Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  212  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70413981--70414070
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16
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2
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2.0
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1.77
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19
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43
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20
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0
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1.59
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2.0
21
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2.0
21
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20
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2.8
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1.48
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2.0
21
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7
0
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23
4
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65
1.37
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15
2.4
16
86
8
60
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
33
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3.5
39
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2
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23
46
1.61
70496152--70496261
39
2.8
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12
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16
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42
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2.1
21
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2
2
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2.1
15
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6.8
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9
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17
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2
1
25
1.12
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9
11.2
9
70
13
55
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2
2
27
1.11
70524106--70524205
18
5.6
18
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13
64
69
2
2
27
1.11
70524106--70524205
37
2.8
36
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5
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69
2
2
27
1.11
70524153--70524233
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24
77
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2
1
29
1.12
70524283--70524325
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2.2
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69
4
4
20
1.25
70524276--70524342
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3.2
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2
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2.3
19
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4
52
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2
0
69
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.00
70525868--70525921
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1
0
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1.11
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120
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1
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29
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2.0
125
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22
1.97
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15
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4.4
40
80
6
196
27
27
22
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70601743--70601918
40
4.4
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6
225
26
27
22
23
1.99
70601743--70601918
79
2.2
79
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241
26
27
22
23
1.99
70603963--70604023
26
2.4
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11
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1
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22
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21
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1.94
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26
14
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24
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0
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23
5
34
1.79
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76
1.9
76
94
0
258
38
12
14
34
1.84
70612836--70612860
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
70614576--70614617
21
2.1
20
83
16
52
73
4
0
21
1.01
70614848--70614936
44
2.0
46
86
8
130
34
5
23
35
1.79
70615123--70615185
12
5.4
12
76
17
55
47
3
0
49
1.17
70615454--70615499
21
2.2
20
82
14
58
54
8
0
36
1.32
70623226--70623257
13
2.5
13
100
0
64
21
31
0
46
1.52
70625555--70625734
40
4.6
40
80
8
183
25
23
26
24
2.00
70625555--70625734
80
2.3
79
84
5
222
25
23
26
24
2.00
70627597--70627809
41
5.2
41
78
7
184
20
18
23
37
1.94
70630462--70630551
46
2.0
46
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0
171
45
11
21
22
1.82
70637151--70637289
55
2.5
55
75
4
145
29
32
24
13
1.94
70641396--70641422
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
70643318--70643769
47
9.6
47
94
0
778
28
30
8
32
1.87
70645033--70645211
85
2.1
85
98
0
349
26
27
8
37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70646661--70646769
57
1.9
58
86
1
157
28
27
19
24
1.98
70646981--70647252
40
6.8
40
92
0
427
25
29
22
23
1.99
70648666--70649119
47
9.6
47
93
1
755
29
29
8
33
1.87
70650382--70650560
85
2.1
85
98
0
349
26
27
8
37
1.85
70656476--70656536
16
3.8
16
72
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52
44
1
3
50
1.28
70659106--70659148
22
2.0
21
90
4
68
65
2
6
25
1.30
70660136--70660175
20
2.0
20
95
0
71
5
27
25
42
1.75
70672798--70672989
70
2.8
69
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4
251
33
26
15
25
1.95
70679549--70679615
22
3.0
22
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56
2
1
38
1.24
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2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
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47
9.7
47
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2
764
28
30
8
32
1.87
70684235--70684674
238
1.9
237
94
1
774
28
30
8
32
1.87
70687670--70687841
93
1.8
93
92
2
292
29
29
20
21
1.98
70687663--70687838
46
3.8
46
77
14
191
30
28
19
21
1.98
70687671--70687857
46
4.0
44
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16
130
29
28
19
21
1.98
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30
5.8
30
90
2
280
25
48
3
23
1.67
70688855--70689029
60
2.9
60
94
0
314
25
48
3
23
1.67
70689111--70689161
27
1.9
26
96
4
93
15
0
41
43
1.47
70689535--70689663
25
5.5
23
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16
70
34
3
2
58
1.29
70689538--70689582
20
2.2
20
84
7
56
35
4
0
60
1.17
70689610--70689670
25
2.5
24
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12
79
34
3
0
62
1.12
70689687--70689773
25
3.7
25
80
7
85
32
6
5
55
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70689689--70689778
23
3.9
24
75
12
73
33
6
5
54
1.50
70689898--70689945
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
70689898--70689949
8
6.5
8
82
8
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30
1
1
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1.14
70698222--70698384
66
2.6
62
84
8
188
30
14
22
31
1.94
70698222--70698520
68
4.8
64
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17
213
28
14
23
34
1.94
70698282--70698505
114
1.9
114
84
9
299
25
14
22
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1.92
70698402--70698607
68
2.9
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26
16
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27
18
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1.96
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8.7
78
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14
537
29
17
18
34
1.94
70698610--70699302
316
2.2
314
90
5
1094
29
18
19
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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