Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  283  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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3.2
16
85
11
75
36
34
6
22
1.79
94659918--94660181
64
4.2
64
91
0
397
46
15
14
23
1.82
94660053--94660157
32
3.2
34
61
24
80
44
14
17
23
1.85
94660099--94660135
16
2.3
16
90
0
56
51
21
13
13
1.75
94661262--94661335
31
2.4
29
76
12
78
24
9
20
45
1.80
94663138--94663188
25
2.0
25
92
0
84
35
13
17
33
1.89
94671496--94671546
21
2.6
20
90
9
79
70
5
17
5
1.28
94671595--94671659
27
2.4
27
84
0
76
20
32
35
12
1.89
94671740--94671789
8
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8
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11
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66
0
34
0
0.92
94671740--94671790
16
3.4
15
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10
77
66
0
33
0
0.92
94672255--94672324
16
4.4
16
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106
72
2
7
17
1.19
94672264--94672324
15
3.9
15
85
6
68
73
3
6
16
1.17
94672255--94672324
33
2.2
32
89
5
106
72
2
7
17
1.19
94672319--94672373
13
4.5
13
76
17
55
74
3
1
20
1.06
94672326--94672377
11
4.5
11
75
17
52
71
3
1
23
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94672343--94673239
138
6.5
138
91
3
1378
56
7
8
27
1.54
94673048--94673101
23
2.3
24
78
12
58
59
1
5
33
1.31
94674557--94675155
266
2.3
267
78
4
575
34
19
19
27
1.95
94674536--94675191
132
5.0
132
79
5
531
34
18
18
27
1.95
94679654--94679692
17
2.3
17
91
8
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46
10
10
33
1.72
94683088--94683189
39
2.6
39
90
0
159
25
29
22
22
1.99
94683157--94683207
25
2.0
25
92
0
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27
27
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25
1.99
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25
2.1
25
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0
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23
26
21
28
1.99
94683118--94683246
64
2.0
64
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0
204
25
29
21
23
1.99
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1.8
103
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0
335
24
29
23
22
1.99
94683182--94683346
39
4.3
39
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0
278
24
29
23
23
1.99
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7.0
39
93
0
458
25
29
23
21
1.99
94694591--94694665
4
18.2
4
70
10
53
5
26
4
64
1.33
94694592--94694697
50
2.1
51
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5
162
7
26
5
60
1.46
94694690--94694720
14
2.2
14
94
0
53
22
16
0
61
1.34
94696836--94697071
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2.7
87
85
5
262
29
19
16
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1.95
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146
1.9
146
95
0
490
30
20
16
32
1.95
94697098--94697738
175
3.7
175
94
0
1097
28
19
18
33
1.95
94697110--94697697
87
6.7
88
66
17
355
28
19
18
33
1.95
94697098--94697738
349
1.8
349
93
0
1122
28
19
18
33
1.95
94710095--94710142
11
4.5
10
78
14
51
79
2
2
16
0.93
94710095--94710142
22
2.2
21
82
13
62
79
2
2
16
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94712513--94712579
34
2.0
34
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0
125
16
25
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40
1.90
94713742--94713790
10
5.0
9
83
11
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69
2
6
22
1.21
94713804--94713841
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2.8
13
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4
58
44
13
0
42
1.43
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15
2.1
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51
26
0
0
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2.1
23
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0
0
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0
0
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13
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0
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1.13
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18
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0
10
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1.12
94724745--94724779
9
4.0
9
88
7
54
71
0
11
17
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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