Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  315  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103266306--103266532
51
4.5
50
87
1
337
33
14
22
30
1.94
103266306--103266532
101
2.2
101
95
0
400
33
14
22
30
1.94
103274285--103274452
51
3.3
51
92
0
282
34
14
23
27
1.94
103276510--103276588
3
26.0
3
74
2
68
30
6
3
59
1.40
103276638--103276694
29
1.9
30
82
3
71
17
8
0
73
1.07
103276749--103276793
21
2.1
21
100
0
90
13
6
11
68
1.37
103276751--103276790
12
3.2
12
86
6
53
15
2
7
75
1.14
103276754--103276804
21
2.4
21
90
3
75
19
5
7
66
1.38
103276957--103277049
3
30.7
3
78
6
98
32
6
1
60
1.29
103276960--103277049
15
5.9
15
81
6
110
32
6
1
60
1.30
103277141--103277172
13
2.5
13
89
0
55
18
0
0
81
0.70
103283414--103283443
2
15.0
2
100
0
60
0
0
50
50
1.00
103283838--103283867
7
4.3
7
91
0
51
23
0
0
76
0.78
103287245--103287271
7
3.9
7
100
0
54
25
0
14
59
1.36
103289693--103289726
17
2.1
17
88
5
52
64
5
0
29
1.17
103289680--103289832
68
2.2
69
90
1
245
51
3
9
35
1.50
103289680--103289836
69
2.3
68
91
1
251
50
3
8
36
1.50
103293037--103293139
29
3.6
30
74
12
90
35
23
16
24
1.95
103296935--103297008
31
2.6
27
75
20
71
41
2
4
51
1.35
103296943--103297000
31
1.9
30
86
10
82
41
1
5
51
1.34
103299019--103299043
3
8.3
3
100
0
50
0
32
32
36
1.58
103306865--103306931
34
2.0
34
88
5
100
41
1
16
40
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103307024--103307275
126
2.0
125
88
0
369
39
18
14
27
1.90
103309298--103309381
24
3.2
26
73
15
82
64
4
1
29
1.22
103309300--103309417
54
2.2
54
92
1
193
63
3
1
31
1.21
103313230--103313499
74
3.6
72
74
14
208
61
4
5
28
1.36
103313230--103313509
51
5.6
49
74
12
182
61
3
5
28
1.36
103313281--103313512
25
9.2
25
72
15
142
62
4
4
28
1.34
103313645--103313781
50
2.7
50
86
2
195
58
2
7
31
1.40
103315900--103315926
5
5.4
5
100
0
54
77
0
0
22
0.76
103317056--103317098
21
2.0
22
81
4
52
48
2
0
48
1.14
103320855--103320967
56
2.0
54
80
13
122
43
0
4
51
1.28
103321081--103321173
44
2.1
44
90
8
143
36
23
3
36
1.71
103336431--103336476
23
2.1
21
84
11
58
54
15
17
13
1.71
103350226--103350274
25
2.0
25
84
8
64
34
2
4
59
1.28
103352376--103352433
19
3.1
19
76
16
57
27
17
22
32
1.96
103353653--103353698
24
1.9
24
86
0
65
39
6
8
45
1.61
103360786--103360988
52
3.9
52
81
7
200
30
26
17
25
1.97
103360786--103360988
104
1.9
105
81
6
243
30
26
17
25
1.97
103364415--103364477
22
2.8
22
92
2
99
34
15
6
42
1.73
103364973--103365026
26
2.0
26
82
10
63
61
7
0
31
1.24
103365693--103365730
13
2.9
13
96
0
67
34
7
18
39
1.80
103366764--103366814
20
2.6
20
81
3
59
52
1
3
41
1.31
103369559--103369621
28
2.2
29
86
8
85
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103371651--103371842
100
1.9
100
86
0
276
34
15
13
37
1.86
103374614--103374695
41
2.0
41
97
0
155
34
8
12
45
1.72
103379129--103379239
47
2.4
47
83
6
145
35
22
16
26
1.95
103383036--103383073
18
2.1
19
85
14
53
71
2
0
26
1.00
103385907--103385965
31
1.9
31
89
0
91
22
6
23
47
1.75
103391041--103391110
35
2.0
35
83
10
90
48
2
2
45
1.32
103398939--103399000
23
2.8
23
90
4
92
58
3
4
33
1.36
103398960--103399009
23
2.2
23
85
0
64
58
6
8
28
1.51
103400210--103400244
12
2.8
13
86
8
54
51
0
2
45
1.16
103402721--103402775
16
3.4
16
76
16
51
67
3
0
29
1.08
103406187--103406227
16
2.4
17
81
18
50
24
0
7
68
1.15
103412591--103412659
35
2.0
35
100
0
138
39
34
14
11
1.82
103418829--103418867
19
2.1
19
85
0
51
58
7
12
20
1.58
103424526--103424572
24
1.9
24
86
4
67
31
0
4
63
1.13
103434933--103435103
54
3.2
53
86
7
249
33
14
26
25
1.94
103434933--103435139
52
3.9
53
85
7
219
33
15
25
25
1.95
103437022--103437055
16
2.1
17
88
5
52
61
5
23
8
1.47
103438749--103439016
132
2.0
132
97
0
509
32
10
22
35
1.88
103450927--103450955
2
14.5
2
100
0
58
51
0
48
0
1.00
103451158--103451219
29
2.1
29
81
0
70
41
0
3
54
1.16
103452967--103453025
19
2.8
21
80
15
68
62
1
30
5
1.26
103456889--103456957
3
22.7
3
76
8
59
1
33
1
63
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103461540--103461578
9
4.8
8
84
15
53
84
0
15
0
0.62
103461540--103461578
17
2.4
17
91
4
62
84
0
15
0
0.62
103476504--103476538
18
2.1
16
89
10
52
51
11
0
37
1.38
103489708--103489765
30
1.9
30
86
6
82
51
3
17
27
1.61
103491715--103491964
125
2.0
125
100
0
500
30
20
25
24
1.98
103502713--103502785
31
2.5
29
82
10
78
46
8
13
31
1.73
103506003--103506071
31
2.2
31
97
0
129
53
2
17
26
1.57
103506268--103506303
8
4.2
8
86
13
54
47
0
0
52
1.00
103506271--103506328
18
3.3
18
85
9
75
37
0
0
62
0.96
103510206--103510319
58
1.9
59
84
8
153
36
7
14
41
1.74
103515093--103515149
22
2.6
22
83
5
71
68
12
5
14
1.37
103523941--103523974
16
2.1
16
88
0
50
41
8
0
50
1.34
103527486--103527638
60
2.6
58
80
6
175
24
16
20
38
1.92
103527591--103527667
31
2.5
31
75
10
84
23
14
20
41
1.89
103532808--103532835
12
2.3
12
100
0
56
0
7
0
92
0.37
103542494--103542519
12
2.2
12
100
0
52
23
34
7
34
1.83
103568092--103568136
23
2.0
22
91
4
72
24
6
8
60
1.51
103569621--103569657
14
2.5
15
86
8
58
2
0
18
78
0.87
103569954--103570026
29
2.6
28
82
16
89
46
4
1
47
1.30
103569970--103570043
29
2.4
30
84
6
87
44
8
2
44
1.47
103571424--103571461
19
2.1
19
85
9
53
21
2
7
68
1.28
103574583--103574624
14
2.8
15
78
10
50
40
4
7
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103580073--103580118
19
2.4
19
88
3
74
28
10
13
47
1.76
103581618--103581702
43
2.0
43
90
0
134
35
15
4
44
1.67
103582295--103582334
21
1.9
21
94
0
71
20
12
12
55
1.69
103588158--103588328
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
103588153--103588325
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
103588748--103588807
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
103595731--103595802
29
2.5
29
100
0
144
36
13
16
33
1.89
103596969--103597006
3
13.0
3
84
15
53
31
2
0
65
1.06
103598156--103598252
40
2.5
38
81
8
117
15
24
29
29
1.96
103599521--103599590
33
2.2
32
85
10
97
41
15
8
34
1.78
103601538--103601562
13
1.9
13
100
0
50
16
4
0
80
0.87
103615447--103615492
21
2.1
21
84
11
58
34
4
0
60
1.16
103617581--103617644
32
2.0
32
100
0
128
40
0
28
31
1.57
103636472--103636536
30
2.2
30
97
2
123
33
9
3
53
1.48
103642791--103642863
34
2.1
34
85
9
96
43
2
1
52
1.24
103646321--103646403
42
2.0
42
82
0
103
22
31
19
26
1.98
103648828--103648862
17
2.1
17
89
5
54
31
0
2
65
1.07
103649596--103649635
19
2.1
19
95
0
71
15
12
32
40
1.84
103656651--103656750
50
2.0
50
94
0
173
44
20
3
33
1.67
103662408--103662463
24
2.3
23
85
11
69
75
3
10
10
1.17
103665877--103665927
18
2.8
18
74
14
50
23
3
5
66
1.30
103666874--103667262
132
3.0
132
85
3
516
33
15
20
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103669387--103669495
31
3.5
31
88
5
159
26
18
30
24
1.98
103669526--103669734
47
4.5
46
81
6
192
28
13
26
30
1.94
103669526--103669708
47
3.8
48
84
6
194
28
13
27
31
1.94
103669615--103669778
42
3.7
43
80
9
163
29
13
26
29
1.94
103674636--103674687
21
2.5
22
81
9
72
57
1
7
32
1.38
103676661--103676709
13
3.8
13
75
20
50
40
30
6
22
1.78
103680951--103680998
23
2.1
23
100
0
96
41
4
12
41
1.62
103682662--103682710
18
2.6
19
78
12
57
55
2
0
42
1.11
103682683--103682717
16
2.1
17
89
5
54
57
0
0
42
0.99
103689533--103689584
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332