Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  244  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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4.5
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27
1.69
Indices
Period
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Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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102
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16
26
30
1.97
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16
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180
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1.9
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177
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28
20
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.97
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1.95
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20
29
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1.99
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1.98
81442315--81442374
28
2.2
27
82
5
68
30
31
10
28
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81442384--81442417
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2
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47
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2
1.32
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2.1
16
94
0
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3
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1.43
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14
23
1.94
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17
24
30
1.97
81462073--81462242
51
3.4
51
76
11
186
27
20
22
28
1.99
81462017--81462400
101
3.8
100
83
2
439
27
17
23
30
1.97
81462124--81462449
100
3.3
100
83
2
388
26
17
25
30
1.98
81462661--81462690
16
1.9
15
93
6
51
43
0
23
33
1.54
81472355--81472398
18
2.3
19
81
18
56
31
4
6
56
1.46
81472362--81472401
18
2.2
18
91
8
64
30
2
5
62
1.29
81474073--81474253
41
4.4
41
83
4
197
19
19
23
37
1.95
81474081--81474231
82
1.8
82
88
0
230
19
19
23
37
1.94
81474072--81474251
82
2.2
81
81
6
227
19
18
23
37
1.94
81476087--81476302
113
1.9
113
85
0
297
30
19
9
40
1.83
81476860--81477342
50
9.6
50
78
5
454
31
25
16
26
1.97
81476860--81477291
101
4.3
100
74
7
374
30
25
17
26
1.97
81476858--81477291
151
2.9
151
94
1
737
30
25
17
26
1.97
81480242--81480284
15
2.9
15
89
3
61
23
6
6
62
1.45
81484134--81484171
17
2.2
17
90
0
58
13
7
2
76
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81488875--81488944
36
1.9
36
100
0
140
22
34
31
11
1.90
81489628--81489846
46
4.7
47
76
9
182
22
28
19
29
1.98
81497146--81497374
46
4.9
48
83
6
258
22
28
19
29
1.98
81497148--81497416
46
5.7
47
81
9
250
23
28
18
28
1.98
81497145--81497416
94
2.9
91
79
10
300
22
28
19
29
1.98
81497148--81497407
140
1.9
141
86
5
375
23
28
19
29
1.98
81501728--81501774
23
2.0
24
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8
60
38
23
10
27
1.88
81509611--81509640
16
1.9
15
93
6
51
6
16
0
76
0.99
81517443--81517591
73
2.0
73
100
0
298
24
41
4
29
1.73
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40
2.1
40
87
8
120
28
15
28
28
1.96
81521300--81521638
155
2.2
154
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1
471
30
19
22
28
1.98
81522274--81522328
28
1.9
29
88
3
85
47
23
3
25
1.68
81525035--81525063
11
2.6
11
100
0
58
65
10
17
6
1.44
81525188--81525252
32
2.0
32
100
0
130
38
24
6
30
1.80
81525696--81525780
44
1.9
44
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4
109
24
2
34
38
1.68
81525828--81525894
29
2.3
28
78
12
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20
0
35
43
1.53
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80
2.0
80
86
2
221
23
0
37
38
1.60
81526109--81526162
16
3.8
16
68
31
50
37
9
3
50
1.52
81526176--81526221
22
2.1
22
84
8
58
60
2
2
34
1.21
81526176--81526221
23
2.0
22
83
4
56
60
2
2
34
1.21
81526272--81526305
16
2.2
16
89
5
52
23
0
2
73
0.97
81528976--81529109
64
2.1
64
97
0
250
38
11
2
46
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81529157--81529225
24
2.9
24
86
0
93
30
15
7
46
1.73
81529401--81529456
15
3.8
15
80
20
73
46
0
0
53
1.00
81529567--81529917
9
38.9
9
73
11
218
46
14
1
37
1.56
81529586--81529917
62
5.4
61
77
9
230
46
14
1
37
1.53
81529669--81529723
17
3.2
16
87
12
74
49
12
0
38
1.41
81529571--81529743
44
3.9
43
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6
204
46
15
2
35
1.60
81529714--81529953
43
5.8
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13
161
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14
1
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17
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2
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1.46
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24
3.0
25
79
11
77
46
14
1
37
1.53
81529541--81529982
165
2.6
166
85
4
548
45
14
2
37
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332