Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  109233746

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  332  ( 39766 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1399886--1399919
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18
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2.0
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2.0
20
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26
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48
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26
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2.4
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1
409
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1.97
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2.4
31
89
8
109
25
29
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1467887--1468015
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2.5
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1470430--1470540
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0
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0
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108
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17
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275
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20
28
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26
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0
89
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0
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18
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2.5
24
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2
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45
12
14
27
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.95
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27
2.5
24
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15
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33
21
24
20
1.97
1529011--1529230
25
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25
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23
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1.95
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2.1
16
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0
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0
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19
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1.98
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0
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0
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50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1590166--1590224
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1.68
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23
2.5
23
97
0
105
22
14
29
33
1.93
1622431--1622539
45
2.4
46
81
3
132
33
13
22
30
1.93
1622701--1622788
29
3.0
29
78
6
106
23
22
27
26
2.00
1625470--1625506
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
1626503--1626559
29
2.0
29
86
6
80
21
17
26
35
1.95
1626542--1626608
30
2.2
30
91
0
107
20
16
32
29
1.95
1628417--1628445
12
2.3
13
94
5
51
20
0
3
75
0.94
1629124--1629184
7
8.6
7
78
3
68
16
0
37
45
1.47
1629127--1629181
21
2.5
22
88
2
85
14
0
36
49
1.44
1629668--1629704
18
2.0
19
85
15
51
24
0
2
72
0.97
1631827--1631878
19
2.7
19
82
11
63
48
3
1
46
1.31
1636974--1637018
21
2.0
22
83
8
56
35
17
4
42
1.70
1643962--1644024
30
2.1
30
96
0
117
39
11
12
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1649634--1649675
6
7.0
6
100
0
84
50
0
0
50
1.00
1651489--1651546
30
1.9
30
86
6
82
34
10
12
43
1.76
1652074--1652125
23
2.2
22
83
13
59
32
0
1
65
1.04
1658257--1658321
31
2.1
31
100
0
130
41
16
10
30
1.83
1659863--1659907
14
3.4
14
87
6
58
44
2
0
53
1.13
1659871--1659909
2
20.0
2
84
5
53
46
2
0
51
1.14
1665067--1665099
17
2.0
17
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5
50
72
0
0
27
0.85
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18
2.5
20
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23
55
28
0
2
69
1.00
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7
3.9
7
100
0
54
14
0
0
85
0.61
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11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
1682421--1682587
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10
160
32
18
10
37
1.86
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31
2.3
31
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9
74
27
13
13
44
1.82
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9
4.4
9
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11
66
69
0
0
30
0.89
1706867--1706910
10
4.5
10
88
5
72
70
0
0
29
0.88
1706867--1706917
20
2.5
20
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6
59
66
1
1
29
1.13
1706913--1706995
22
3.9
22
73
19
77
53
0
3
43
1.18
1711977--1712035
29
2.0
29
83
9
75
50
13
5
30
1.63
1715650--1715683
14
2.3
14
90
10
50
41
0
2
55
1.15
1718133--1718241
53
2.1
53
91
3
175
37
16
5
40
1.72
1733056--1733130
36
2.1
36
97
0
141
42
8
6
42
1.60
1733374--1733406
2
16.5
2
93
0
57
48
3
0
48
1.17
1735910--1736021
39
3.0
38
77
18
103
53
0
2
42
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1735920--1736022
26
4.2
26
68
17
76
56
0
1
40
1.17
1745931--1745981
25
2.0
25
96
0
93
27
5
11
54
1.59
1746397--1746432
3
12.0
3
93
0
63
30
2
66
0
1.06
1757024--1757072
17
2.8
18
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17
52
67
0
0
32
0.91
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11
2.6
11
94
5
51
16
6
3
73
1.18
1760835--1760882
25
1.9
25
86
0
69
37
20
22
18
1.94
1760835--1760888
25
2.2
25
82
0
63
38
20
24
16
1.92
1762560--1762798
50
4.6
50
84
4
273
21
29
23
25
1.99
1762559--1762805
100
2.4
105
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344
21
29
23
25
1.99
1762903--1762934
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332