Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   

This is table  23  of  332  ( 39766 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6633279--6633313
9
3.8
9
92
3
52
0
14
5
80
0.89
6637240--6637283
17
2.6
17
96
0
79
31
13
13
40
1.84
6638173--6638220
22
2.2
22
82
14
55
62
6
6
25
1.42
6639196--6639318
56
2.2
56
92
1
212
33
15
17
33
1.92
6643809--6643847
14
2.7
14
84
4
51
38
5
0
56
1.22
6657502--6657903
35
11.5
35
87
1
486
30
12
25
31
1.93
6667130--6667176
24
2.0
24
100
0
94
57
8
4
29
1.48
6671345--6671382
17
2.2
17
90
0
58
18
34
36
10
1.85
6671832--6671870
6
6.5
6
87
0
60
30
12
17
38
1.88
6672032--6672074
21
2.1
21
83
8
54
25
9
6
58
1.54
6674533--6674714
46
4.0
46
88
1
249
21
23
14
40
1.90
6683590--6683707
43
2.7
43
89
3
175
33
22
14
29
1.93
6687355--6687385
16
1.9
16
93
0
53
74
9
6
9
1.23
6689918--6689942
12
2.1
12
100
0
50
52
0
16
32
1.44
6691426--6691924
44
11.6
44
67
8
292
19
24
20
35
1.96
6691425--6691928
87
5.9
87
88
5
733
19
25
20
35
1.96
6691449--6691928
165
2.8
167
90
4
707
20
25
19
35
1.96
6700153--6700181
9
3.3
9
95
4
51
41
10
24
24
1.86
6704314--6704338
12
2.1
12
100
0
50
52
0
16
32
1.44
6704500--6704526
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
6705575--6705619
22
2.0
22
83
8
56
71
2
0
26
0.98
6708497--6708536
18
2.4
16
87
8
53
62
0
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6711801--6711840
15
2.6
16
85
14
50
67
0
2
30
1.04
6711989--6712133
3
47.3
3
73
13
91
60
3
5
31
1.36
6712011--6712133
35
3.5
34
76
15
99
61
4
4
29
1.35
6712011--6712100
14
6.4
14
70
15
62
64
4
3
27
1.29
6713985--6714206
44
5.0
43
68
7
151
31
19
20
28
1.97
6713956--6714206
88
2.9
88
87
1
360
31
19
21
28
1.97
6714219--6714724
86
5.8
85
71
10
301
26
22
20
30
1.98
6714213--6714724
44
11.8
44
71
5
335
26
22
20
30
1.98
6714213--6714728
130
4.0
130
88
1
692
26
22
20
30
1.98
6721384--6721494
3
36.3
3
73
8
73
58
1
6
33
1.34
6721424--6721461
17
2.3
16
90
4
58
68
0
0
31
0.90
6726940--6727012
34
2.1
34
94
0
128
47
0
9
42
1.36
6727014--6727068
26
2.1
26
86
10
76
38
1
10
49
1.49
6734217--6734265
8
6.0
8
83
4
62
55
0
0
44
0.99
6735008--6735040
9
3.7
9
95
0
57
24
0
3
72
0.98
6735085--6735124
18
2.2
18
86
4
53
57
0
2
40
1.12
6735099--6735381
71
4.0
70
74
11
252
43
3
2
50
1.32
6735309--6735347
17
2.3
17
95
0
69
56
0
0
43
0.99
6735349--6735387
19
2.0
20
85
5
53
38
5
0
56
1.22
6737684--6737714
11
2.7
11
95
5
53
54
6
0
38
1.26
6737769--6737831
21
2.9
22
76
4
65
63
1
7
26
1.31
6738179--6738426
3
84.3
3
67
22
100
60
1
7
30
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6738198--6738344
11
13.3
11
71
23
96
62
0
4
31
1.21
6738199--6738427
122
1.9
124
81
9
290
60
1
6
31
1.31
6738251--6738417
11
15.2
11
68
22
54
61
1
7
29
1.34
6739706--6739751
18
2.5
19
82
10
60
13
0
43
43
1.43
6740681--6740788
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
6754854--6754936
37
2.2
37
97
0
157
40
15
12
31
1.84
6757747--6757824
38
2.1
38
97
0
147
29
8
10
51
1.66
6761879--6761955
31
2.6
30
78
10
86
40
10
11
37
1.76
6773781--6773818
4
9.5
4
100
0
76
0
26
23
50
1.50
6777153--6777382
114
2.0
114
98
0
442
40
18
20
20
1.92
6787573--6788763
476
2.5
468
87
4
1665
39
17
14
28
1.89
6788812--6789019
70
3.0
70
91
2
321
40
14
16
27
1.88
6805355--6805453
31
3.3
31
71
8
96
50
1
5
43
1.30
6807350--6807399
25
2.0
25
96
0
91
14
12
26
48
1.78
6812411--6812451
3
13.7
3
84
0
55
7
31
60
0
1.24
6815118--6815164
22
2.1
22
88
0
67
23
21
25
29
1.99
6816146--6816185
6
6.7
6
100
0
80
50
15
17
17
1.79
6817120--6817177
8
7.2
8
75
13
57
43
1
0
55
1.10
6817135--6817182
16
3.2
16
72
22
50
47
0
0
52
1.00
6826745--6826792
24
2.0
24
83
0
60
20
27
22
29
1.99
6828732--6828784
18
2.8
19
77
13
56
49
3
3
43
1.38
6830214--6830271
22
2.7
22
75
2
55
17
22
15
44
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6832410--6832446
16
2.3
17
81
13
51
37
0
2
59
1.12
6832570--6832635
6
10.7
6
77
6
51
69
0
0
30
0.88
6832570--6832664
50
1.9
50
97
0
181
63
0
1
35
1.02
6832829--6832862
10
3.3
10
87
4
50
73
2
0
23
0.97
6839779--6839829
19
2.7
19
82
8
61
45
0
5
49
1.26
6839825--6839855
15
2.1
15
93
0
53
48
0
3
48
1.17
6839977--6840010
17
1.9
18
88
5
52
55
0
0
44
0.99
6844935--6844969
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93
6845080--6845113
17
2.0
17
88
11
52
32
0
5
61
1.20
6846584--6846666
38
2.2
38
82
6
98
22
24
26
26
2.00
6846594--6846666
38
1.9
38
86
5
103
23
23
26
27
2.00
6848605--6848656
25
2.0
27
85
7
72
42
3
1
51
1.31
6849233--6849313
40
2.0
40
85
0
108
62
9
2
24
1.38
6849299--6849356
20
2.9
19
71
14
55
62
0
3
34
1.12
6854497--6854544
3
16.3
3
91
4
80
64
0
2
33
1.05
6860013--6860094
40
2.0
40
97
0
155
52
10
3
32
1.54
6864554--6864593
21
1.9
21
100
0
80
37
12
30
20
1.89
6869048--6869101
26
2.1
26
82
6
65
40
18
1
38
1.61
6870044--6870099
17
3.1
18
87
7
69
48
5
26
19
1.70
6870050--6870102
20
2.8
19
88
8
74
47
5
30
16
1.70
6870263--6870294
11
2.8
12
86
13
50
34
0
0
65
0.93
6870433--6870473
11
3.7
11
80
0
55
60
9
9
19
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6870425--6870485
22
2.8
21
73
7
59
65
8
8
18
1.44
6870677--6870760
35
2.4
34
79
15
91
45
3
28
22
1.69
6872855--6872895
20
2.0
20
100
0
82
14
9
14
60
1.57
6880899--6881053
41
3.8
41
76
10
158
30
15
23
30
1.95
6882158--6882568
115
3.6
116
82
2
436
31
14
18
35
1.91
6882215--6882568
115
3.1
115
83
2
451
31
14
18
35
1.91
6882472--6882669
101
2.0
101
83
2
254
31
17
17
33
1.93
6882831--6882883
23
2.3
23
83
6
63
16
37
0
45
1.48
6883521--6883558
17
2.2
17
95
0
67
10
31
13
44
1.77
6886904--6886931
13
2.2
13
100
0
56
17
42
7
32
1.77
6887019--6887147
9
14.3
9
77
6
100
45
15
0
37
1.52
6887004--6887147
45
3.0
45
80
16
180
46
14
0
38
1.50
6887041--6887131
27
3.4
27
81
6
130
47
14
0
38
1.44
6887019--6887153
54
2.5
54
88
0
216
45
14
1
38
1.55
6893012--6893054
19
2.3
19
83
0
50
25
13
4
55
1.58
6893097--6893142
21
2.2
21
84
7
58
34
6
8
50
1.59
6894293--6894407
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
6894293--6894407
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
6896025--6896134
26
4.2
26
93
4
154
36
21
4
37
1.74
6896528--6896853
3
108.7
3
70
15
153
27
6
3
62
1.35
6896535--6896591
28
2.0
29
89
3
89
26
7
1
64
1.28
6896535--6896690
29
5.5
28
75
13
108
24
4
5
66
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6896619--6896789
56
3.2
54
77
12
156
30
5
2
60
1.33
6896719--6896772
23
2.3
23
81
6
56
38
7
0
53
1.29
6898264--6898292
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
6899090--6899226
43
3.2
43
80
9
122
24
17
22
35
1.95
6899116--6899226
43
2.6
44
81
9
131
25
18
22
33
1.97
6899713--6899846
61
2.3
58
84
6
171
40
2
3
53
1.31
6899713--6899865
61
2.6
60
79
13
147
40
1
5
52
1.35
6899939--6899973
14
2.5
14
100
0
70
48
0
34
17
1.47
6903529--6903672
53
2.7
53
83
2
164
33
9
16
40
1.81
6904473--6904678
96
2.2
96
83
7
251
43
17
8
30
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332