870524--13870941
120
3.5
120
94
1
714
43
2
4
49
1.37
13871084--13871174
45
2.0
44
87
2
128
34
28
5
31
1.80
13871153--13871222
16
4.4
16
94
0
95
32
34
0
32
1.58
13872098--13872132
15
2.2
16
95
5
63
11
2
5
80
1.00
13872930--13872964
18
2.0
18
88
5
54
57
0
0
42
0.99
13892277--13892324
24
2.0
24
100
0
96
45
4
4
45
1.41
13892338--13892426
17
5.4
17
70
20
64
53
3
2
40
1.30
13892332--13892426
29
3.0
29
67
21
73
54
4
2
38
1.32
13894037--13894067
16
1.9
16
93
0
53
77
6
6
9
1.12
13894540--13894587
23
2.1
23
100
0
96
43
12
8
35
1.73
13896344--13896381
19
2.0
20
89
5
60
52
7
0
39
1.31
13897512--13897565
22
2.5
21
80
14
56
1
27
0
70
0.98
13897504--13897566
23
2.8
24
78
9
69
3
28
0
68
1.05
13903754--13903795
21
2.0
21
85
4
57
64
2
0
33
1.07
13904588--13904636
25
2.0
25
88
8
73
57
0
0
42
0.99
13912173--13912275
9
11.1
9
68
20
52
27
3
1
66
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13912173--13912268
28
3.5
26
76
17
88
26
4
2
67
1.19
13912229--13912275
18
2.6
18
90
10
69
23
4
0
72
1.02
13912183--13912258
8
8.6
8
72
18
53
26
3
2
67
1.22
13914209--13914271
23
2.8
22
80
4
72
36
4
1
57
1.30
13914546--13914603
17
3.6
16
77
17
66
34
1
0
63
1.04
13914539--13914604
17
3.9
17
69
25
50
36
1
0
62
1.05
13921957--13922004
25
1.9
25
82
0
60
29
10
4
56
1.52
13926469--13927012
205
2.6
206
92
2
898
32
18
20
28
1.97
13928674--13928835
88
1.8
88
82
2
209
36
7
1
54
1.36
13928777--13928841
23
2.9
22
81
4
76
38
4
0
56
1.20
13929117--13929174
17
3.6
16
77
17
66
34
1
0
63
1.04
13929110--13929175
17
3.9
17
69
25
50
36
1
0
62
1.05
13930391--13930428
20
1.9
20
84
10
51
21
5
5
68
1.29
13937359--13937415
29
1.9
30
82
10
73
40
3
8
47
1.52
13938238--13938277
16
2.4
17
83
12
55
42
12
0
45
1.42
13939814--13939861
18
2.7
18
74
3
53
35
0
8
56
1.30
13943173--13943225
26
2.1
25
82
10
63
58
1
0
39
1.09
13944362--13944421
31
1.9
30
83
12
77
56
8
10
25
1.60
13945262--13945347
31
2.8
32
75
7
88
37
8
3
51
1.49
13945241--13945339
32
3.2
32
74
5
96
35
9
5
50
1.56
13955859--13955920
30
2.1
30
93
0
106
27
1
11
59
1.41
13960045--13960113
32
2.2
32
81
5
77
40
23
1
34
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13960841--13960888
24
2.0
25
87
4
71
14
10
4
70
1.29
13960883--13960936
13
4.2
13
77
17
51
33
0
3
62
1.12
13964550--13964593
18
2.4
18
76
0
52
50
13
2
34
1.55
13965174--13965228
24
2.3
25
81
9
78
23
18
32
25
1.97
13967108--13967151
10
4.6
10
83
8
56
31
2
43
22
1.66
13969554--13969597
17
2.7
16
82
6
52
52
0
18
29
1.46
13969912--13970087
33
5.3
32
66
13
104
34
15
22
28
1.94
13969919--13970105
101
1.9
101
81
2
232
32
16
24
27
1.96
13972705--13972769
28
2.3
28
94
0
112
16
36
27
18
1.93
13973461--13973619
52
3.0
51
82
6
185
31
26
15
26
1.96
13974432--13974462
10
3.1
10
100
0
62
70
0
19
9
1.14
13976985--13977022
19
2.0
19
94
0
67
39
10
15
34
1.82
13977508--13977612
37
2.7
38
77
11
106
26
16
21
35
1.94
13978324--13978366
21
2.1
20
82
4
50
39
0
18
41
1.51
13979050--13979146
22
4.0
23
77
16
99
39
0
1
59
1.04
13979095--13979155
22
2.9
22
83
7
74
42
0
0
57
0.98
13979546--13979585
20
2.0
20
86
13
57
62
0
2
35
1.09
13979566--13979600
14
2.6
13
86
8
52
62
0
2
34
1.10
13979572--13979602
14
2.2
14
100
0
62
64
0
0
35
0.94
13979591--13979644
23
2.4
22
81
12
56
51
1
3
42
1.30
13989200--13989250
25
2.0
25
92
0
84
23
27
25
23
2.00
13994387--13994416
15
2.0
15
100
0
60
40
33
6
20
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13995657--13995714
25
2.3
25
100
0
116
13
29
6
50
1.68
13997896--13997993
46
2.3
40
79
16
108
34
15
12
37
1.85
13998616--13998673
24
2.3
25
80
11
66
37
3
1
56
1.26
14000268--14000428
32
5.0
32
89
0
241
32
13
9
45
1.75
14003363--14003432
35
2.0
35
100
0
140
31
17
14
37
1.89
14003766--14003796
15
2.1
15
100
0
62
32
12
12
41
1.81
14007212--14007458
39
6.3
39
91
0
368
30
28
21
19
1.97
14007904--14007935
13
2.5
13
100
0
64
31
31
12
25
1.92
14009860--14009892
10
3.3
10
91
0
57
78
0
0
21
0.75
14012687--14012729
21
2.0
21
100
0
86
23
23
4
48
1.69
14013097--14013124
10
2.8
10
100
0
56
32
0
0
67
0.91
14013100--14013158
28
2.2
27
82
11
68
30
1
1
66
1.12
14020694--14020734
15
2.5
17
80
11
59
65
0
0
34
0.93
14021789--14021819
15
2.1
15
100
0
62
0
25
6
67
1.14
14027944--14027986
23
1.9
22
86
13
61
58
0
0
41
0.98
14029228--14029269
15
2.7
16
77
7
50
69
0
30
0
0.89
14045771--14045998
46
5.0
46
88
1
314
41
14
24
19
1.89
14045781--14045993
92
2.3
92
93
0
354
42
15
23
18
1.88
14049142--14049166
12
2.1
12
100
0
50
24
36
24
16
1.94
14049326--14049381
9
6.2
9
97
0
85
41
26
10
21
1.86
14049326--14049381
18
3.1
18
94
0
94
41
26
10
21
1.86
14051675--14051724
23
2.0
25
85
11
68
40
2
2
56
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14056505--14056612
26
4.2
26
92
0
180
36
23
7
33
1.83
14056505--14056612
52
2.1
52
98
0
207
36
23
7
33
1.83
14063614--14063721
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
14065242--14065278
19
1.9
19
100
0
74
35
5
5
54
1.47
14066822--14066902
41
2.0
41
85
4
110
34
4
12
48
1.62
14082347--14082384
7
5.4
7
100
0
76
47
0
0
52
1.00
14084104--14084154
20
2.6
19
72
22
52
58
0
35
5
1.22
14088494--14088545
26
2.0
26
96
0
95
15
21
19
44
1.87
14091602--14091758
53
3.0
53
89
4
221
25
16
28
29
1.97
14093037--14093094
30
1.9
30
96
0
107
31
13
20
34
1.92
14093128--14093314
33
5.6
33
68
9
121
32
17
22
26
1.97
14098998--14099051
24
2.2
24
87
6
74
31
3
7
57
1.44
14099108--14099169
28
2.1
28
82
11
72
17
1
12
67
1.30
14099855--14099897
16
2.7
16
85
0
59
44
2
16
37
1.60
14100306--14100345
18
2.2
18
86
8
55
67
2
0
30
1.04
14110214--14110293
33
2.5
33
78
17
87
47
2
2
47
1.29
14113406--14113443
18
2.1
18
95
0
67
28
2
10
57
1.45
14114157--14114196
21
1.9
21
89
0
62
40
2
0
57
1.12
14114642--14114712
35
2.0
35
97
0
133
36
11
23
28
1.89
14117435--14117467
17
1.9
17
93
0
57
42
0
12
45
1.41
14122739--14123008
46
5.9
47
88
3
354
21
22
14
41
1.89
14122940--14123010
21
3.2
21
64
11
52
25
22
11
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14131628--14131656
15
1.9
15
100
0
58
27
13
17
41
1.87
14133099--14133166
32
2.1
32
81
10
77
23
4
16
55
1.58
14133162--14133234
32
2.5
27
76
19
83
24
4
20
50
1.65
14134189--14134274
22
3.8
22
79
13
77
27
4
20
46
1.71
14134189--14134337
68
2.2
68
91
2
228
28
5
20
44
1.73
14134735--14134801
14
4.7
14
85
3
80
43
10
2
43
1.54
14136165--14136228
9
6.6
10
72
13
53
26
1
1
70
1.05
14136216--14136270
21
2.6
21
78
18
60
40
1
1
56
1.21
14144681--14144711
5
6.2
5
92
0
53
0
16
61
22
1.34
14150685--14150751
21
3.0
21
66
26
57
38
4
13
43
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332