Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10735380--10735604
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274
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27
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25
2.00
10735380--10735604
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1.9
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25
2.00
10737435--10737474
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2.0
20
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21
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2.00
10743695--10743919
79
2.8
78
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256
24
26
21
26
2.00
10743695--10743919
119
1.9
120
82
8
289
24
26
21
26
2.00
10745754--10745793
20
2.0
20
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8
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4.5
46
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29
21
28
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
200
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2.5
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10824784--10825459
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51
31
34
27
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1.82
10827504--10827550
18
2.6
18
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31
34
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1.82
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2.7
33
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26
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4.5
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13
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5.7
40
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244
25
26
21
25
2.00
10832310--10832533
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2.8
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256
25
26
21
25
2.00
10835085--10835214
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3.3
42
74
10
121
50
12
5
31
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.61
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2.7
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8
33
1.65
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65
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1.28
10835235--10835297
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12
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14
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1.25
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1.98
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194
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28
33
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10897209--10897253
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2.8
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2
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22
25
18
1.96
10910144--10910197
20
2.5
21
82
8
65
42
27
18
11
1.84
10911460--10911501
22
2.0
21
85
4
57
21
26
42
9
1.83
10922583--10922625
21
2.0
21
86
0
59
44
6
11
37
1.68
10936709--10936738
11
2.7
11
100
0
60
30
23
10
36
1.87
10938346--10938370
13
1.9
13
100
0
50
24
0
4
72
1.02
10940920--10940978
5
10.8
5
79
13
55
71
3
3
22
1.16
10940920--10940978
12
5.4
10
80
11
55
71
3
3
22
1.16
10940914--10940978
15
3.9
16
77
18
62
70
3
3
23
1.15
10952114--10952168
20
2.8
20
83
5
67
67
1
5
25
1.22
10954254--10954306
25
2.2
25
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74
49
1
0
49
1.12
10954263--10954310
25
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100
0
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43
0
0
56
0.99
10967014--10967064
23
2.2
23
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13
70
31
15
9
43
1.80
10969083--10969123
18
2.2
19
87
12
59
7
4
7
80
1.02
10981709--10981749
21
2.0
21
85
9
57
60
0
17
21
1.35
10986507--10986535
14
2.0
15
93
6
51
82
0
0
17
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10986522--10986571
18
2.7
18
79
11
57
64
2
2
32
1.16
10986580--10986604
12
2.1
12
100
0
50
76
0
8
16
1.02
10986610--10986702
10
9.0
10
67
21
50
64
2
4
29
1.24
10986589--10986633
21
2.2
20
88
4
63
68
2
6
22
1.24
10986647--10986696
9
5.6
9
77
15
50
74
2
2
22
1.03
10986647--10986699
28
1.9
27
88
3
79
73
1
1
22
1.03
10986873--10986965
9
10.4
9
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19
61
32
0
1
66
0.99
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27
2.6
27
78
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74
36
0
0
63
0.94
10986893--10986941
20
2.5
21
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15
61
40
0
0
59
0.98
10986872--10986958
46
1.9
45
83
6
113
33
0
1
65
1.00
10986873--10986941
19
3.7
19
75
12
72
36
0
0
63
0.94
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54
2.1
54
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3
129
29
7
32
30
1.84
10999636--10999695
29
2.1
29
100
0
120
35
16
20
28
1.94
11000544--11000568
7
3.6
7
100
0
50
28
0
40
32
1.57
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14
4.6
14
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7
51
38
1
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29
1.66
11000941--11000971
12
2.7
11
90
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29
0
0
70
0.87
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30
2.1
30
93
0
106
32
3
6
58
1.40
11001134--11001166
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
11015022--11015057
17
2.1
17
100
0
72
5
19
16
58
1.58
11015075--11015130
11
4.9
11
73
14
51
32
0
0
67
0.91
11017238--11017272
13
2.7
13
100
0
70
40
17
14
28
1.88
11019116--11019177
18
3.3
19
86
13
92
66
4
3
25
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11019444--11019483
18
2.2
18
86
0
53
2
40
30
27
1.70
11021951--11021997
17
2.8
16
78
15
51
55
6
0
38
1.26
11022276--11022307
3
11.0
3
93
6
57
68
0
0
31
0.90
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27
6.3
27
82
2
173
28
22
8
41
1.82
11025855--11026003
81
1.8
81
82
5
194
28
21
7
42
1.79
11025995--11026158
27
6.1
27
76
11
95
40
21
9
28
1.84
11026055--11026213
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2.9
55
79
1
158
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18
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31
1.76
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2.5
20
93
0
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93
5
224
27
21
23
27
1.99
11027162--11027297
26
5.3
26
87
3
190
27
21
23
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332