Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  252  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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124
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1
3
45
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
18
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21
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26
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28
28
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2.2
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1.9
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3
190
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3
5
50
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
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28
19
1.88
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22
1.92
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90
2.1
90
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2
214
40
12
22
24
1.88
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12
100
0
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22
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20
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1.37
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2.8
28
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38
1.81
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30
1.97
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44
8.7
44
64
8
155
21
23
20
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84258990--84259374
87
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513
21
24
20
34
1.97
84258990--84259374
176
2.2
174
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2
513
21
24
20
34
1.97
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9
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9
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22
22
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23
3.1
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5
21
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26
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29
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69
37
21
0
41
1.53
84278367--84278394
14
2.0
14
100
0
56
28
0
35
35
1.58
84279535--84279579
21
2.1
21
95
0
81
57
17
0
24
1.40
84279853--84279911
17
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17
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35
0
5
59
1.20
84282800--84282906
32
3.4
32
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3
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3
2
48
1.35
84282825--84282909
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1
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49
1.41
84282819--84282930
32
3.6
30
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4
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39
3
2
54
1.32
84282902--84282953
18
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18
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2
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32
0
0
67
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1.32
84284412--84284501
39
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41
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38
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84294318--84294421
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2.0
51
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16
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16
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0
20
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1.49
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49
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47
12
9
29
1.74
84300937--84301003
32
2.1
32
94
0
116
49
14
8
26
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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39
12
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40
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29
1.9
28
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27
10
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1.56
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22
0
2
75
0.94
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18
2.7
18
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3
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14
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19
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10.5
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8
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18
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1.98
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5.2
132
94
0
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28
25
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1.98
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3.7
131
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18
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22
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84347156--84347225
32
2.2
32
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0
104
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4
22
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2.0
45
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2
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24
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0
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68
0
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84358702--84358759
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0
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84359296--84359408
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3.3
34
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12
106
54
1
0
42
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84359296--84359489
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66
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52
1
0
46
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32
3.2
32
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56
1
0
41
1.10
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2.1
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0
0
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0
0
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43
2.0
43
95
0
158
26
27
20
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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