Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  208  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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14
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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1.94
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52
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2
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28
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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27
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36
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1.98
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19
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1.97
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166
7.5
166
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1381
33
19
19
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69207572--69207746
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33
18
19
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1.96
69206807--69208068
331
3.7
330
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1402
33
19
19
27
1.96
69207733--69208066
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34
21
17
25
1.96
69207733--69208066
180
1.9
176
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456
34
21
17
25
1.96
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18
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4
20
4
1.23
69219302--69219359
21
2.8
20
89
5
89
3
1
24
70
1.12
69224722--69224974
70
3.6
70
83
4
280
19
17
25
37
1.94
69226965--69227105
43
3.3
43
82
7
180
30
26
17
25
1.97
69232310--69232352
12
3.6
12
82
17
54
27
0
2
69
1.00
69236607--69236658
25
2.1
25
92
0
86
34
9
15
40
1.80
69238077--69238123
20
2.3
20
85
0
67
12
27
21
38
1.90
69246190--69246242
20
2.7
20
78
0
61
45
18
7
28
1.77
69248396--69248437
19
2.2
19
95
0
75
11
30
19
38
1.88
69252275--69252474
42
4.7
42
88
2
258
29
23
17
30
1.97
69262767--69262854
40
2.3
38
82
7
113
39
32
10
17
1.83
69269404--69269545
39
3.5
40
85
6
180
25
25
26
22
2.00
69272107--69272202
40
2.5
38
83
6
138
38
36
10
14
1.81
69275514--69275545
13
2.4
14
94
5
57
53
9
0
37
1.34
69280732--69280970
70
3.3
72
82
9
290
37
0
13
48
1.49
69280760--69280919
35
4.6
35
85
5
182
35
1
15
48
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69280819--69280951
44
3.1
44
93
2
225
36
1
13
48
1.52
69280690--69280928
9
26.4
9
73
9
175
35
0
15
47
1.52
69281095--69281154
16
3.9
16
72
14
54
63
3
0
33
1.11
69281655--69281700
23
2.0
23
95
0
83
41
13
2
43
1.55
69281871--69281916
6
7.7
6
80
9
58
0
67
0
32
0.91
69281857--69281912
20
2.8
20
81
10
62
0
62
0
37
0.95
69281865--69281916
16
3.0
16
75
24
52
0
67
0
32
0.91
69281884--69281916
8
4.1
8
92
0
57
0
66
0
33
0.92
69282256--69282323
25
2.7
25
90
0
100
26
19
42
11
1.85
69282438--69282483
24
1.9
24
90
0
74
34
4
15
45
1.66
69285250--69285350
40
2.5
40
81
0
121
27
16
16
38
1.91
69287205--69287244
20
2.0
20
95
4
73
37
5
5
52
1.45
69289429--69289485
22
2.6
21
82
15
71
40
28
3
28
1.73
69289819--69289881
28
2.2
29
88
8
94
26
0
25
47
1.52
69289820--69289880
21
2.9
21
82
2
59
27
0
22
49
1.50
69290174--69290366
41
4.7
41
80
3
183
24
19
22
34
1.97
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8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
69295769--69295793
13
1.9
13
100
0
50
8
32
0
60
1.26
69304251--69304421
93
1.8
93
93
0
297
28
29
21
21
1.98
69304243--69304418
46
3.8
46
80
10
205
28
28
21
21
1.98
69305668--69306069
47
8.4
47
90
4
570
29
30
8
32
1.87
69305986--69306061
22
3.3
22
64
10
62
28
31
10
28
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69305683--69306064
196
1.9
196
94
0
674
28
30
8
31
1.88
69310071--69310186
59
2.0
59
89
0
178
38
12
9
38
1.76
69315000--69315068
31
2.3
31
87
2
104
23
24
33
18
1.97
69321847--69321903
15
3.7
15
68
9
51
54
17
3
24
1.59
69324751--69325040
144
2.0
144
98
0
562
25
22
20
31
1.98
69332299--69332329
16
1.9
16
93
0
53
41
9
0
48
1.36
69334003--69334042
21
1.9
21
94
0
71
47
15
5
32
1.66
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51
80
3
156
26
18
28
26
1.98
69367924--69367957
17
2.0
17
94
0
59
52
2
5
38
1.41
69369063--69369121
10
5.9
9
75
21
55
37
0
1
61
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332