Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86629314--86629468
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1.9
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81
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2
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1.21
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58
0
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1.18
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0
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2.5
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2.3
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4.5
140
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2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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72
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2.0
121
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1.93
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1.8
271
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743
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1.93
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3.0
78
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4.6
74
85
5
391
33
15
18
32
1.93
86655712--86656052
150
2.3
147
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5
407
33
15
18
32
1.93
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1.8
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204
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20
18
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270
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18
16
33
1.93
86656079--86656441
79
4.5
77
76
10
278
30
16
17
34
1.93
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2.0
25
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2.0
20
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2.0
28
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19
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17
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2.1
25
96
0
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5
36
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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4.0
40
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4
203
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27
1.99
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20
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26
1.99
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29
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21
27
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1.99
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78
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20
2.0
22
86
8
63
30
25
0
44
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86745991--86746030
17
2.3
17
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1.65
86749671--86749732
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3.8
17
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1
1
40
1.19
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1
1
41
1.20
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3.5
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75
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60
55
0
1
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0
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0
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1.61
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129
50
3
5
41
1.41
86763142--86763192
26
2.0
25
84
7
66
62
5
1
29
1.29
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42
2.0
42
100
0
170
61
7
7
24
1.47
86767574--86767621
2
23.5
2
82
4
51
47
4
4
43
1.41
86768118--86768191
35
2.2
34
83
9
91
55
6
1
36
1.35
86771432--86771484
22
2.3
24
80
9
65
67
1
11
18
1.30
86775649--86775728
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2.7
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1
1
37
1.13
86775914--86775944
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
86775943--86775967
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
86776182--86776242
27
2.3
27
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31
27
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32
1.86
86776929--86776968
21
2.0
21
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1.71
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1.94
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26
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27
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18
1.94
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25
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25
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1.90
86783322--86783359
19
2.0
19
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0
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31
26
10
31
1.90
86783435--86783460
7
3.7
7
100
0
52
84
0
0
15
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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65
20
24
16
38
1.92
86785482--86785525
19
2.3
19
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0
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20
20
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1.91
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6
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6
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0
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50
16
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0
1.46
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40
6.2
40
78
12
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22
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25
1.99
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79
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0
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22
22
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26
1.99
86790430--86790653
119
1.9
120
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4
310
22
22
28
25
1.99
86790470--86790676
79
2.6
79
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23
22
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26
1.99
86792780--86793003
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17
27
27
1.98
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16.1
44
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0
1081
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1.95
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2.0
19
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0
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34
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1.85
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0
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0
0
15
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19
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25
0
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1.55
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46
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13
199
20
18
29
30
1.97
86827270--86827439
93
1.8
93
94
0
304
21
20
28
29
1.98
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41
2.9
41
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10
121
20
18
28
32
1.96
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7.2
6
90
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0
15
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1.10
86846869--86846910
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6.4
7
89
10
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76
0
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9
1.02
86849688--86849745
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22
1
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1.41
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6
99
0
415
66
0
0
32
0.95
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2.3
40
83
7
109
29
30
15
25
1.95
86868493--86868531
4
9.8
4
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0
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2
2
23
1.10
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3
14.7
3
100
0
88
34
0
31
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86870194--86870379
51
3.6
51
80
1
219
27
19
18
33
1.95
86870587--86870894
138
2.2
137
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5
433
32
24
14
28
1.94
86870858--86871215
44
8.0
44
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13
144
31
21
16
31
1.95
86870950--86871213
140
1.9
140
80
4
309
31
19
15
32
1.94
86871419--86871451
17
2.0
17
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1.66
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0
15
0
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0.63
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3.3
82
84
2
334
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0
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69
3
0
26
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86887528--86887590
32
1.9
34
81
12
78
33
6
11
49
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332