Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  306  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100909149--100909218
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2.5
28
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137
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22
20
33
1.97
100919936--100920086
44
3.4
43
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9
135
23
22
20
33
1.97
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0
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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37
17
0
45
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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78
1.09
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11.8
6
83
4
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8
5
7
78
1.07
101021198--101021281
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12
71
15
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4
7
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1.04
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17
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0
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29
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101059769--101059843
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3.3
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2
20
1.53
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3
19
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0
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79
11
450
31
15
18
34
1.92
101071530--101071579
18
2.7
19
93
3
84
62
32
0
6
1.20
101072841--101072883
23
1.9
22
90
4
68
30
0
9
60
1.28
101072921--101072995
30
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30
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10
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34
2
6
56
1.40
101072967--101073022
24
2.3
25
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14
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3
8
57
1.47
101073035--101073085
11
4.5
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3
54
1.47
101073183--101073222
20
2.1
18
86
9
53
35
0
5
60
1.19
101073272--101073317
24
1.9
24
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0
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101073446--101073515
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18
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0
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1.36
101073623--101073678
25
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24
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3
42
1.65
101075842--101076028
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1
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1.95
101076611--101076693
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2.0
41
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0
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49
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1.79
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1.41
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24
2.3
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30
3
8
57
1.47
101080287--101080326
20
2.1
18
86
9
53
35
0
5
60
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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8
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45
1.55
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35
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18
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30
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0
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1.36
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25
2.3
24
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14
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37
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3
42
1.65
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21
2.0
22
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4
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29
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0
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1.42
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2.1
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0
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10
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1.85
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19
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0
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18
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3.0
131
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2
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19
18
27
1.95
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6
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1.20
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0
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1.8
118
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0
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18
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1.97
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0
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19
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101112201--101112265
22
3.1
20
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18
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75
0
4
20
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0
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1.20
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51
11
0
37
1.38
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2.7
33
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119
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28
1.92
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10
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12
50
81
0
15
3
0.80
101129453--101129489
14
2.7
15
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12
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78
0
16
5
0.93
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2.0
20
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1.26
101131420--101131557
69
2.0
69
88
0
204
30
15
17
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101132351--101132391
21
1.9
22
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57
4
12
7
75
1.16
101133583--101133639
27
2.0
29
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73
24
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63
1.39
101135624--101135708
26
3.4
25
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60
8
7
24
1.51
101135639--101135728
26
3.6
24
73
22
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60
6
5
27
1.45
101136908--101136937
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0
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0
0
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157
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18
18
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1.95
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2.1
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557
29
20
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3.6
21
98
0
143
25
31
6
36
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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