Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  108673976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  10  of  333  ( 39894 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2524630--2525309
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229
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1.9
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83
10
77
22
11
22
44
1.85
2551793--2552014
109
2.0
112
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324
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2.1
22
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0
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2597761--2597807
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2.1
32
100
0
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6
15
39
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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39
3.4
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20
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28
1.99
2625456--2625785
131
2.6
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28
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19
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2.1
24
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17
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0
2
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28
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2.0
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0
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19
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121
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51
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98
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21
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45
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11
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27
20
20
31
1.97
2675300--2675638
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3.8
86
72
11
258
26
20
22
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.9
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7
223
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12
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30
1.92
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116
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15
27
29
1.96
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3.1
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11
27
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1.92
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53.5
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13
502
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25
29
1.97
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24.7
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28
17
25
29
1.97
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5.3
253
92
4
2059
27
15
27
29
1.96
2687396--2688210
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4.9
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10
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15
26
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1.96
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22
29
1.98
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1.98
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1.97
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25
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1.96
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3
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15
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29
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4.2
53
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10
162
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6
12
50
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2733372--2733752
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6
0
44
1.29
2766666--2766728
32
2.0
32
96
0
117
44
6
0
49
1.28
2767052--2767091
11
3.6
11
79
0
53
20
12
10
57
1.63
2767315--2767348
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
2770429--2770525
22
4.5
22
77
2
97
43
22
23
10
1.84
2770429--2770525
43
2.2
44
79
3
115
43
22
23
10
1.84
2776732--2776765
17
2.0
17
100
0
68
41
17
11
29
1.85
2779131--2779177
22
2.1
22
84
11
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42
0
6
51
1.27
2782540--2782574
16
2.2
16
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0
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0
28
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27
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64
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0
29
1.17
2811486--2811525
12
3.6
12
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19
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72
12
0
15
1.12
2811475--2811525
21
2.4
22
87
9
70
72
11
0
15
1.12
2814530--2814569
21
2.0
20
90
5
62
37
17
17
27
1.92
2820760--2820785
9
2.9
9
100
0
52
69
7
0
23
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2821154--2821196
21
2.0
21
86
0
59
48
4
0
46
1.22
2823025--2823056
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
2823151--2823392
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
2823151--2823400
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
2830145--2830176
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
2830271--2830512
50
4.7
50
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4
306
26
24
28
19
1.99
2830271--2830520
100
2.4
103
88
6
373
26
24
28
20
1.99
2835235--2835278
19
2.3
19
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54
2
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1.44
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2.1
24
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22
26
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1.96
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3.4
25
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19
24
18
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31
3.0
31
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4
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38
20
17
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1.93
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2.5
15
100
0
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0
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1.32
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2.8
12
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4
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0
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1.27
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16
2.1
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15
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2
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9
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1.9
24
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177
2.2
176
91
0
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19
23
18
38
1.93
2857449--2857888
177
2.5
175
85
4
612
20
23
17
38
1.93
2860310--2860353
22
2.1
22
83
8
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54
2
0
43
1.12
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89
2.0
89
100
0
364
35
10
9
43
1.73
2867075--2867115
15
2.5
17
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11
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0
0
34
0.93
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19
2.4
18
82
7
54
40
0
8
51
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2867945--2867996
19
2.7
20
85
8
63
32
0
9
57
1.31
2868308--2868366
31
1.9
31
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6
84
37
6
13
42
1.71
2879825--2879888
29
2.2
29
91
2
103
35
26
15
21
1.94
2880718--2880742
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6
100
0
50
16
0
16
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38
0
1
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1.9
19
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0
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2
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0
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15
2.1
15
100
0
64
18
21
6
53
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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